Merge lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes into lp:~kovalp/siesta/siesta

Proposed by Nick Papior
Status: Merged
Merged at revision: 623
Proposed branch: lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes
Merge into: lp:~kovalp/siesta/siesta
Diff against target: 3313 lines (+891/-546)
21 files modified
Src/Makefile (+30/-40)
Src/elpa2_kernels.f90 (+3/-2)
Src/m_fastconv_dims.F90 (+1/-8)
Src/m_mpi_stop.F90 (+2/-5)
Src/m_plot_1d_arr3d.F90 (+1/-2)
Src/m_poisson_fdf.F90 (+8/-4)
Src/m_poisson_obc_comm.F90 (+4/-3)
Src/m_poisson_obc_fastconv.F90 (+10/-4)
Src/m_poisson_obc_fastconv_r2c.F90 (+5/-5)
Util/COOP/Makefile (+78/-44)
Util/Denchar/Src/Makefile (+78/-44)
Util/Gen-basis/Makefile (+76/-44)
Util/Grimme/Makefile (+76/-44)
Util/Helpers/Makefile (+76/-44)
Util/STM/ol-stm/Src/Makefile (+76/-44)
Util/SpPivot/Makefile (+76/-44)
Util/TS/TBtrans/Makefile (+62/-32)
Util/TS/ts2ts/Makefile (+76/-44)
Util/TS/tshs2tshs/Makefile (+76/-44)
Util/VCA/Makefile (+76/-44)
version.info (+1/-1)
To merge this branch: bzr merge lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes
Reviewer Review Type Date Requested Status
Petr Koval Approve
Review via email: mp+311468@code.launchpad.net

Description of the change

There were a few missing items that you have missed.

Please, read the commit log and see what I have changed. I have runned your example with the committed code without problems. But perhaps you should run it again.

To post a comment you must log in.
Revision history for this message
Petr Koval (kovalp) :
review: Approve
Revision history for this message
Petr Koval (kovalp) wrote :

It works as it should, thank you. I will try later to update other
Makefiles as well. Thank you.

Peter

On Tue, Nov 22, 2016 at 9:34 AM, <email address hidden> wrote:

> The proposal to merge lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes into
> lp:~kovalp/siesta/siesta has been updated.
>
> Status: Needs review => Merged
>
> For more details, see:
> https://code.launchpad.net/~nickpapior/siesta/kovalp-fixes/+merge/311468
> --
> You are reviewing the proposed merge of lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes
> into lp:~kovalp/siesta/siesta.
>

Preview Diff

[H/L] Next/Prev Comment, [J/K] Next/Prev File, [N/P] Next/Prev Hunk
=== modified file 'Src/Makefile'
--- Src/Makefile 2016-11-17 13:54:18 +0000
+++ Src/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -675,9 +675,7 @@
675compute_rhog.o: siesta_options.o sparse_matrices.o675compute_rhog.o: siesta_options.o sparse_matrices.o
676conjgr.o: precision.o676conjgr.o: precision.o
677conjgr_old.o: precision.o677conjgr_old.o: precision.o
678coor.o: alloc.o parallel.o precision.o siesta_geom.o sys.o units.o zmatrix.o \678coor.o: alloc.o parallel.o precision.o siesta_geom.o sys.o units.o zmatrix.o
679 m_poisson_fdf.o
680
681coxmol.o: files.o periodic_table.o precision.o679coxmol.o: files.o periodic_table.o precision.o
682create_Sparsity_SC.o: class_Sparsity.o geom_helper.o intrinsic_missing.o680create_Sparsity_SC.o: class_Sparsity.o geom_helper.o intrinsic_missing.o
683create_Sparsity_Union.o: class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o681create_Sparsity_Union.o: class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
@@ -692,31 +690,14 @@
692detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o690detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
693dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o691dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
694dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o692dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
695dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o \693dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
696 m_poisson_fdf.o m_poisson_switch.o
697
698m_poisson_fdf.o : $(FDF) m_char.o
699
700m_poisson_switch.o: poison.o m_poisson_obc_fastconv.o
701
702m_poisson_obc_fastconv.o: m_plot_1d_arr3d.o m_fastconv_dims.o \
703 m_poisson_obc_fastconv_r2c.o m_mpi_stop.o
704
705m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_plot_1d_arr3d.o m_fastconv_dims.o \
706 m_poisson_obc_comm.o cellsubs.o
707
708m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o siesta_geom.o atmfuncs.o \
709 $(FDF) parallel.o m_mpi_stop.o
710
711m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
712
713dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o694dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
714dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o695dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
715dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o696dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
716dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o697dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
717dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o698dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
718dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o699dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
719dhscf.o: vmat.o700dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
720diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o701diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
721diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o702diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
722diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o703diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -797,9 +778,9 @@
797initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o778initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
798initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o779initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
799initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o780initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
800initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o781initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
801initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o782initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
802initparallel.o: spatial.o sys.o m_poisson_fdf.o783initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
803io.o: sys.o784io.o: sys.o
804iocg.o: files.o precision.o sys.o785iocg.o: files.o precision.o sys.o
805iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o786iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -860,6 +841,7 @@
860m_eo.o: precision.o841m_eo.o: precision.o
861m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o842m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
862m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o843m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
844m_fastconv_dims.o: precision.o
863m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o845m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
864m_fire.o: parallel.o precision.o846m_fire.o: parallel.o precision.o
865m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o847m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -950,6 +932,15 @@
950m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o932m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
951m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o933m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
952m_planewavematrixvar.o: precision.o934m_planewavematrixvar.o: precision.o
935m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
936m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
937m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
938m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
939m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
940m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
941m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
942m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
943m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
953m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o944m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
954m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o945m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
955m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o946m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -1312,12 +1303,12 @@
1312siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o1303siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
1313siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o1304siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
1314siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o1305siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
1315siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o1306siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
1316siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o1307siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
1317siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o1308siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
1318siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o1309siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
1319siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o1310siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
1320siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o1311siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
1321siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o1312siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
1322siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o1313siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
1323siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o1314siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -1348,11 +1339,10 @@
1348state_init.o: m_ts_tri_init.o normalize_dm.o overlap.o parallel.o1339state_init.o: m_ts_tri_init.o normalize_dm.o overlap.o parallel.o
1349state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o1340state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
1350state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o1341state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
1351struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o \1342struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
1352 m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o1343struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
1353struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o1344struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
1354struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o1345struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
1355struct_init.o: units.o zmatrix.o
1356sys.o: parallel.o1346sys.o: parallel.o
1357timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o1347timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
1358timer.o: timer_tree.o1348timer.o: timer_tree.o
13591349
=== modified file 'Src/elpa2_kernels.f90'
--- Src/elpa2_kernels.f90 2016-10-27 08:15:19 +0000
+++ Src/elpa2_kernels.f90 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -18,7 +18,7 @@
18 integer, parameter :: dprec = kind(1.d0)18 integer, parameter :: dprec = kind(1.d0)
1919
20 integer, intent(in) :: nb, nq, ldq, ldh20 integer, intent(in) :: nb, nq, ldq, ldh
21 real(dprec), intent(inout) :: q(ldq,*) 21 real(dprec), intent(inout) :: q(ldq,*)
22 real(dprec), intent(in) :: hh(ldh,*)22 real(dprec), intent(in) :: hh(ldh,*)
2323
24 real(dprec) s24 real(dprec) s
@@ -51,7 +51,7 @@
51 call hh_trafo_kernel_4(q(i,1),hh, nb, ldq, ldh, s)51 call hh_trafo_kernel_4(q(i,1),hh, nb, ldq, ldh, s)
52 endif52 endif
5353
54end subroutine54end
5555
56! --------------------------------------------------------------------------------------------------56! --------------------------------------------------------------------------------------------------
57! The following kernels perform the Householder transformation on Q for 12/8/4 rows.57! The following kernels perform the Householder transformation on Q for 12/8/4 rows.
@@ -572,4 +572,5 @@
572 enddo572 enddo
573573
574end574end
575
575! --------------------------------------------------------------------------------------------------576! --------------------------------------------------------------------------------------------------
576577
=== modified file 'Src/m_fastconv_dims.F90'
--- Src/m_fastconv_dims.F90 2016-11-16 09:58:12 +0000
+++ Src/m_fastconv_dims.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -9,12 +9,6 @@
9 use precision, only : dp9 use precision, only : dp
10 10
11 implicit none11 implicit none
12
13 complex(dp), private, allocatable :: coul_r2c(:,:,:)
14 integer(8), private :: p_r2c, p_c2r
15 real(dp), allocatable, private :: io_dreal(:,:,:)
16 complex(dp), allocatable, private :: dens_r2c(:,:,:)
17 integer, private :: icall = 0
1812
19contains13contains
2014
@@ -22,7 +16,7 @@
22! Computes 6 numbers out of limits for a general 1d convolution16! Computes 6 numbers out of limits for a general 1d convolution
23!17!
24subroutine conv_lims(s1,f1,s2,f2,s3,f3,n1,n2,ncaux,saux,salloc_aux,falloc_aux)18subroutine conv_lims(s1,f1,s2,f2,s3,f3,n1,n2,ncaux,saux,salloc_aux,falloc_aux)
25 implicit none19
26 ! external20 ! external
27 integer, intent(in) :: s1, f1, s2, f2, s3, f3 ! start/finish indices for functions in a convolution f3 = f1*f221 integer, intent(in) :: s1, f1, s2, f2, s3, f3 ! start/finish indices for functions in a convolution f3 = f1*f2
28 integer, intent(out) :: n1,n2,ncaux,saux,salloc_aux,falloc_aux22 integer, intent(out) :: n1,n2,ncaux,saux,salloc_aux,falloc_aux
@@ -40,7 +34,6 @@
40! Calculate the limits for FFTW r2c transform34! Calculate the limits for FFTW r2c transform
41!35!
42subroutine conv_calc_r2c_dims(nff_in_1, nff_in_2, nff_complex, nff_real)36subroutine conv_calc_r2c_dims(nff_in_1, nff_in_2, nff_complex, nff_real)
43 implicit none
44 integer, intent(in) :: nff_in_1, nff_in_237 integer, intent(in) :: nff_in_1, nff_in_2
45 integer, intent(out) :: nff_complex, nff_real38 integer, intent(out) :: nff_complex, nff_real
46 nff_real = (nff_in_1+nff_in_2)39 nff_real = (nff_in_1+nff_in_2)
4740
=== modified file 'Src/m_mpi_stop.F90'
--- Src/m_mpi_stop.F90 2016-11-16 13:02:00 +0000
+++ Src/m_mpi_stop.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -6,15 +6,12 @@
6! See Docs/Contributors.txt for a list of contributors.6! See Docs/Contributors.txt for a list of contributors.
7!7!
8module m_mpi_stop8module m_mpi_stop
9
9 implicit none10 implicit none
1011
11contains12contains
1213
13!
14!
15!
16subroutine mpi_stop(cfile, iline, ierr)14subroutine mpi_stop(cfile, iline, ierr)
17 implicit none
18 character(*), intent(in) :: cfile15 character(*), intent(in) :: cfile
19 integer, intent(in) :: iline16 integer, intent(in) :: iline
20 integer, intent(in) :: ierr17 integer, intent(in) :: ierr
2118
=== modified file 'Src/m_plot_1d_arr3d.F90'
--- Src/m_plot_1d_arr3d.F90 2016-10-18 13:15:38 +0000
+++ Src/m_plot_1d_arr3d.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -6,6 +6,7 @@
6! See Docs/Contributors.txt for a list of contributors.6! See Docs/Contributors.txt for a list of contributors.
7!7!
8module m_plot_1d_arr3d8module m_plot_1d_arr3d
9
9 implicit none10 implicit none
10 11
11contains12contains
@@ -15,7 +16,6 @@
15! 16!
16subroutine plot_1d_arr3d(nnn, arr, ialong,i1,i2, fname)17subroutine plot_1d_arr3d(nnn, arr, ialong,i1,i2, fname)
17 use precision, only : grid_p18 use precision, only : grid_p
18 implicit none
19 !! external19 !! external
20 integer, intent(in) :: nnn(:) ! 3 dimensions of array arr(*)20 integer, intent(in) :: nnn(:) ! 3 dimensions of array arr(*)
21 real(grid_p), intent(in) :: arr(*) ! data array21 real(grid_p), intent(in) :: arr(*) ! data array
@@ -67,7 +67,6 @@
67!! 67!!
68!!68!!
69integer function get_free_handle()69integer function get_free_handle()
70 implicit none
71 ! internal70 ! internal
72 integer :: ihandle71 integer :: ihandle
73 logical :: logical_opened72 logical :: logical_opened
7473
=== modified file 'Src/m_poisson_fdf.F90'
--- Src/m_poisson_fdf.F90 2016-10-25 15:07:07 +0000
+++ Src/m_poisson_fdf.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -12,7 +12,7 @@
12 12
13 implicit none 13 implicit none
14 14
15 character(80) :: PoissonMethod = ''15 character(32) :: PoissonMethod = ''
16 real(dp) :: PoissonPBCCutoff0D = -99916 real(dp) :: PoissonPBCCutoff0D = -999
17 17
18contains18contains
@@ -23,16 +23,20 @@
23subroutine poisson_fdf()23subroutine poisson_fdf()
24 use fdf, only : fdf_get24 use fdf, only : fdf_get
25 use m_char, only : ucase25 use m_char, only : ucase
26 implicit none
2726
28 ! internal
29
30 !27 !
31 ! Choice of Poison solver 28 ! Choice of Poison solver
32 !29 !
33 30
34 PoissonMethod = fdf_get('Poisson.Method', 'PBC')31 PoissonMethod = fdf_get('Poisson.Method', 'PBC')
35 PoissonMethod = ucase(PoissonMethod)32 PoissonMethod = ucase(PoissonMethod)
33 select case (PoissonMethod)
34 case('PBC', 'OBC.FASTCONV')
35 case default
36 write(*,*) 'The Poisson.Method is not recognized, &
37 &should be one of PBC/OBC.FastConv'
38 call die('The Poisson.Method is not recognized')
39 end select
36 40
37 PoissonPBCCutoff0D = fdf_get('Poisson.PBC.Cutoff0D', 1.0_dp)41 PoissonPBCCutoff0D = fdf_get('Poisson.PBC.Cutoff0D', 1.0_dp)
3842
3943
=== modified file 'Src/m_poisson_obc_comm.F90'
--- Src/m_poisson_obc_comm.F90 2016-11-16 13:02:00 +0000
+++ Src/m_poisson_obc_comm.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -72,7 +72,9 @@
72 box(ix,2) = max(xa(ix,ia)+rc, box(ix,2))72 box(ix,2) = max(xa(ix,ia)+rc, box(ix,2))
73 enddo 73 enddo
74 enddo74 enddo
75 75
76 deallocate(sp2rcut)
77
76 box_c(1:3) = (box(:,2)+box(:,1))/278 box_c(1:3) = (box(:,2)+box(:,1))/2
77 79
78! write(6,'(a)') 'box'80! write(6,'(a)') 'box'
@@ -95,8 +97,6 @@
95! write(6,*) origin97! write(6,*) origin
96! write(6,'(3g12.5)') xa98! write(6,'(3g12.5)') xa
97 endif99 endif
98
99 if(allocated(sp2rcut)) deallocate(sp2rcut)
100 100
101end subroutine ! obc_coord_shift101end subroutine ! obc_coord_shift
102102
@@ -184,6 +184,7 @@
184 184
185 j3min = n2s3(node)185 j3min = n2s3(node)
186 j3max = n2s3(node+1)-1186 j3max = n2s3(node+1)-1
187 deallocate(n2n3,n2s3)
187188
188 nnn(1:3) = [j1max-j1min+1,j2max-j2min+1,j3max-j3min+1]189 nnn(1:3) = [j1max-j1min+1,j2max-j2min+1,j3max-j3min+1]
189 if(any(nnn/=[n1,n2,n3])) then190 if(any(nnn/=[n1,n2,n3])) then
190191
=== modified file 'Src/m_poisson_obc_fastconv.F90'
--- Src/m_poisson_obc_fastconv.F90 2016-11-16 13:02:00 +0000
+++ Src/m_poisson_obc_fastconv.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -106,15 +106,21 @@
106 allocate(v_gth(np_gth)) 106 allocate(v_gth(np_gth))
107 call poisson_obc_fastconv_r2c( cell, mesh(1),mesh(2),mesh(3),mesh, &107 call poisson_obc_fastconv_r2c( cell, mesh(1),mesh(2),mesh(3),mesh, &
108 rho_gth, U, v_gth, STRESS)108 rho_gth, U, v_gth, STRESS)
109 109
110! write(6,*) 'sum(v_gth)', sum(v_gth)110! write(6,*) 'sum(v_gth)', sum(v_gth)
111111
112 endif112 endif
113113 deallocate(rho_gth)
114
114 !! only potential must be scattered 115 !! only potential must be scattered
115 call MPI_Scatterv(v_gth, n2c, n2d, MPI_grid_real, v,np, MPI_grid_real, root, comm, ierr)116 call MPI_Scatterv(v_gth, n2c, n2d, MPI_grid_real, v,np, MPI_grid_real, root, comm, ierr)
116 call mpi_stop(__FILE__, __LINE__, ierr) 117 call mpi_stop(__FILE__, __LINE__, ierr)
117118 if(root==node) then
119 deallocate(v_gth)
120 end if
121
122 deallocate(n2c, n2d)
123
118 endif124 endif
119 125
120end subroutine !poisson_obc_fastconv126end subroutine !poisson_obc_fastconv
121127
=== modified file 'Src/m_poisson_obc_fastconv_r2c.F90'
--- Src/m_poisson_obc_fastconv_r2c.F90 2016-11-17 14:11:46 +0000
+++ Src/m_poisson_obc_fastconv_r2c.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -165,10 +165,10 @@
165 do i3=1,nr(3)165 do i3=1,nr(3)
166 do i2=1,nr(2)166 do i2=1,nr(2)
167 do i1=1,nc(1)167 do i1=1,nc(1)
168 z1 = cmplx(coul_r2c((i1-1)*2+1,i2,i3), coul_r2c((i1-1)*2+2,i2,i3), 8)168 z1 = cmplx(coul_r2c((i1-1)*2+1,i2,i3), coul_r2c((i1-1)*2+2,i2,i3), dp)
169 z2 = cmplx(dens_fft((i1-1)*2+1,i2,i3), dens_fft((i1-1)*2+2,i2,i3), 8)169 z2 = cmplx(dens_fft((i1-1)*2+1,i2,i3), dens_fft((i1-1)*2+2,i2,i3), dp)
170 z3 = z1*z2170 z3 = z1*z2
171 dens_fft((i1-1)*2+1,i2,i3) = real(z3,8) ! Product density and Coulomb interaction in momentum space171 dens_fft((i1-1)*2+1,i2,i3) = real(z3,dp) ! Product density and Coulomb interaction in momentum space
172 dens_fft((i1-1)*2+2,i2,i3) = aimag(z3) ! Product density and Coulomb interaction in momentum space172 dens_fft((i1-1)*2+2,i2,i3) = aimag(z3) ! Product density and Coulomb interaction in momentum space
173 enddo173 enddo
174 enddo 174 enddo
@@ -220,7 +220,7 @@
220!220!
221!221!
222subroutine comp_coul_r2c_inplace(ic, nn, dcell, n, coul_r2c)222subroutine comp_coul_r2c_inplace(ic, nn, dcell, n, coul_r2c)
223 use precision, only : dp223 use precision, only : dp, i8b
224 use cellsubs, only : volcel ! Finds unit cell volume224 use cellsubs, only : volcel ! Finds unit cell volume
225 implicit none225 implicit none
226 !! external226 !! external
@@ -230,7 +230,7 @@
230 integer, intent(in) :: n(:) ! 3230 integer, intent(in) :: n(:) ! 3
231 real(dp), intent(inout) :: coul_r2c(:,:,:)231 real(dp), intent(inout) :: coul_r2c(:,:,:)
232 !! internal232 !! internal
233 integer(8) :: p_r2c233 integer(i8b) :: p_r2c
234234
235 integer :: i1, i2, i3235 integer :: i1, i2, i3
236 real(dp) :: rp(3), dcell2(3,3), dvol236 real(dp) :: rp(3), dcell2(3,3), dvol
237237
=== modified file 'Util/COOP/Makefile'
--- Util/COOP/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/COOP/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -108,7 +108,7 @@
108bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o108bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
109bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys_local.o109bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys_local.o
110bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys_local.o110bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys_local.o
111cart2frac.o: sys_local.o111cart2frac.o: precision.o sys_local.o
112cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys_local.o112cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys_local.o
113cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys_local.o113cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys_local.o
114cell_broyden_optim.o: units.o zmatrix.o114cell_broyden_optim.o: units.o zmatrix.o
@@ -121,6 +121,8 @@
121cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o121cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
122cgvc_zmatrix.o: sys_local.o units.o zmatrix.o122cgvc_zmatrix.o: sys_local.o units.o zmatrix.o
123cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys_local.o123cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys_local.o
124changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
125changebasis.o: sparse_matrices.o sys_local.o wavefunctions.o
124chemical.o: parallel.o precision.o sys_local.o126chemical.o: parallel.o precision.o sys_local.o
125chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o127chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o
126chkdim.o: sys_local.o128chkdim.o: sys_local.o
@@ -173,17 +175,17 @@
173denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o175denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
174denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o176denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
175densematrix.o: alloc.o precision.o177densematrix.o: alloc.o precision.o
176detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o178detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
177dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o179dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
178dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o180dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o
179dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o181dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
180dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o182dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
181dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o183dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
182dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o184dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
183dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o185dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
184dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o186dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
185dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys_local.o187dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
186dhscf.o: units.o vmat.o188dhscf.o: siesta_options.o sys_local.o units.o vmat.o
187diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o189diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o
188diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o190diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o
189diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o191diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o
@@ -211,7 +213,7 @@
211domain_decom.o: sparse_matrices.o sys_local.o213domain_decom.o: sparse_matrices.o sys_local.o
212doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys_local.o214doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys_local.o
213dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o215dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
214dynamics.o: precision.o sys_local.o units.o216dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys_local.o units.o
215egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o217egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
216egandd.o: onmod.o precision.o sys_local.o218egandd.o: onmod.o precision.o sys_local.o
217eggbox.o: parallel.o precision.o219eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -220,6 +222,11 @@
220elpa2.o: elpa1.o222elpa2.o: elpa1.o
221ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o223ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
222ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o224ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
225evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
226evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys_local.o
227evolg.o: wavefunctions.o
228evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
229evolk.o: sys_local.o wavefunctions.o
223extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o230extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
224extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o231extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
225extrapolon.o: parallel.o precision.o sys_local.o232extrapolon.o: parallel.o precision.o sys_local.o
@@ -260,9 +267,9 @@
260initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o267initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
261initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o268initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
262initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o269initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
263initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o270initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
264initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o271initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
265initparallel.o: spatial.o sys_local.o272initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys_local.o
266io.o: sys_local.o273io.o: sys_local.o
267iocg.o: files.o precision.o sys_local.o274iocg.o: files.o precision.o sys_local.o
268iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o275iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o
@@ -325,7 +332,10 @@
325m_efield.o: siesta_geom.o sys_local.o units.o332m_efield.o: siesta_geom.o sys_local.o units.o
326m_energies.o: precision.o333m_energies.o: precision.o
327m_eo.o: precision.o334m_eo.o: precision.o
335m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
336m_evolve.o: sys_local.o
328m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o337m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
338m_fastconv_dims.o: precision.o
329m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys_local.o339m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys_local.o
330m_fire.o: parallel.o precision.o340m_fire.o: parallel.o precision.o
331m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o341m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -347,10 +357,14 @@
347m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys_local.o357m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys_local.o
348m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o358m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
349m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys_local.o359m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys_local.o
360m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
361m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys_local.o
362m_initwf.o: wavefunctions.o
350m_integrate.o: precision.o363m_integrate.o: precision.o
351m_io.o: sys_local.o364m_io.o: sys_local.o
352m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o365m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
353m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o366m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
367m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
354m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o368m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
355m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o369m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
356m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o370m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -358,9 +372,13 @@
358m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o372m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o
359m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o373m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
360m_iostruct.o: siesta_geom.o sys_local.o units.o374m_iostruct.o: siesta_geom.o sys_local.o units.o
375m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
376m_iotddft.o: wavefunctions.o
361m_kinetic.o: precision.o377m_kinetic.o: precision.o
362m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o378m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
379m_matdiag.o: precision.o
363m_matio.o: alloc.o parallel.o380m_matio.o: alloc.o parallel.o
381m_matswinvers.o: precision.o
364m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys_local.o382m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys_local.o
365m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o383m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
366m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o384m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -409,6 +427,15 @@
409m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o427m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
410m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o428m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
411m_planewavematrixvar.o: precision.o429m_planewavematrixvar.o: precision.o
430m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
431m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
432m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
433m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys_local.o
434m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
435m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys_local.o
436m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
437m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys_local.o
438m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys_local.o
412m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o439m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
413m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys_local.o440m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys_local.o
414m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o441m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -424,7 +451,8 @@
424m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o451m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
425m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o452m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
426m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o453m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
427m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o454m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
455m_sparsity_handling.o: precision.o
428m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys_local.o units.o456m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys_local.o units.o
429m_stress.o: precision.o457m_stress.o: precision.o
430m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o458m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -538,9 +566,10 @@
538m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o566m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
539m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o567m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
540m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o568m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
541m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o569m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
542m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o570m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
543m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o571m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
572m_ts_pivot.o: precision.o
544m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o573m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
545m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o574m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
546m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o575m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -685,8 +714,8 @@
685rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys_local.o714rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys_local.o
686rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys_local.o715rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys_local.o
687rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys_local.o716rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys_local.o
688read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o717read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
689read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o718read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
690read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys_local.o units.o719read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys_local.o units.o
691read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys_local.o720read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys_local.o
692readsp.o: parallel.o precision.o sys_local.o721readsp.o: parallel.o precision.o sys_local.o
@@ -756,30 +785,32 @@
756siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o785siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
757siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o786siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
758siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o787siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
759siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o788siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
760siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o789siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
761siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o790siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
762siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o791siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
763siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o792siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
764siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o793siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
765siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o794siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
766siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o795siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
767siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o796siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
768siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o797siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
769siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o798siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
770siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o799siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
771siesta_forces.o: state_init.o sys_local.o units.o write_subs.o800siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
801siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys_local.o
802siesta_forces.o: units.o wavefunctions.o write_subs.o
772siesta_geom.o: precision.o803siesta_geom.o: precision.o
773siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o804siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
774siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o805siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
775siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o806siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
776siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o807siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
777siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o808siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
778siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o809siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
779siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o810siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
780siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o811siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
781siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys_local.o812siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
782siesta_init.o: timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o813siesta_init.o: sys_local.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
783siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys_local.o814siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys_local.o
784siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o815siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
785siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o816siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -813,19 +844,18 @@
813state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o844state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
814state_init.o: sparse_matrices.o sys_local.o units.o write_subs.o zmatrix.o845state_init.o: sparse_matrices.o sys_local.o units.o write_subs.o zmatrix.o
815struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o846struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
816struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o847struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
817struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o848struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
818struct_init.o: units.o zmatrix.o849struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
819sys.o: parallel.o850sys.o: parallel.o
820timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys_local.o851timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys_local.o
821timer.o: timer_tree.o852timer.o: timer_tree.o
822timer_tree.o: m_walltime.o853timer_tree.o: m_walltime.o
823transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o854transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
824transition_rate.o: sys_local.o855transition_rate.o: sys_local.o
825ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o856ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
826ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o857ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
827ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o858ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
828ts_init.o: siesta_options.o
829ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o859ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
830ts_show_regions.o: precision.o units.o860ts_show_regions.o: precision.o units.o
831typecell.o: precision.o861typecell.o: precision.o
@@ -837,6 +867,7 @@
837vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o867vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
838vmatsp.o: meshphi.o precision.o868vmatsp.o: meshphi.o precision.o
839vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys_local.o869vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys_local.o
870wavefunctions.o: parallel.o precision.o
840write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o871write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
841write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o872write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
842write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o873write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -968,6 +999,7 @@
968m_ksv.o: ksv.o999m_ksv.o: ksv.o
969m_ksvinit.o: ksvinit.o1000m_ksvinit.o: ksvinit.o
970m_ldau.o: ldau.o1001m_ldau.o: ldau.o
1002m_linpack.o: linpack.o
971m_local_dos.o: local_DOS.o1003m_local_dos.o: local_DOS.o
972m_matel_registry.o: matel_registry.o1004m_matel_registry.o: matel_registry.o
973m_minvec.o: minvec.o1005m_minvec.o: minvec.o
@@ -1012,6 +1044,8 @@
1012m_vmat.o: vmat.o1044m_vmat.o: vmat.o
1013m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1045m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
1014m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1046m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1047matdiagon.o: m_matdiag.o
1048matswinversion.o: m_matswinvers.o
1015mtprng.o: m_uuid.o1049mtprng.o: m_uuid.o
1016neighbour.o: mneighb.o1050neighbour.o: mneighb.o
1017on_core.o: onmod.o1051on_core.o: onmod.o
10181052
=== modified file 'Util/Denchar/Src/Makefile'
--- Util/Denchar/Src/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/Denchar/Src/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -175,7 +175,7 @@
175bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o175bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
176bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o176bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
177bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o177bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
178cart2frac.o: sys.o178cart2frac.o: precision.o sys.o
179cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o179cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
180cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o180cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
181cell_broyden_optim.o: zmatrix.o181cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -187,6 +187,8 @@
187cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o187cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
188cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o188cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
189cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o189cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
190changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
191changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
190chemical.o: parallel.o precision.o sys.o192chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
191chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o193chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
192chkdim.o: sys.o194chkdim.o: sys.o
@@ -238,17 +240,17 @@
238denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o240denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
239denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o241denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
240densematrix.o: alloc.o precision.o242densematrix.o: alloc.o precision.o
241detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o243detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
242dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o244dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
243dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o245dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
244dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o246dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
245dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o247dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
246dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o248dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
247dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o249dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
248dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o250dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
249dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o251dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
250dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o252dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
251dhscf.o: vmat.o253dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
252diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o254diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
253diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o255diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
254diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o256diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -276,7 +278,7 @@
276domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o278domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
277doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o279doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
278dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o280dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
279dynamics.o: precision.o sys.o units.o281dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
280egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o282egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
281egandd.o: onmod.o precision.o sys.o283egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
282eggbox.o: parallel.o precision.o284eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -285,6 +287,10 @@
285elpa2.o: elpa1.o287elpa2.o: elpa1.o
286ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o288ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
287ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o289ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
290evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
291evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
292evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
293evolk.o: sys.o wavefunctions.o
288extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o294extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
289extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o295extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
290extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o296extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -325,9 +331,9 @@
325initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o331initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
326initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o332initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
327initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o333initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
328initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o334initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
329initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o335initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
330initparallel.o: spatial.o sys.o336initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
331io.o: sys.o337io.o: sys.o
332iocg.o: files.o precision.o sys.o338iocg.o: files.o precision.o sys.o
333iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o339iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -386,7 +392,9 @@
386m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o392m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
387m_energies.o: precision.o393m_energies.o: precision.o
388m_eo.o: precision.o394m_eo.o: precision.o
395m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
389m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o396m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
397m_fastconv_dims.o: precision.o
390m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o398m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
391m_fire.o: parallel.o precision.o399m_fire.o: parallel.o precision.o
392m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o400m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -408,10 +416,14 @@
408m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o416m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
409m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o417m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
410m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o418m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
419m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
420m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
421m_initwf.o: wavefunctions.o
411m_integrate.o: precision.o422m_integrate.o: precision.o
412m_io.o: sys.o423m_io.o: sys.o
413m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o424m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
414m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o425m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
426m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
415m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o427m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
416m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o428m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
417m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o429m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -419,9 +431,13 @@
419m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o431m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
420m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o432m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
421m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o433m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
434m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
435m_iotddft.o: wavefunctions.o
422m_kinetic.o: precision.o436m_kinetic.o: precision.o
423m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o437m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
438m_matdiag.o: precision.o
424m_matio.o: alloc.o parallel.o439m_matio.o: alloc.o parallel.o
440m_matswinvers.o: precision.o
425m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o441m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
426m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o442m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
427m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o443m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -469,6 +485,15 @@
469m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o485m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
470m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o486m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
471m_planewavematrixvar.o: precision.o487m_planewavematrixvar.o: precision.o
488m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
489m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
490m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
491m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
492m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
493m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
494m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
495m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
496m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
472m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o497m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
473m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o498m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
474m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o499m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -484,7 +509,8 @@
484m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o509m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
485m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o510m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
486m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o511m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
487m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o512m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
513m_sparsity_handling.o: precision.o
488m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o514m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
489m_stress.o: precision.o515m_stress.o: precision.o
490m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o516m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -596,9 +622,10 @@
596m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o622m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
597m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o623m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
598m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o624m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
599m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o625m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
600m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o626m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
601m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o627m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
628m_ts_pivot.o: precision.o
602m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o629m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
603m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o630m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
604m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o631m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -741,8 +768,8 @@
741rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o768rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
742rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o769rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
743rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o770rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
744read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o771read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
745read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o772read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
746read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o773read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
747read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o774read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
748readsp.o: parallel.o precision.o sys.o775readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -809,30 +836,32 @@
809siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o836siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
810siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o837siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
811siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o838siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
812siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o839siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
813siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o840siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
814siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o841siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
815siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o842siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
816siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o843siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
817siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o844siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
818siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o845siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
819siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o846siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
820siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o847siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
821siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o848siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
822siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o849siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
823siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o850siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
824siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o851siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
852siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
853siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
825siesta_geom.o: precision.o854siesta_geom.o: precision.o
826siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o855siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
827siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o856siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
828siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o857siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
829siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o858siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
830siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o859siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
831siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o860siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
832siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o861siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
833siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o862siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
834siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o863siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
835siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o864siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
836siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o865siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
837siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o866siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
838siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o867siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -864,18 +893,17 @@
864state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o893state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
865state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o894state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
866struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o895struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
867struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o896struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
868struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o897struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
869struct_init.o: units.o zmatrix.o898struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
870sys.o: parallel.o899sys.o: parallel.o
871timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o900timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
872timer.o: timer_tree.o901timer.o: timer_tree.o
873timer_tree.o: m_walltime.o902timer_tree.o: m_walltime.o
874transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o903transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
875ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o904ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
876ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o905ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
877ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o906ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
878ts_init.o: siesta_options.o
879ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o907ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
880ts_show_regions.o: precision.o units.o908ts_show_regions.o: precision.o units.o
881typecell.o: precision.o909typecell.o: precision.o
@@ -887,6 +915,7 @@
887vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o915vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
888vmatsp.o: meshphi.o precision.o916vmatsp.o: meshphi.o precision.o
889vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o917vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
918wavefunctions.o: parallel.o precision.o
890write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o919write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
891write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o920write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
892write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o921write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -911,7 +940,9 @@
911atompla.o: precision.o sys.o940atompla.o: precision.o sys.o
912colinear.o: precision.o941colinear.o: precision.o
913denchar.o: basis_io.o listsc.o parallel.o precision.o942denchar.o: basis_io.o listsc.o parallel.o precision.o
943length.o: precision.o
914local_reinit.o: files.o944local_reinit.o: files.o
945matvect.o: precision.o
915neighb.o: precision.o946neighb.o: precision.o
916planed.o: precision.o947planed.o: precision.o
917ranger.o: precision.o948ranger.o: precision.o
@@ -1020,6 +1051,7 @@
1020m_ksv.o: ksv.o1051m_ksv.o: ksv.o
1021m_ksvinit.o: ksvinit.o1052m_ksvinit.o: ksvinit.o
1022m_ldau.o: ldau.o1053m_ldau.o: ldau.o
1054m_linpack.o: linpack.o
1023m_local_dos.o: local_DOS.o1055m_local_dos.o: local_DOS.o
1024m_matel_registry.o: matel_registry.o1056m_matel_registry.o: matel_registry.o
1025m_minvec.o: minvec.o1057m_minvec.o: minvec.o
@@ -1064,6 +1096,8 @@
1064m_vmat.o: vmat.o1096m_vmat.o: vmat.o
1065m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1097m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
1066m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1098m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1099matdiagon.o: m_matdiag.o
1100matswinversion.o: m_matswinvers.o
1067mtprng.o: m_uuid.o1101mtprng.o: m_uuid.o
1068neighbour.o: mneighb.o1102neighbour.o: mneighb.o
1069on_core.o: onmod.o1103on_core.o: onmod.o
10701104
=== modified file 'Util/Gen-basis/Makefile'
--- Util/Gen-basis/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/Gen-basis/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -171,7 +171,7 @@
171bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o171bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
172bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o172bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
173bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o173bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
174cart2frac.o: sys.o174cart2frac.o: precision.o sys.o
175cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o175cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
176cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o176cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
177cell_broyden_optim.o: zmatrix.o177cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -183,6 +183,8 @@
183cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o183cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
184cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o184cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
185cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o185cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
186changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
187changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
186chemical.o: parallel.o precision.o sys.o188chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
187chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o189chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
188chkdim.o: sys.o190chkdim.o: sys.o
@@ -234,17 +236,17 @@
234denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o236denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
235denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o237denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
236densematrix.o: alloc.o precision.o238densematrix.o: alloc.o precision.o
237detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o239detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
238dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o240dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
239dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o241dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
240dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o242dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
241dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o243dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
242dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o244dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
243dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o245dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
244dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o246dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
245dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o247dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
246dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o248dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
247dhscf.o: vmat.o249dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
248diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o250diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
249diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o251diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
250diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o252diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -272,7 +274,7 @@
272domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o274domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
273doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o275doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
274dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o276dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
275dynamics.o: precision.o sys.o units.o277dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
276egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o278egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
277egandd.o: onmod.o precision.o sys.o279egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
278eggbox.o: parallel.o precision.o280eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -281,6 +283,10 @@
281elpa2.o: elpa1.o283elpa2.o: elpa1.o
282ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o284ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
283ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o285ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
286evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
287evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
288evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
289evolk.o: sys.o wavefunctions.o
284extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o290extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
285extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o291extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
286extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o292extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -321,9 +327,9 @@
321initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o327initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
322initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o328initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
323initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o329initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
324initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o330initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
325initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o331initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
326initparallel.o: spatial.o sys.o332initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
327io.o: sys.o333io.o: sys.o
328iocg.o: files.o precision.o sys.o334iocg.o: files.o precision.o sys.o
329iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o335iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -382,7 +388,9 @@
382m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o388m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
383m_energies.o: precision.o389m_energies.o: precision.o
384m_eo.o: precision.o390m_eo.o: precision.o
391m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
385m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o392m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
393m_fastconv_dims.o: precision.o
386m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o394m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
387m_fire.o: parallel.o precision.o395m_fire.o: parallel.o precision.o
388m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o396m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -404,10 +412,14 @@
404m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o412m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
405m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o413m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
406m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o414m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
415m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
416m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
417m_initwf.o: wavefunctions.o
407m_integrate.o: precision.o418m_integrate.o: precision.o
408m_io.o: sys.o419m_io.o: sys.o
409m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o420m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
410m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o421m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
422m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
411m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o423m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
412m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o424m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
413m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o425m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -415,9 +427,13 @@
415m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o427m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
416m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o428m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
417m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o429m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
430m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
431m_iotddft.o: wavefunctions.o
418m_kinetic.o: precision.o432m_kinetic.o: precision.o
419m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o433m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
434m_matdiag.o: precision.o
420m_matio.o: alloc.o parallel.o435m_matio.o: alloc.o parallel.o
436m_matswinvers.o: precision.o
421m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o437m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
422m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o438m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
423m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o439m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -465,6 +481,15 @@
465m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o481m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
466m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o482m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
467m_planewavematrixvar.o: precision.o483m_planewavematrixvar.o: precision.o
484m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
485m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
486m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
487m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
488m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
489m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
490m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
491m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
492m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
468m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o493m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
469m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o494m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
470m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o495m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -480,7 +505,8 @@
480m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o505m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
481m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o506m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
482m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o507m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
483m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o508m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
509m_sparsity_handling.o: precision.o
484m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o510m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
485m_stress.o: precision.o511m_stress.o: precision.o
486m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o512m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -592,9 +618,10 @@
592m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o618m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
593m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o619m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
594m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o620m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
595m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o621m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
596m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o622m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
597m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o623m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
624m_ts_pivot.o: precision.o
598m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o625m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
599m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o626m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
600m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o627m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -737,8 +764,8 @@
737rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o764rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
738rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o765rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
739rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o766rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
740read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o767read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
741read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o768read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
742read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o769read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
743read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o770read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
744readsp.o: parallel.o precision.o sys.o771readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -805,30 +832,32 @@
805siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o832siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
806siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o833siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
807siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o834siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
808siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o835siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
809siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o836siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
810siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o837siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
811siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o838siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
812siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o839siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
813siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o840siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
814siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o841siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
815siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o842siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
816siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o843siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
817siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o844siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
818siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o845siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
819siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o846siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
820siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o847siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
848siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
849siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
821siesta_geom.o: precision.o850siesta_geom.o: precision.o
822siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o851siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
823siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o852siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
824siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o853siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
825siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o854siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
826siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o855siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
827siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o856siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
828siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o857siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
829siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o858siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
830siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o859siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
831siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o860siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
832siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o861siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
833siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o862siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
834siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o863siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -860,18 +889,17 @@
860state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o889state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
861state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o890state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
862struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o891struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
863struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o892struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
864struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o893struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
865struct_init.o: units.o zmatrix.o894struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
866sys.o: parallel.o895sys.o: parallel.o
867timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o896timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
868timer.o: timer_tree.o897timer.o: timer_tree.o
869timer_tree.o: m_walltime.o898timer_tree.o: m_walltime.o
870transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o899transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
871ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o900ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
872ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o901ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
873ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o902ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
874ts_init.o: siesta_options.o
875ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o903ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
876ts_show_regions.o: precision.o units.o904ts_show_regions.o: precision.o units.o
877typecell.o: precision.o905typecell.o: precision.o
@@ -883,6 +911,7 @@
883vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o911vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
884vmatsp.o: meshphi.o precision.o912vmatsp.o: meshphi.o precision.o
885vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o913vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
914wavefunctions.o: parallel.o precision.o
886write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o915write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
887write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o916write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
888write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o917write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -1004,6 +1033,7 @@
1004m_ksv.o: ksv.o1033m_ksv.o: ksv.o
1005m_ksvinit.o: ksvinit.o1034m_ksvinit.o: ksvinit.o
1006m_ldau.o: ldau.o1035m_ldau.o: ldau.o
1036m_linpack.o: linpack.o
1007m_local_dos.o: local_DOS.o1037m_local_dos.o: local_DOS.o
1008m_matel_registry.o: matel_registry.o1038m_matel_registry.o: matel_registry.o
1009m_minvec.o: minvec.o1039m_minvec.o: minvec.o
@@ -1048,6 +1078,8 @@
1048m_vmat.o: vmat.o1078m_vmat.o: vmat.o
1049m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1079m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
1050m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1080m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1081matdiagon.o: m_matdiag.o
1082matswinversion.o: m_matswinvers.o
1051mtprng.o: m_uuid.o1083mtprng.o: m_uuid.o
1052neighbour.o: mneighb.o1084neighbour.o: mneighb.o
1053on_core.o: onmod.o1085on_core.o: onmod.o
10541086
=== modified file 'Util/Grimme/Makefile'
--- Util/Grimme/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/Grimme/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -109,7 +109,7 @@
109bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o109bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
110bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o110bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
111bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o111bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
112cart2frac.o: sys.o112cart2frac.o: precision.o sys.o
113cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o113cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
114cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o114cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
115cell_broyden_optim.o: zmatrix.o115cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -121,6 +121,8 @@
121cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o121cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
122cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o122cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
123cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o123cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
124changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
125changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
124chemical.o: parallel.o precision.o sys.o126chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
125chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o127chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
126chkdim.o: sys.o128chkdim.o: sys.o
@@ -172,17 +174,17 @@
172denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o174denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
173denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o175denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
174densematrix.o: alloc.o precision.o176densematrix.o: alloc.o precision.o
175detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o177detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
176dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o178dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
177dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o179dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
178dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o180dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
179dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o181dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
180dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o182dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
181dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o183dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
182dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o184dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
183dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o185dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
184dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o186dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
185dhscf.o: vmat.o187dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
186diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o188diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
187diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o189diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
188diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o190diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -210,7 +212,7 @@
210domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o212domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
211doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o213doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
212dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o214dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
213dynamics.o: precision.o sys.o units.o215dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
214egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o216egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
215egandd.o: onmod.o precision.o sys.o217egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
216eggbox.o: parallel.o precision.o218eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -219,6 +221,10 @@
219elpa2.o: elpa1.o221elpa2.o: elpa1.o
220ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o222ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
221ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o223ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
224evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
225evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
226evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
227evolk.o: sys.o wavefunctions.o
222extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o228extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
223extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o229extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
224extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o230extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -259,9 +265,9 @@
259initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o265initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
260initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o266initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
261initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o267initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
262initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o268initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
263initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o269initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
264initparallel.o: spatial.o sys.o270initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
265io.o: sys.o271io.o: sys.o
266iocg.o: files.o precision.o sys.o272iocg.o: files.o precision.o sys.o
267iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o273iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -320,7 +326,9 @@
320m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o326m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
321m_energies.o: precision.o327m_energies.o: precision.o
322m_eo.o: precision.o328m_eo.o: precision.o
329m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
323m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o330m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
331m_fastconv_dims.o: precision.o
324m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o332m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
325m_fire.o: parallel.o precision.o333m_fire.o: parallel.o precision.o
326m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o334m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -342,10 +350,14 @@
342m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o350m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
343m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o351m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
344m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o352m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
353m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
354m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
355m_initwf.o: wavefunctions.o
345m_integrate.o: precision.o356m_integrate.o: precision.o
346m_io.o: sys.o357m_io.o: sys.o
347m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o358m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
348m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o359m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
360m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
349m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o361m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
350m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o362m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
351m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o363m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -353,9 +365,13 @@
353m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o365m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
354m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o366m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
355m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o367m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
368m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
369m_iotddft.o: wavefunctions.o
356m_kinetic.o: precision.o370m_kinetic.o: precision.o
357m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o371m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
372m_matdiag.o: precision.o
358m_matio.o: alloc.o parallel.o373m_matio.o: alloc.o parallel.o
374m_matswinvers.o: precision.o
359m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o375m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
360m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o376m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
361m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o377m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -403,6 +419,15 @@
403m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o419m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
404m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o420m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
405m_planewavematrixvar.o: precision.o421m_planewavematrixvar.o: precision.o
422m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
423m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
424m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
425m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
426m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
427m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
428m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
429m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
430m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
406m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o431m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
407m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o432m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
408m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o433m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -418,7 +443,8 @@
418m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o443m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
419m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o444m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
420m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o445m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
421m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o446m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
447m_sparsity_handling.o: precision.o
422m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o448m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
423m_stress.o: precision.o449m_stress.o: precision.o
424m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o450m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -530,9 +556,10 @@
530m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o556m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
531m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o557m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
532m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o558m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
533m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o559m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
534m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o560m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
535m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o561m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
562m_ts_pivot.o: precision.o
536m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o563m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
537m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o564m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
538m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o565m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -675,8 +702,8 @@
675rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o702rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
676rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o703rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
677rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o704rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
678read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o705read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
679read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o706read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
680read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o707read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
681read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o708read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
682readsp.o: parallel.o precision.o sys.o709readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -743,30 +770,32 @@
743siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o770siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
744siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o771siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
745siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o772siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
746siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o773siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
747siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o774siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
748siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o775siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
749siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o776siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
750siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o777siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
751siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o778siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
752siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o779siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
753siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o780siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
754siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o781siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
755siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o782siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
756siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o783siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
757siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o784siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
758siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o785siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
786siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
787siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
759siesta_geom.o: precision.o788siesta_geom.o: precision.o
760siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o789siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
761siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o790siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
762siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o791siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
763siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o792siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
764siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o793siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
765siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o794siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
766siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o795siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
767siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o796siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
768siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o797siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
769siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o798siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
770siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o799siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
771siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o800siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
772siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o801siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -798,18 +827,17 @@
798state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o827state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
799state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o828state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
800struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o829struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
801struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o830struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
802struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o831struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
803struct_init.o: units.o zmatrix.o832struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
804sys.o: parallel.o833sys.o: parallel.o
805timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o834timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
806timer.o: timer_tree.o835timer.o: timer_tree.o
807timer_tree.o: m_walltime.o836timer_tree.o: m_walltime.o
808transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o837transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
809ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o838ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
810ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o839ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
811ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o840ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
812ts_init.o: siesta_options.o
813ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o841ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
814ts_show_regions.o: precision.o units.o842ts_show_regions.o: precision.o units.o
815typecell.o: precision.o843typecell.o: precision.o
@@ -821,6 +849,7 @@
821vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o849vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
822vmatsp.o: meshphi.o precision.o850vmatsp.o: meshphi.o precision.o
823vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o851vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
852wavefunctions.o: parallel.o precision.o
824write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o853write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
825write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o854write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
826write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o855write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -938,6 +967,7 @@
938m_ksv.o: ksv.o967m_ksv.o: ksv.o
939m_ksvinit.o: ksvinit.o968m_ksvinit.o: ksvinit.o
940m_ldau.o: ldau.o969m_ldau.o: ldau.o
970m_linpack.o: linpack.o
941m_local_dos.o: local_DOS.o971m_local_dos.o: local_DOS.o
942m_matel_registry.o: matel_registry.o972m_matel_registry.o: matel_registry.o
943m_minvec.o: minvec.o973m_minvec.o: minvec.o
@@ -982,6 +1012,8 @@
982m_vmat.o: vmat.o1012m_vmat.o: vmat.o
983m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1013m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
984m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1014m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1015matdiagon.o: m_matdiag.o
1016matswinversion.o: m_matswinvers.o
985mtprng.o: m_uuid.o1017mtprng.o: m_uuid.o
986neighbour.o: mneighb.o1018neighbour.o: mneighb.o
987on_core.o: onmod.o1019on_core.o: onmod.o
9881020
=== modified file 'Util/Helpers/Makefile'
--- Util/Helpers/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/Helpers/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -112,7 +112,7 @@
112bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o112bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
113bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o113bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
114bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o114bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
115cart2frac.o: sys.o115cart2frac.o: precision.o sys.o
116cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o116cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
117cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o117cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
118cell_broyden_optim.o: zmatrix.o118cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -124,6 +124,8 @@
124cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o124cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
125cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o125cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
126cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o126cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
127changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
128changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
127chemical.o: parallel.o precision.o sys.o129chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
128chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o130chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
129chkdim.o: sys.o131chkdim.o: sys.o
@@ -175,17 +177,17 @@
175denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o177denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
176denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o178denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
177densematrix.o: alloc.o precision.o179densematrix.o: alloc.o precision.o
178detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o180detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
179dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o181dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
180dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o182dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
181dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o183dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
182dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o184dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
183dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o185dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
184dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o186dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
185dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o187dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
186dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o188dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
187dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o189dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
188dhscf.o: vmat.o190dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
189diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o191diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
190diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o192diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
191diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o193diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -213,7 +215,7 @@
213domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o215domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
214doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o216doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
215dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o217dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
216dynamics.o: precision.o sys.o units.o218dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
217egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o219egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
218egandd.o: onmod.o precision.o sys.o220egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
219eggbox.o: parallel.o precision.o221eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -222,6 +224,10 @@
222elpa2.o: elpa1.o224elpa2.o: elpa1.o
223ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o225ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
224ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o226ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
227evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
228evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
229evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
230evolk.o: sys.o wavefunctions.o
225extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o231extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
226extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o232extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
227extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o233extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -262,9 +268,9 @@
262initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o268initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
263initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o269initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
264initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o270initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
265initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o271initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
266initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o272initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
267initparallel.o: spatial.o sys.o273initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
268io.o: sys.o274io.o: sys.o
269iocg.o: files.o precision.o sys.o275iocg.o: files.o precision.o sys.o
270iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o276iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -323,7 +329,9 @@
323m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o329m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
324m_energies.o: precision.o330m_energies.o: precision.o
325m_eo.o: precision.o331m_eo.o: precision.o
332m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
326m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o333m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
334m_fastconv_dims.o: precision.o
327m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o335m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
328m_fire.o: parallel.o precision.o336m_fire.o: parallel.o precision.o
329m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o337m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -345,10 +353,14 @@
345m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o353m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
346m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o354m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
347m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o355m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
356m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
357m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
358m_initwf.o: wavefunctions.o
348m_integrate.o: precision.o359m_integrate.o: precision.o
349m_io.o: sys.o360m_io.o: sys.o
350m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o361m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
351m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o362m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
363m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
352m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o364m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
353m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o365m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
354m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o366m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -356,9 +368,13 @@
356m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o368m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
357m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o369m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
358m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o370m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
371m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
372m_iotddft.o: wavefunctions.o
359m_kinetic.o: precision.o373m_kinetic.o: precision.o
360m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o374m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
375m_matdiag.o: precision.o
361m_matio.o: alloc.o parallel.o376m_matio.o: alloc.o parallel.o
377m_matswinvers.o: precision.o
362m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o378m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
363m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o379m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
364m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o380m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -406,6 +422,15 @@
406m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o422m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
407m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o423m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
408m_planewavematrixvar.o: precision.o424m_planewavematrixvar.o: precision.o
425m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
426m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
427m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
428m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
429m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
430m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
431m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
432m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
433m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
409m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o434m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
410m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o435m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
411m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o436m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -421,7 +446,8 @@
421m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o446m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
422m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o447m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
423m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o448m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
424m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o449m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
450m_sparsity_handling.o: precision.o
425m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o451m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
426m_stress.o: precision.o452m_stress.o: precision.o
427m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o453m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -533,9 +559,10 @@
533m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o559m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
534m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o560m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
535m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o561m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
536m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o562m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
537m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o563m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
538m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o564m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
565m_ts_pivot.o: precision.o
539m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o566m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
540m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o567m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
541m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o568m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -678,8 +705,8 @@
678rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o705rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
679rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o706rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
680rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o707rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
681read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o708read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
682read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o709read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
683read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o710read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
684read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o711read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
685readsp.o: parallel.o precision.o sys.o712readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -746,30 +773,32 @@
746siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o773siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
747siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o774siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
748siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o775siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
749siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o776siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
750siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o777siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
751siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o778siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
752siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o779siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
753siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o780siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
754siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o781siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
755siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o782siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
756siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o783siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
757siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o784siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
758siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o785siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
759siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o786siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
760siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o787siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
761siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o788siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
789siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
790siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
762siesta_geom.o: precision.o791siesta_geom.o: precision.o
763siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o792siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
764siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o793siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
765siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o794siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
766siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o795siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
767siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o796siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
768siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o797siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
769siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o798siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
770siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o799siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
771siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o800siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
772siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o801siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
773siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o802siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
774siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o803siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
775siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o804siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -801,18 +830,17 @@
801state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o830state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
802state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o831state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
803struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o832struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
804struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o833struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
805struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o834struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
806struct_init.o: units.o zmatrix.o835struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
807sys.o: parallel.o836sys.o: parallel.o
808timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o837timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
809timer.o: timer_tree.o838timer.o: timer_tree.o
810timer_tree.o: m_walltime.o839timer_tree.o: m_walltime.o
811transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o840transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
812ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o841ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
813ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o842ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
814ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o843ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
815ts_init.o: siesta_options.o
816ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o844ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
817ts_show_regions.o: precision.o units.o845ts_show_regions.o: precision.o units.o
818typecell.o: precision.o846typecell.o: precision.o
@@ -824,6 +852,7 @@
824vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o852vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
825vmatsp.o: meshphi.o precision.o853vmatsp.o: meshphi.o precision.o
826vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o854vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
855wavefunctions.o: parallel.o precision.o
827write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o856write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
828write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o857write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
829write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o858write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -941,6 +970,7 @@
941m_ksv.o: ksv.o970m_ksv.o: ksv.o
942m_ksvinit.o: ksvinit.o971m_ksvinit.o: ksvinit.o
943m_ldau.o: ldau.o972m_ldau.o: ldau.o
973m_linpack.o: linpack.o
944m_local_dos.o: local_DOS.o974m_local_dos.o: local_DOS.o
945m_matel_registry.o: matel_registry.o975m_matel_registry.o: matel_registry.o
946m_minvec.o: minvec.o976m_minvec.o: minvec.o
@@ -985,6 +1015,8 @@
985m_vmat.o: vmat.o1015m_vmat.o: vmat.o
986m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1016m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
987m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1017m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1018matdiagon.o: m_matdiag.o
1019matswinversion.o: m_matswinvers.o
988mtprng.o: m_uuid.o1020mtprng.o: m_uuid.o
989neighbour.o: mneighb.o1021neighbour.o: mneighb.o
990on_core.o: onmod.o1022on_core.o: onmod.o
9911023
=== modified file 'Util/STM/ol-stm/Src/Makefile'
--- Util/STM/ol-stm/Src/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/STM/ol-stm/Src/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -185,7 +185,7 @@
185bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o185bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
186bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o186bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
187bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o187bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
188cart2frac.o: sys.o188cart2frac.o: precision.o sys.o
189cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o189cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
190cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o190cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
191cell_broyden_optim.o: zmatrix.o191cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -197,6 +197,8 @@
197cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o197cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
198cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o198cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
199cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o199cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
200changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
201changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
200chemical.o: parallel.o precision.o sys.o202chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
201chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o203chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
202chkdim.o: sys.o204chkdim.o: sys.o
@@ -248,17 +250,17 @@
248denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o250denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
249denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o251denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
250densematrix.o: alloc.o precision.o252densematrix.o: alloc.o precision.o
251detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o253detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
252dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o254dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
253dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o255dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
254dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o256dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
255dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o257dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
256dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o258dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
257dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o259dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
258dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o260dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
259dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o261dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
260dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o262dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
261dhscf.o: vmat.o263dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
262diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o264diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
263diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o265diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
264diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o266diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -286,7 +288,7 @@
286domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o288domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
287doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o289doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
288dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o290dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
289dynamics.o: precision.o sys.o units.o291dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
290egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o292egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
291egandd.o: onmod.o precision.o sys.o293egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
292eggbox.o: parallel.o precision.o294eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -295,6 +297,10 @@
295elpa2.o: elpa1.o297elpa2.o: elpa1.o
296ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o298ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
297ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o299ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
300evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
301evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
302evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
303evolk.o: sys.o wavefunctions.o
298extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o304extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
299extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o305extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
300extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o306extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -335,9 +341,9 @@
335initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o341initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
336initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o342initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
337initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o343initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
338initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o344initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
339initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o345initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
340initparallel.o: spatial.o sys.o346initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
341io.o: sys.o347io.o: sys.o
342iocg.o: files.o precision.o sys.o348iocg.o: files.o precision.o sys.o
343iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o349iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -396,7 +402,9 @@
396m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o402m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
397m_energies.o: precision.o403m_energies.o: precision.o
398m_eo.o: precision.o404m_eo.o: precision.o
405m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
399m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o406m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
407m_fastconv_dims.o: precision.o
400m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o408m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
401m_fire.o: parallel.o precision.o409m_fire.o: parallel.o precision.o
402m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o410m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -418,10 +426,14 @@
418m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o426m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
419m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o427m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
420m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o428m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
429m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
430m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
431m_initwf.o: wavefunctions.o
421m_integrate.o: precision.o432m_integrate.o: precision.o
422m_io.o: sys.o433m_io.o: sys.o
423m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o434m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
424m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o435m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
436m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
425m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o437m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
426m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o438m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
427m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o439m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -429,9 +441,13 @@
429m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o441m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
430m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o442m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
431m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o443m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
444m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
445m_iotddft.o: wavefunctions.o
432m_kinetic.o: precision.o446m_kinetic.o: precision.o
433m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o447m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
448m_matdiag.o: precision.o
434m_matio.o: alloc.o parallel.o449m_matio.o: alloc.o parallel.o
450m_matswinvers.o: precision.o
435m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o451m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
436m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o452m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
437m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o453m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -479,6 +495,15 @@
479m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o495m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
480m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o496m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
481m_planewavematrixvar.o: precision.o497m_planewavematrixvar.o: precision.o
498m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
499m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
500m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
501m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
502m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
503m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
504m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
505m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
506m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
482m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o507m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
483m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o508m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
484m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o509m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -494,7 +519,8 @@
494m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o519m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
495m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o520m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
496m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o521m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
497m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o522m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
523m_sparsity_handling.o: precision.o
498m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o524m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
499m_stress.o: precision.o525m_stress.o: precision.o
500m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o526m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -606,9 +632,10 @@
606m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o632m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
607m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o633m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
608m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o634m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
609m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o635m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
610m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o636m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
611m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o637m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
638m_ts_pivot.o: precision.o
612m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o639m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
613m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o640m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
614m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o641m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -751,8 +778,8 @@
751rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o778rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
752rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o779rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
753rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o780rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
754read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o781read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
755read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o782read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
756read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o783read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
757read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o784read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
758readsp.o: parallel.o precision.o sys.o785readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -819,30 +846,32 @@
819siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o846siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
820siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o847siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
821siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o848siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
822siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o849siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
823siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o850siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
824siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o851siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
825siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o852siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
826siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o853siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
827siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o854siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
828siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o855siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
829siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o856siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
830siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o857siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
831siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o858siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
832siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o859siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
833siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o860siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
834siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o861siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
862siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
863siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
835siesta_geom.o: precision.o864siesta_geom.o: precision.o
836siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o865siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
837siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o866siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
838siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o867siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
839siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o868siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
840siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o869siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
841siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o870siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
842siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o871siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
843siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o872siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
844siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o873siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
845siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o874siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
846siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o875siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
847siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o876siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
848siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o877siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -874,18 +903,17 @@
874state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o903state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
875state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o904state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
876struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o905struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
877struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o906struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
878struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o907struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
879struct_init.o: units.o zmatrix.o908struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
880sys.o: parallel.o909sys.o: parallel.o
881timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o910timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
882timer.o: timer_tree.o911timer.o: timer_tree.o
883timer_tree.o: m_walltime.o912timer_tree.o: m_walltime.o
884transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o913transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
885ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o914ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
886ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o915ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
887ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o916ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
888ts_init.o: siesta_options.o
889ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o917ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
890ts_show_regions.o: precision.o units.o918ts_show_regions.o: precision.o units.o
891typecell.o: precision.o919typecell.o: precision.o
@@ -897,6 +925,7 @@
897vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o925vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
898vmatsp.o: meshphi.o precision.o926vmatsp.o: meshphi.o precision.o
899vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o927vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
928wavefunctions.o: parallel.o precision.o
900write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o929write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
901write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o930write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
902write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o931write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -1020,6 +1049,7 @@
1020m_ksv.o: ksv.o1049m_ksv.o: ksv.o
1021m_ksvinit.o: ksvinit.o1050m_ksvinit.o: ksvinit.o
1022m_ldau.o: ldau.o1051m_ldau.o: ldau.o
1052m_linpack.o: linpack.o
1023m_local_dos.o: local_DOS.o1053m_local_dos.o: local_DOS.o
1024m_matel_registry.o: matel_registry.o1054m_matel_registry.o: matel_registry.o
1025m_minvec.o: minvec.o1055m_minvec.o: minvec.o
@@ -1064,6 +1094,8 @@
1064m_vmat.o: vmat.o1094m_vmat.o: vmat.o
1065m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1095m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
1066m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1096m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1097matdiagon.o: m_matdiag.o
1098matswinversion.o: m_matswinvers.o
1067mtprng.o: m_uuid.o1099mtprng.o: m_uuid.o
1068neighbour.o: mneighb.o1100neighbour.o: mneighb.o
1069on_core.o: onmod.o1101on_core.o: onmod.o
10701102
=== modified file 'Util/SpPivot/Makefile'
--- Util/SpPivot/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/SpPivot/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -116,7 +116,7 @@
116bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o116bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
117bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o117bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
118bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o118bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
119cart2frac.o: sys.o119cart2frac.o: precision.o sys.o
120cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o120cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
121cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o121cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
122cell_broyden_optim.o: zmatrix.o122cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -128,6 +128,8 @@
128cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o128cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
129cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o129cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
130cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o130cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
131changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
132changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
131chemical.o: parallel.o precision.o sys.o133chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
132chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o134chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
133chkdim.o: sys.o135chkdim.o: sys.o
@@ -179,17 +181,17 @@
179denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o181denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
180denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o182denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
181densematrix.o: alloc.o precision.o183densematrix.o: alloc.o precision.o
182detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o184detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
183dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o185dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
184dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o186dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
185dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o187dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
186dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o188dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
187dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o189dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
188dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o190dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
189dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o191dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
190dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o192dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
191dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o193dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
192dhscf.o: vmat.o194dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
193diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o195diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
194diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o196diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
195diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o197diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -217,7 +219,7 @@
217domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o219domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
218doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o220doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
219dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o221dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
220dynamics.o: precision.o sys.o units.o222dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
221egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o223egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
222egandd.o: onmod.o precision.o sys.o224egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
223eggbox.o: parallel.o precision.o225eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -226,6 +228,10 @@
226elpa2.o: elpa1.o228elpa2.o: elpa1.o
227ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o229ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
228ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o230ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
231evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
232evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
233evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
234evolk.o: sys.o wavefunctions.o
229extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o235extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
230extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o236extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
231extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o237extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -266,9 +272,9 @@
266initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o272initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
267initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o273initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
268initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o274initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
269initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o275initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
270initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o276initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
271initparallel.o: spatial.o sys.o277initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
272io.o: sys.o278io.o: sys.o
273iocg.o: files.o precision.o sys.o279iocg.o: files.o precision.o sys.o
274iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o280iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -327,7 +333,9 @@
327m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o333m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
328m_energies.o: precision.o334m_energies.o: precision.o
329m_eo.o: precision.o335m_eo.o: precision.o
336m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
330m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o337m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
338m_fastconv_dims.o: precision.o
331m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o339m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
332m_fire.o: parallel.o precision.o340m_fire.o: parallel.o precision.o
333m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o341m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -349,10 +357,14 @@
349m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o357m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
350m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o358m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
351m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o359m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
360m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
361m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
362m_initwf.o: wavefunctions.o
352m_integrate.o: precision.o363m_integrate.o: precision.o
353m_io.o: sys.o364m_io.o: sys.o
354m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o365m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
355m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o366m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
367m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
356m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o368m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
357m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o369m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
358m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o370m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -360,9 +372,13 @@
360m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o372m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
361m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o373m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
362m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o374m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
375m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
376m_iotddft.o: wavefunctions.o
363m_kinetic.o: precision.o377m_kinetic.o: precision.o
364m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o378m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
379m_matdiag.o: precision.o
365m_matio.o: alloc.o parallel.o380m_matio.o: alloc.o parallel.o
381m_matswinvers.o: precision.o
366m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o382m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
367m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o383m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
368m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o384m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -410,6 +426,15 @@
410m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o426m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
411m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o427m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
412m_planewavematrixvar.o: precision.o428m_planewavematrixvar.o: precision.o
429m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
430m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
431m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
432m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
433m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
434m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
435m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
436m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
437m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
413m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o438m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
414m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o439m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
415m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o440m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -425,7 +450,8 @@
425m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o450m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
426m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o451m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
427m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o452m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
428m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o453m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
454m_sparsity_handling.o: precision.o
429m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o455m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
430m_stress.o: precision.o456m_stress.o: precision.o
431m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o457m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -537,9 +563,10 @@
537m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o563m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
538m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o564m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
539m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o565m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
540m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o566m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
541m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o567m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
542m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o568m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
569m_ts_pivot.o: precision.o
543m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o570m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
544m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o571m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
545m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o572m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -682,8 +709,8 @@
682rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o709rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
683rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o710rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
684rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o711rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
685read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o712read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
686read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o713read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
687read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o714read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
688read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o715read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
689readsp.o: parallel.o precision.o sys.o716readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -750,30 +777,32 @@
750siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o777siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
751siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o778siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
752siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o779siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
753siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o780siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
754siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o781siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
755siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o782siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
756siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o783siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
757siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o784siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
758siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o785siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
759siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o786siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
760siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o787siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
761siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o788siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
762siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o789siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
763siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o790siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
764siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o791siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
765siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o792siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
793siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
794siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
766siesta_geom.o: precision.o795siesta_geom.o: precision.o
767siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o796siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
768siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o797siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
769siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o798siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
770siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o799siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
771siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o800siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
772siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o801siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
773siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o802siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
774siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o803siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
775siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o804siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
776siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o805siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
777siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o806siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
778siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o807siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
779siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o808siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -805,18 +834,17 @@
805state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o834state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
806state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o835state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
807struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o836struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
808struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o837struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
809struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o838struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
810struct_init.o: units.o zmatrix.o839struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
811sys.o: parallel.o840sys.o: parallel.o
812timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o841timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
813timer.o: timer_tree.o842timer.o: timer_tree.o
814timer_tree.o: m_walltime.o843timer_tree.o: m_walltime.o
815transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o844transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
816ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o845ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
817ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o846ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
818ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o847ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
819ts_init.o: siesta_options.o
820ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o848ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
821ts_show_regions.o: precision.o units.o849ts_show_regions.o: precision.o units.o
822typecell.o: precision.o850typecell.o: precision.o
@@ -828,6 +856,7 @@
828vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o856vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
829vmatsp.o: meshphi.o precision.o857vmatsp.o: meshphi.o precision.o
830vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o858vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
859wavefunctions.o: parallel.o precision.o
831write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o860write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
832write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o861write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
833write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o862write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -948,6 +977,7 @@
948m_ksv.o: ksv.o977m_ksv.o: ksv.o
949m_ksvinit.o: ksvinit.o978m_ksvinit.o: ksvinit.o
950m_ldau.o: ldau.o979m_ldau.o: ldau.o
980m_linpack.o: linpack.o
951m_local_dos.o: local_DOS.o981m_local_dos.o: local_DOS.o
952m_matel_registry.o: matel_registry.o982m_matel_registry.o: matel_registry.o
953m_minvec.o: minvec.o983m_minvec.o: minvec.o
@@ -992,6 +1022,8 @@
992m_vmat.o: vmat.o1022m_vmat.o: vmat.o
993m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1023m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
994m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1024m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1025matdiagon.o: m_matdiag.o
1026matswinversion.o: m_matswinvers.o
995mtprng.o: m_uuid.o1027mtprng.o: m_uuid.o
996neighbour.o: mneighb.o1028neighbour.o: mneighb.o
997on_core.o: onmod.o1029on_core.o: onmod.o
9981030
=== modified file 'Util/TS/TBtrans/Makefile'
--- Util/TS/TBtrans/Makefile 2016-10-10 13:00:00 +0000
+++ Util/TS/TBtrans/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -364,6 +364,8 @@
364cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o364cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
365cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o365cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
366cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o366cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
367changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
368changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
367chemical.o: parallel.o precision.o sys.o369chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
368chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o370chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
369chkdim.o: sys.o371chkdim.o: sys.o
@@ -420,12 +422,12 @@
420dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o422dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
421dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o423dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
422dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o424dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
423dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o425dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
424dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o426dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
425dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o427dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
426dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o428dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
427dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o429dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
428dhscf.o: vmat.o430dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
429diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o431diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
430diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o432diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
431diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o433diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -453,7 +455,7 @@
453domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o455domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
454doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o456doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
455dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o457dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
456dynamics.o: precision.o sys.o units.o458dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
457egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o459egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
458egandd.o: onmod.o precision.o sys.o460egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
459eggbox.o: parallel.o precision.o461eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -462,6 +464,10 @@
462elpa2.o: elpa1.o464elpa2.o: elpa1.o
463ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o465ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
464ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o466ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
467evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
468evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
469evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
470evolk.o: sys.o wavefunctions.o
465extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o471extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
466extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o472extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
467extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o473extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -502,9 +508,9 @@
502initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o508initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
503initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o509initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
504initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o510initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
505initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o511initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
506initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o512initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
507initparallel.o: spatial.o sys.o513initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
508io.o: sys.o514io.o: sys.o
509iocg.o: files.o precision.o sys.o515iocg.o: files.o precision.o sys.o
510iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o516iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -563,7 +569,9 @@
563m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o569m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
564m_energies.o: precision.o570m_energies.o: precision.o
565m_eo.o: precision.o571m_eo.o: precision.o
572m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
566m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o573m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
574m_fastconv_dims.o: precision.o
567m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o575m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
568m_fire.o: parallel.o precision.o576m_fire.o: parallel.o precision.o
569m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o577m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -585,10 +593,14 @@
585m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o593m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
586m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o594m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
587m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o595m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
596m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
597m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
598m_initwf.o: wavefunctions.o
588m_integrate.o: precision.o599m_integrate.o: precision.o
589m_io.o: sys.o600m_io.o: sys.o
590m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o601m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
591m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o602m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
603m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
592m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o604m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
593m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o605m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
594m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o606m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -596,9 +608,13 @@
596m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o608m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
597m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o609m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
598m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o610m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
611m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
612m_iotddft.o: wavefunctions.o
599m_kinetic.o: precision.o613m_kinetic.o: precision.o
600m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o614m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
615m_matdiag.o: precision.o
601m_matio.o: alloc.o parallel.o616m_matio.o: alloc.o parallel.o
617m_matswinvers.o: precision.o
602m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o618m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
603m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o619m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
604m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o620m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -646,6 +662,15 @@
646m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o662m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
647m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o663m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
648m_planewavematrixvar.o: precision.o664m_planewavematrixvar.o: precision.o
665m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
666m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
667m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
668m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
669m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
670m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
671m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
672m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
673m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
649m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o674m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
650m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o675m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
651m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o676m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -988,30 +1013,32 @@
988siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o1013siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
989siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o1014siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
990siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o1015siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
991siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o1016siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
992siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o1017siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
993siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o1018siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
994siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o1019siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
995siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o1020siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
996siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o1021siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
997siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o1022siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
998siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o1023siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
999siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o1024siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
1000siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o1025siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
1001siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o1026siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
1002siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o1027siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
1003siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o1028siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
1029siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
1030siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
1004siesta_geom.o: precision.o1031siesta_geom.o: precision.o
1005siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o1032siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
1006siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o1033siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
1007siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o1034siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
1008siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o1035siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
1009siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o1036siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
1010siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o1037siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
1011siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o1038siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
1012siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o1039siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
1013siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o1040siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
1014siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o1041siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
1015siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o1042siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
1016siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o1043siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
1017siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o1044siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -1043,9 +1070,9 @@
1043state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o1070state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
1044state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o1071state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
1045struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o1072struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
1046struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o1073struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
1047struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o1074struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
1048struct_init.o: units.o zmatrix.o1075struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
1049sys.o: parallel.o1076sys.o: parallel.o
1050timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o1077timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
1051timer.o: timer_tree.o1078timer.o: timer_tree.o
@@ -1065,6 +1092,7 @@
1065vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o1092vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
1066vmatsp.o: meshphi.o precision.o1093vmatsp.o: meshphi.o precision.o
1067vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o1094vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
1095wavefunctions.o: parallel.o precision.o
1068write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o1096write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
1069write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o1097write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
1070write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o1098write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -1310,6 +1338,8 @@
1310m_vmat.o: vmat.o1338m_vmat.o: vmat.o
1311m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1339m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
1312m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1340m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1341matdiagon.o: m_matdiag.o
1342matswinversion.o: m_matswinvers.o
1313mtprng.o: m_uuid.o1343mtprng.o: m_uuid.o
1314neighbour.o: mneighb.o1344neighbour.o: mneighb.o
1315on_core.o: onmod.o1345on_core.o: onmod.o
13161346
=== modified file 'Util/TS/ts2ts/Makefile'
--- Util/TS/ts2ts/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/TS/ts2ts/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -111,7 +111,7 @@
111bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o111bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
112bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o112bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
113bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o113bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
114cart2frac.o: sys.o114cart2frac.o: precision.o sys.o
115cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o115cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
116cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o116cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
117cell_broyden_optim.o: zmatrix.o117cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -123,6 +123,8 @@
123cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o123cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
124cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o124cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
125cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o125cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
126changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
127changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
126chemical.o: parallel.o precision.o sys.o128chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
127chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o129chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
128chkdim.o: sys.o130chkdim.o: sys.o
@@ -179,17 +181,17 @@
179denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o181denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
180denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o182denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
181densematrix.o: alloc.o precision.o183densematrix.o: alloc.o precision.o
182detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o184detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
183dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o185dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
184dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o186dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
185dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o187dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
186dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o188dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
187dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o189dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
188dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o190dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
189dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o191dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
190dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o192dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
191dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o193dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
192dhscf.o: vmat.o194dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
193diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o195diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
194diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o196diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
195diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o197diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -217,7 +219,7 @@
217domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o219domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
218doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o220doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
219dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o221dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
220dynamics.o: precision.o sys.o units.o222dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
221egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o223egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
222egandd.o: onmod.o precision.o sys.o224egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
223eggbox.o: parallel.o precision.o225eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -226,6 +228,10 @@
226elpa2.o: elpa1.o228elpa2.o: elpa1.o
227ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o229ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
228ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o230ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
231evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
232evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
233evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
234evolk.o: sys.o wavefunctions.o
229extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o235extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
230extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o236extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
231extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o237extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -266,9 +272,9 @@
266initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o272initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
267initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o273initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
268initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o274initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
269initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o275initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
270initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o276initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
271initparallel.o: spatial.o sys.o277initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
272io.o: sys.o278io.o: sys.o
273iocg.o: files.o precision.o sys.o279iocg.o: files.o precision.o sys.o
274iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o280iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -327,7 +333,9 @@
327m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o333m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
328m_energies.o: precision.o334m_energies.o: precision.o
329m_eo.o: precision.o335m_eo.o: precision.o
336m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
330m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o337m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
338m_fastconv_dims.o: precision.o
331m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o339m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
332m_fire.o: parallel.o precision.o340m_fire.o: parallel.o precision.o
333m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o341m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -349,10 +357,14 @@
349m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o357m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
350m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o358m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
351m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o359m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
360m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
361m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
362m_initwf.o: wavefunctions.o
352m_integrate.o: precision.o363m_integrate.o: precision.o
353m_io.o: sys.o364m_io.o: sys.o
354m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o365m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
355m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o366m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
367m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
356m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o368m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
357m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o369m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
358m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o370m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -360,9 +372,13 @@
360m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o372m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
361m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o373m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
362m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o374m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
375m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
376m_iotddft.o: wavefunctions.o
363m_kinetic.o: precision.o377m_kinetic.o: precision.o
364m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o378m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
379m_matdiag.o: precision.o
365m_matio.o: alloc.o parallel.o380m_matio.o: alloc.o parallel.o
381m_matswinvers.o: precision.o
366m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o382m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
367m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o383m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
368m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o384m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -410,6 +426,15 @@
410m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o426m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
411m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o427m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
412m_planewavematrixvar.o: precision.o428m_planewavematrixvar.o: precision.o
429m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
430m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
431m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
432m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
433m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
434m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
435m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
436m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
437m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
413m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o438m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
414m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o439m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
415m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o440m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -425,7 +450,8 @@
425m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o450m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
426m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o451m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
427m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o452m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
428m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o453m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
454m_sparsity_handling.o: precision.o
429m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o455m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
430m_stress.o: precision.o456m_stress.o: precision.o
431m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o457m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -537,9 +563,10 @@
537m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o563m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
538m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o564m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
539m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o565m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
540m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o566m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
541m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o567m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
542m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o568m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
569m_ts_pivot.o: precision.o
543m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o570m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
544m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o571m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
545m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o572m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -682,8 +709,8 @@
682rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o709rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
683rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o710rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
684rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o711rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
685read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o712read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
686read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o713read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
687read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o714read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
688read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o715read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
689readsp.o: parallel.o precision.o sys.o716readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -750,30 +777,32 @@
750siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o777siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
751siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o778siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
752siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o779siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
753siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o780siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
754siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o781siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
755siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o782siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
756siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o783siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
757siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o784siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
758siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o785siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
759siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o786siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
760siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o787siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
761siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o788siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
762siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o789siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
763siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o790siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
764siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o791siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
765siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o792siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
793siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
794siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
766siesta_geom.o: precision.o795siesta_geom.o: precision.o
767siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o796siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
768siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o797siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
769siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o798siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
770siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o799siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
771siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o800siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
772siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o801siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
773siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o802siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
774siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o803siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
775siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o804siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
776siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o805siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
777siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o806siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
778siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o807siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
779siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o808siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -805,18 +834,17 @@
805state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o834state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
806state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o835state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
807struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o836struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
808struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o837struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
809struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o838struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
810struct_init.o: units.o zmatrix.o839struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
811sys.o: parallel.o840sys.o: parallel.o
812timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o841timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
813timer.o: timer_tree.o842timer.o: timer_tree.o
814timer_tree.o: m_walltime.o843timer_tree.o: m_walltime.o
815transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o844transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
816ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o845ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
817ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o846ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
818ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o847ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
819ts_init.o: siesta_options.o
820ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o848ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
821ts_show_regions.o: precision.o units.o849ts_show_regions.o: precision.o units.o
822typecell.o: precision.o850typecell.o: precision.o
@@ -828,6 +856,7 @@
828vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o856vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
829vmatsp.o: meshphi.o precision.o857vmatsp.o: meshphi.o precision.o
830vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o858vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
859wavefunctions.o: parallel.o precision.o
831write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o860write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
832write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o861write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
833write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o862write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -945,6 +974,7 @@
945m_ksv.o: ksv.o974m_ksv.o: ksv.o
946m_ksvinit.o: ksvinit.o975m_ksvinit.o: ksvinit.o
947m_ldau.o: ldau.o976m_ldau.o: ldau.o
977m_linpack.o: linpack.o
948m_local_dos.o: local_DOS.o978m_local_dos.o: local_DOS.o
949m_matel_registry.o: matel_registry.o979m_matel_registry.o: matel_registry.o
950m_minvec.o: minvec.o980m_minvec.o: minvec.o
@@ -989,6 +1019,8 @@
989m_vmat.o: vmat.o1019m_vmat.o: vmat.o
990m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1020m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
991m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1021m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1022matdiagon.o: m_matdiag.o
1023matswinversion.o: m_matswinvers.o
992mtprng.o: m_uuid.o1024mtprng.o: m_uuid.o
993neighbour.o: mneighb.o1025neighbour.o: mneighb.o
994on_core.o: onmod.o1026on_core.o: onmod.o
9951027
=== modified file 'Util/TS/tshs2tshs/Makefile'
--- Util/TS/tshs2tshs/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/TS/tshs2tshs/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -169,7 +169,7 @@
169bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o169bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
170bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o170bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
171bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o171bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
172cart2frac.o: sys.o172cart2frac.o: precision.o sys.o
173cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o173cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
174cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o174cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
175cell_broyden_optim.o: zmatrix.o175cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -181,6 +181,8 @@
181cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o181cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
182cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o182cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
183cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o183cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
184changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
185changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
184chemical.o: parallel.o precision.o sys.o186chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
185chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o187chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
186chkdim.o: sys.o188chkdim.o: sys.o
@@ -237,17 +239,17 @@
237denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o239denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
238denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o240denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
239densematrix.o: alloc.o precision.o241densematrix.o: alloc.o precision.o
240detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o242detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
241dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o243dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
242dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o244dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
243dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o245dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
244dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o246dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
245dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o247dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
246dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o248dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
247dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o249dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
248dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o250dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
249dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o251dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
250dhscf.o: vmat.o252dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
251diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o253diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
252diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o254diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
253diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o255diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -275,7 +277,7 @@
275domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o277domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
276doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o278doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
277dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o279dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
278dynamics.o: precision.o sys.o units.o280dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
279egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o281egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
280egandd.o: onmod.o precision.o sys.o282egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
281eggbox.o: parallel.o precision.o283eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -284,6 +286,10 @@
284elpa2.o: elpa1.o286elpa2.o: elpa1.o
285ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o287ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
286ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o288ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
289evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
290evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
291evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
292evolk.o: sys.o wavefunctions.o
287extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o293extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
288extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o294extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
289extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o295extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -324,9 +330,9 @@
324initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o330initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
325initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o331initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
326initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o332initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
327initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o333initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
328initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o334initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
329initparallel.o: spatial.o sys.o335initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
330io.o: sys.o336io.o: sys.o
331iocg.o: files.o precision.o sys.o337iocg.o: files.o precision.o sys.o
332iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o338iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -385,7 +391,9 @@
385m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o391m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
386m_energies.o: precision.o392m_energies.o: precision.o
387m_eo.o: precision.o393m_eo.o: precision.o
394m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
388m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o395m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
396m_fastconv_dims.o: precision.o
389m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o397m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
390m_fire.o: parallel.o precision.o398m_fire.o: parallel.o precision.o
391m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o399m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -407,10 +415,14 @@
407m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o415m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
408m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o416m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
409m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o417m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
418m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
419m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
420m_initwf.o: wavefunctions.o
410m_integrate.o: precision.o421m_integrate.o: precision.o
411m_io.o: sys.o422m_io.o: sys.o
412m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o423m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
413m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o424m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
425m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
414m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o426m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
415m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o427m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
416m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o428m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -418,9 +430,13 @@
418m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o430m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
419m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o431m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
420m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o432m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
433m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
434m_iotddft.o: wavefunctions.o
421m_kinetic.o: precision.o435m_kinetic.o: precision.o
422m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o436m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
437m_matdiag.o: precision.o
423m_matio.o: alloc.o parallel.o438m_matio.o: alloc.o parallel.o
439m_matswinvers.o: precision.o
424m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o440m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
425m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o441m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
426m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o442m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -468,6 +484,15 @@
468m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o484m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
469m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o485m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
470m_planewavematrixvar.o: precision.o486m_planewavematrixvar.o: precision.o
487m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
488m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
489m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
490m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
491m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
492m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
493m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
494m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
495m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
471m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o496m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
472m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o497m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
473m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o498m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -483,7 +508,8 @@
483m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o508m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
484m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o509m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
485m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o510m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
486m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o511m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
512m_sparsity_handling.o: precision.o
487m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o513m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
488m_stress.o: precision.o514m_stress.o: precision.o
489m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o515m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -595,9 +621,10 @@
595m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o621m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
596m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o622m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
597m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o623m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
598m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o624m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
599m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o625m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
600m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o626m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
627m_ts_pivot.o: precision.o
601m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o628m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
602m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o629m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
603m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o630m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -740,8 +767,8 @@
740rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o767rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
741rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o768rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
742rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o769rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
743read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o770read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
744read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o771read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
745read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o772read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
746read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o773read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
747readsp.o: parallel.o precision.o sys.o774readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -808,30 +835,32 @@
808siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o835siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
809siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o836siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
810siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o837siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
811siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o838siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
812siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o839siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
813siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o840siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
814siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o841siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
815siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o842siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
816siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o843siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
817siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o844siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
818siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o845siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
819siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o846siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
820siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o847siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
821siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o848siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
822siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o849siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
823siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o850siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
851siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
852siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
824siesta_geom.o: precision.o853siesta_geom.o: precision.o
825siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o854siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
826siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o855siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
827siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o856siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
828siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o857siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
829siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o858siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
830siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o859siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
831siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o860siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
832siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o861siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
833siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o862siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
834siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o863siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
835siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o864siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
836siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o865siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
837siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o866siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -863,18 +892,17 @@
863state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o892state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
864state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o893state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
865struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o894struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
866struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o895struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
867struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o896struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
868struct_init.o: units.o zmatrix.o897struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
869sys.o: parallel.o898sys.o: parallel.o
870timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o899timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
871timer.o: timer_tree.o900timer.o: timer_tree.o
872timer_tree.o: m_walltime.o901timer_tree.o: m_walltime.o
873transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o902transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
874ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o903ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
875ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o904ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
876ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o905ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
877ts_init.o: siesta_options.o
878ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o906ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
879ts_show_regions.o: precision.o units.o907ts_show_regions.o: precision.o units.o
880typecell.o: precision.o908typecell.o: precision.o
@@ -886,6 +914,7 @@
886vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o914vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
887vmatsp.o: meshphi.o precision.o915vmatsp.o: meshphi.o precision.o
888vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o916vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
917wavefunctions.o: parallel.o precision.o
889write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o918write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
890write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o919write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
891write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o920write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -1007,6 +1036,7 @@
1007m_ksv.o: ksv.o1036m_ksv.o: ksv.o
1008m_ksvinit.o: ksvinit.o1037m_ksvinit.o: ksvinit.o
1009m_ldau.o: ldau.o1038m_ldau.o: ldau.o
1039m_linpack.o: linpack.o
1010m_local_dos.o: local_DOS.o1040m_local_dos.o: local_DOS.o
1011m_matel_registry.o: matel_registry.o1041m_matel_registry.o: matel_registry.o
1012m_minvec.o: minvec.o1042m_minvec.o: minvec.o
@@ -1051,6 +1081,8 @@
1051m_vmat.o: vmat.o1081m_vmat.o: vmat.o
1052m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1082m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
1053m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1083m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1084matdiagon.o: m_matdiag.o
1085matswinversion.o: m_matswinvers.o
1054mtprng.o: m_uuid.o1086mtprng.o: m_uuid.o
1055neighbour.o: mneighb.o1087neighbour.o: mneighb.o
1056on_core.o: onmod.o1088on_core.o: onmod.o
10571089
=== modified file 'Util/VCA/Makefile'
--- Util/VCA/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000
+++ Util/VCA/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -142,7 +142,7 @@
142bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o142bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o
143bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o143bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o
144bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o144bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o
145cart2frac.o: sys.o145cart2frac.o: precision.o sys.o
146cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o146cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
147cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o147cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o
148cell_broyden_optim.o: zmatrix.o148cell_broyden_optim.o: zmatrix.o
@@ -154,6 +154,8 @@
154cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o154cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o
155cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o155cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o
156cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o156cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o
157changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
158changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
157chemical.o: parallel.o precision.o sys.o159chemical.o: parallel.o precision.o sys.o
158chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o160chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
159chkdim.o: sys.o161chkdim.o: sys.o
@@ -205,17 +207,17 @@
205denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o207denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
206denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o208denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o
207densematrix.o: alloc.o precision.o209densematrix.o: alloc.o precision.o
208detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o210detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
209dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o211dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o
210dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o212dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
211dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o213dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o
212dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o214dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o
213dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o215dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o
214dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o216dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o
215dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o217dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o
216dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o218dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o
217dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o219dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o
218dhscf.o: vmat.o220dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o
219diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o221diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
220diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o222diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
221diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o223diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -243,7 +245,7 @@
243domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o245domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o
244doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o246doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o
245dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o247dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o
246dynamics.o: precision.o sys.o units.o248dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o
247egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o249egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o
248egandd.o: onmod.o precision.o sys.o250egandd.o: onmod.o precision.o sys.o
249eggbox.o: parallel.o precision.o251eggbox.o: parallel.o precision.o
@@ -252,6 +254,10 @@
252elpa2.o: elpa1.o254elpa2.o: elpa1.o
253ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o255ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
254ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o256ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o
257evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o
258evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o
259evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o
260evolk.o: sys.o wavefunctions.o
255extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o261extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o
256extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o262extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o
257extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o263extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -292,9 +298,9 @@
292initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o298initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o
293initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o299initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o
294initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o300initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o
295initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o301initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o
296initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o302initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
297initparallel.o: spatial.o sys.o303initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o
298io.o: sys.o304io.o: sys.o
299iocg.o: files.o precision.o sys.o305iocg.o: files.o precision.o sys.o
300iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o306iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
@@ -353,7 +359,9 @@
353m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o359m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o
354m_energies.o: precision.o360m_energies.o: precision.o
355m_eo.o: precision.o361m_eo.o: precision.o
362m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
356m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o363m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o
364m_fastconv_dims.o: precision.o
357m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o365m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o
358m_fire.o: parallel.o precision.o366m_fire.o: parallel.o precision.o
359m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o367m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
@@ -375,10 +383,14 @@
375m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o383m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o
376m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o384m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o
377m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o385m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
386m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o
387m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o
388m_initwf.o: wavefunctions.o
378m_integrate.o: precision.o389m_integrate.o: precision.o
379m_io.o: sys.o390m_io.o: sys.o
380m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o391m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o
381m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o392m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o
393m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o
382m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o394m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o
383m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o395m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o
384m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o396m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o
@@ -386,9 +398,13 @@
386m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o398m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
387m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o399m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o
388m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o400m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o
401m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o
402m_iotddft.o: wavefunctions.o
389m_kinetic.o: precision.o403m_kinetic.o: precision.o
390m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o404m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o
405m_matdiag.o: precision.o
391m_matio.o: alloc.o parallel.o406m_matio.o: alloc.o parallel.o
407m_matswinvers.o: precision.o
392m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o408m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o
393m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o409m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o
394m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o410m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o
@@ -436,6 +452,15 @@
436m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o452m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o
437m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o453m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o
438m_planewavematrixvar.o: precision.o454m_planewavematrixvar.o: precision.o
455m_plot_1d_arr3d.o: precision.o
456m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o
457m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o
458m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o
459m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o
460m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o
461m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o
462m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o
463m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o
439m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o464m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o
440m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o465m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o
441m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o466m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o
@@ -451,7 +476,8 @@
451m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o476m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o
452m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o477m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o
453m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o478m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o
454m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o479m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o
480m_sparsity_handling.o: precision.o
455m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o481m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o
456m_stress.o: precision.o482m_stress.o: precision.o
457m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o483m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o
@@ -563,9 +589,10 @@
563m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o589m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o
564m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o590m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o
565m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o591m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
566m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o592m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o
567m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o593m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o
568m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o594m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o
595m_ts_pivot.o: precision.o
569m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o596m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o
570m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o597m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o
571m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o598m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o
@@ -708,8 +735,8 @@
708rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o735rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o
709rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o736rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o
710rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o737rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o
711read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o738read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o
712read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o739read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o
713read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o740read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o
714read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o741read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o
715readsp.o: parallel.o precision.o sys.o742readsp.o: parallel.o precision.o sys.o
@@ -776,30 +803,32 @@
776siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o803siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o
777siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o804siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o
778siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o805siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o
779siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o806siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o
780siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o807siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o
781siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o808siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o
782siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o809siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o
783siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o810siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o
784siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o811siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o
785siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o812siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o
786siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o813siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o
787siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o814siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o
788siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o815siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o
789siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o816siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o
790siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o817siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o
791siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o818siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o
819siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o
820siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o
792siesta_geom.o: precision.o821siesta_geom.o: precision.o
793siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o822siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o
794siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o823siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o
795siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o824siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o
796siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o825siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o
797siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o826siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o
798siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o827siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o
799siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o828siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o
800siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o829siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o
801siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o830siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o
802siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o831siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o
803siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o832siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o
804siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o833siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o
805siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o834siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o
@@ -831,18 +860,17 @@
831state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o860state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o
832state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o861state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o
833struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o862struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o
834struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o863struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o
835struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o864struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o
836struct_init.o: units.o zmatrix.o865struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o
837sys.o: parallel.o866sys.o: parallel.o
838timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o867timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o
839timer.o: timer_tree.o868timer.o: timer_tree.o
840timer_tree.o: m_walltime.o869timer_tree.o: m_walltime.o
841transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o870transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o
842ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o871ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o
843ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o872ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o
844ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o873ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o
845ts_init.o: siesta_options.o
846ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o874ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o
847ts_show_regions.o: precision.o units.o875ts_show_regions.o: precision.o units.o
848typecell.o: precision.o876typecell.o: precision.o
@@ -854,6 +882,7 @@
854vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o882vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o
855vmatsp.o: meshphi.o precision.o883vmatsp.o: meshphi.o precision.o
856vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o884vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o
885wavefunctions.o: parallel.o precision.o
857write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o886write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o
858write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o887write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o
859write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o888write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o
@@ -974,6 +1003,7 @@
974m_ksv.o: ksv.o1003m_ksv.o: ksv.o
975m_ksvinit.o: ksvinit.o1004m_ksvinit.o: ksvinit.o
976m_ldau.o: ldau.o1005m_ldau.o: ldau.o
1006m_linpack.o: linpack.o
977m_local_dos.o: local_DOS.o1007m_local_dos.o: local_DOS.o
978m_matel_registry.o: matel_registry.o1008m_matel_registry.o: matel_registry.o
979m_minvec.o: minvec.o1009m_minvec.o: minvec.o
@@ -1018,6 +1048,8 @@
1018m_vmat.o: vmat.o1048m_vmat.o: vmat.o
1019m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o1049m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o
1020m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o1050m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o
1051matdiagon.o: m_matdiag.o
1052matswinversion.o: m_matswinvers.o
1021mtprng.o: m_uuid.o1053mtprng.o: m_uuid.o
1022neighbour.o: mneighb.o1054neighbour.o: mneighb.o
1023on_core.o: onmod.o1055on_core.o: onmod.o
10241056
=== modified file 'version.info'
--- version.info 2016-10-20 12:18:03 +0000
+++ version.info 2016-11-22 08:16:45 +0000
@@ -1,1 +1,1 @@
1trunk-572--kovalp-manual-11trunk-572--kovalp-manual-1--npapior-1

Subscribers

People subscribed via source and target branches

to all changes: