Merge lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes into lp:~kovalp/siesta/siesta
- kovalp-fixes
- Merge into siesta
Proposed by
Nick Papior
Status: | Merged |
---|---|
Merged at revision: | 623 |
Proposed branch: | lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes |
Merge into: | lp:~kovalp/siesta/siesta |
Diff against target: |
3313 lines (+891/-546) 21 files modified
Src/Makefile (+30/-40) Src/elpa2_kernels.f90 (+3/-2) Src/m_fastconv_dims.F90 (+1/-8) Src/m_mpi_stop.F90 (+2/-5) Src/m_plot_1d_arr3d.F90 (+1/-2) Src/m_poisson_fdf.F90 (+8/-4) Src/m_poisson_obc_comm.F90 (+4/-3) Src/m_poisson_obc_fastconv.F90 (+10/-4) Src/m_poisson_obc_fastconv_r2c.F90 (+5/-5) Util/COOP/Makefile (+78/-44) Util/Denchar/Src/Makefile (+78/-44) Util/Gen-basis/Makefile (+76/-44) Util/Grimme/Makefile (+76/-44) Util/Helpers/Makefile (+76/-44) Util/STM/ol-stm/Src/Makefile (+76/-44) Util/SpPivot/Makefile (+76/-44) Util/TS/TBtrans/Makefile (+62/-32) Util/TS/ts2ts/Makefile (+76/-44) Util/TS/tshs2tshs/Makefile (+76/-44) Util/VCA/Makefile (+76/-44) version.info (+1/-1) |
To merge this branch: | bzr merge lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes |
Related bugs: |
Reviewer | Review Type | Date Requested | Status |
---|---|---|---|
Petr Koval | Approve | ||
Review via email: mp+311468@code.launchpad.net |
Commit message
Description of the change
There were a few missing items that you have missed.
Please, read the commit log and see what I have changed. I have runned your example with the committed code without problems. But perhaps you should run it again.
To post a comment you must log in.
Revision history for this message
Petr Koval (kovalp) : | # |
review:
Approve
Revision history for this message
Petr Koval (kovalp) wrote : | # |
Preview Diff
[H/L] Next/Prev Comment, [J/K] Next/Prev File, [N/P] Next/Prev Hunk
1 | === modified file 'Src/Makefile' | |||
2 | --- Src/Makefile 2016-11-17 13:54:18 +0000 | |||
3 | +++ Src/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
4 | @@ -675,9 +675,7 @@ | |||
5 | 675 | compute_rhog.o: siesta_options.o sparse_matrices.o | 675 | compute_rhog.o: siesta_options.o sparse_matrices.o |
6 | 676 | conjgr.o: precision.o | 676 | conjgr.o: precision.o |
7 | 677 | conjgr_old.o: precision.o | 677 | conjgr_old.o: precision.o |
11 | 678 | coor.o: alloc.o parallel.o precision.o siesta_geom.o sys.o units.o zmatrix.o \ | 678 | coor.o: alloc.o parallel.o precision.o siesta_geom.o sys.o units.o zmatrix.o |
9 | 679 | m_poisson_fdf.o | ||
10 | 680 | |||
12 | 681 | coxmol.o: files.o periodic_table.o precision.o | 679 | coxmol.o: files.o periodic_table.o precision.o |
13 | 682 | create_Sparsity_SC.o: class_Sparsity.o geom_helper.o intrinsic_missing.o | 680 | create_Sparsity_SC.o: class_Sparsity.o geom_helper.o intrinsic_missing.o |
14 | 683 | create_Sparsity_Union.o: class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 681 | create_Sparsity_Union.o: class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
15 | @@ -692,31 +690,14 @@ | |||
16 | 692 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 690 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
17 | 693 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 691 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
18 | 694 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 692 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
37 | 695 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o \ | 693 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
20 | 696 | m_poisson_fdf.o m_poisson_switch.o | ||
21 | 697 | |||
22 | 698 | m_poisson_fdf.o : $(FDF) m_char.o | ||
23 | 699 | |||
24 | 700 | m_poisson_switch.o: poison.o m_poisson_obc_fastconv.o | ||
25 | 701 | |||
26 | 702 | m_poisson_obc_fastconv.o: m_plot_1d_arr3d.o m_fastconv_dims.o \ | ||
27 | 703 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o m_mpi_stop.o | ||
28 | 704 | |||
29 | 705 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_plot_1d_arr3d.o m_fastconv_dims.o \ | ||
30 | 706 | m_poisson_obc_comm.o cellsubs.o | ||
31 | 707 | |||
32 | 708 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o siesta_geom.o atmfuncs.o \ | ||
33 | 709 | $(FDF) parallel.o m_mpi_stop.o | ||
34 | 710 | |||
35 | 711 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
36 | 712 | |||
38 | 713 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 694 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
39 | 714 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o | 695 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
45 | 715 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 696 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
46 | 716 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 697 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
47 | 717 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 698 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
48 | 718 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 699 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
49 | 719 | dhscf.o: vmat.o | 700 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
50 | 720 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 701 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
51 | 721 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 702 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
52 | 722 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 703 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
53 | @@ -797,9 +778,9 @@ | |||
54 | 797 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 778 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
55 | 798 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 779 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
56 | 799 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 780 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
60 | 800 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 781 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
61 | 801 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 782 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
62 | 802 | initparallel.o: spatial.o sys.o m_poisson_fdf.o | 783 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
63 | 803 | io.o: sys.o | 784 | io.o: sys.o |
64 | 804 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 785 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
65 | 805 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 786 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
66 | @@ -860,6 +841,7 @@ | |||
67 | 860 | m_eo.o: precision.o | 841 | m_eo.o: precision.o |
68 | 861 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 842 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
69 | 862 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 843 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
70 | 844 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
71 | 863 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 845 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
72 | 864 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 846 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
73 | 865 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 847 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
74 | @@ -950,6 +932,15 @@ | |||
75 | 950 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 932 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
76 | 951 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 933 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
77 | 952 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 934 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
78 | 935 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
79 | 936 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
80 | 937 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
81 | 938 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
82 | 939 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
83 | 940 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
84 | 941 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
85 | 942 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
86 | 943 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
87 | 953 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 944 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
88 | 954 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 945 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
89 | 955 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 946 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
90 | @@ -1312,12 +1303,12 @@ | |||
91 | 1312 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 1303 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
92 | 1313 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 1304 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
93 | 1314 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 1305 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
100 | 1315 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 1306 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
101 | 1316 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 1307 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
102 | 1317 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 1308 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
103 | 1318 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 1309 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
104 | 1319 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 1310 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
105 | 1320 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 1311 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
106 | 1321 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 1312 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
107 | 1322 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 1313 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
108 | 1323 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 1314 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
109 | @@ -1348,11 +1339,10 @@ | |||
110 | 1348 | state_init.o: m_ts_tri_init.o normalize_dm.o overlap.o parallel.o | 1339 | state_init.o: m_ts_tri_init.o normalize_dm.o overlap.o parallel.o |
111 | 1349 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 1340 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
112 | 1350 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 1341 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
118 | 1351 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o \ | 1342 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
119 | 1352 | m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o | 1343 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
120 | 1353 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 1344 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
121 | 1354 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 1345 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
117 | 1355 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | ||
122 | 1356 | sys.o: parallel.o | 1346 | sys.o: parallel.o |
123 | 1357 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 1347 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
124 | 1358 | timer.o: timer_tree.o | 1348 | timer.o: timer_tree.o |
125 | 1359 | 1349 | ||
126 | === modified file 'Src/elpa2_kernels.f90' | |||
127 | --- Src/elpa2_kernels.f90 2016-10-27 08:15:19 +0000 | |||
128 | +++ Src/elpa2_kernels.f90 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
129 | @@ -18,7 +18,7 @@ | |||
130 | 18 | integer, parameter :: dprec = kind(1.d0) | 18 | integer, parameter :: dprec = kind(1.d0) |
131 | 19 | 19 | ||
132 | 20 | integer, intent(in) :: nb, nq, ldq, ldh | 20 | integer, intent(in) :: nb, nq, ldq, ldh |
134 | 21 | real(dprec), intent(inout) :: q(ldq,*) | 21 | real(dprec), intent(inout) :: q(ldq,*) |
135 | 22 | real(dprec), intent(in) :: hh(ldh,*) | 22 | real(dprec), intent(in) :: hh(ldh,*) |
136 | 23 | 23 | ||
137 | 24 | real(dprec) s | 24 | real(dprec) s |
138 | @@ -51,7 +51,7 @@ | |||
139 | 51 | call hh_trafo_kernel_4(q(i,1),hh, nb, ldq, ldh, s) | 51 | call hh_trafo_kernel_4(q(i,1),hh, nb, ldq, ldh, s) |
140 | 52 | endif | 52 | endif |
141 | 53 | 53 | ||
143 | 54 | end subroutine | 54 | end |
144 | 55 | 55 | ||
145 | 56 | ! -------------------------------------------------------------------------------------------------- | 56 | ! -------------------------------------------------------------------------------------------------- |
146 | 57 | ! The following kernels perform the Householder transformation on Q for 12/8/4 rows. | 57 | ! The following kernels perform the Householder transformation on Q for 12/8/4 rows. |
147 | @@ -572,4 +572,5 @@ | |||
148 | 572 | enddo | 572 | enddo |
149 | 573 | 573 | ||
150 | 574 | end | 574 | end |
151 | 575 | |||
152 | 575 | ! -------------------------------------------------------------------------------------------------- | 576 | ! -------------------------------------------------------------------------------------------------- |
153 | 576 | 577 | ||
154 | === modified file 'Src/m_fastconv_dims.F90' | |||
155 | --- Src/m_fastconv_dims.F90 2016-11-16 09:58:12 +0000 | |||
156 | +++ Src/m_fastconv_dims.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
157 | @@ -9,12 +9,6 @@ | |||
158 | 9 | use precision, only : dp | 9 | use precision, only : dp |
159 | 10 | 10 | ||
160 | 11 | implicit none | 11 | implicit none |
161 | 12 | |||
162 | 13 | complex(dp), private, allocatable :: coul_r2c(:,:,:) | ||
163 | 14 | integer(8), private :: p_r2c, p_c2r | ||
164 | 15 | real(dp), allocatable, private :: io_dreal(:,:,:) | ||
165 | 16 | complex(dp), allocatable, private :: dens_r2c(:,:,:) | ||
166 | 17 | integer, private :: icall = 0 | ||
167 | 18 | 12 | ||
168 | 19 | contains | 13 | contains |
169 | 20 | 14 | ||
170 | @@ -22,7 +16,7 @@ | |||
171 | 22 | ! Computes 6 numbers out of limits for a general 1d convolution | 16 | ! Computes 6 numbers out of limits for a general 1d convolution |
172 | 23 | ! | 17 | ! |
173 | 24 | subroutine conv_lims(s1,f1,s2,f2,s3,f3,n1,n2,ncaux,saux,salloc_aux,falloc_aux) | 18 | subroutine conv_lims(s1,f1,s2,f2,s3,f3,n1,n2,ncaux,saux,salloc_aux,falloc_aux) |
175 | 25 | implicit none | 19 | |
176 | 26 | ! external | 20 | ! external |
177 | 27 | integer, intent(in) :: s1, f1, s2, f2, s3, f3 ! start/finish indices for functions in a convolution f3 = f1*f2 | 21 | integer, intent(in) :: s1, f1, s2, f2, s3, f3 ! start/finish indices for functions in a convolution f3 = f1*f2 |
178 | 28 | integer, intent(out) :: n1,n2,ncaux,saux,salloc_aux,falloc_aux | 22 | integer, intent(out) :: n1,n2,ncaux,saux,salloc_aux,falloc_aux |
179 | @@ -40,7 +34,6 @@ | |||
180 | 40 | ! Calculate the limits for FFTW r2c transform | 34 | ! Calculate the limits for FFTW r2c transform |
181 | 41 | ! | 35 | ! |
182 | 42 | subroutine conv_calc_r2c_dims(nff_in_1, nff_in_2, nff_complex, nff_real) | 36 | subroutine conv_calc_r2c_dims(nff_in_1, nff_in_2, nff_complex, nff_real) |
183 | 43 | implicit none | ||
184 | 44 | integer, intent(in) :: nff_in_1, nff_in_2 | 37 | integer, intent(in) :: nff_in_1, nff_in_2 |
185 | 45 | integer, intent(out) :: nff_complex, nff_real | 38 | integer, intent(out) :: nff_complex, nff_real |
186 | 46 | nff_real = (nff_in_1+nff_in_2) | 39 | nff_real = (nff_in_1+nff_in_2) |
187 | 47 | 40 | ||
188 | === modified file 'Src/m_mpi_stop.F90' | |||
189 | --- Src/m_mpi_stop.F90 2016-11-16 13:02:00 +0000 | |||
190 | +++ Src/m_mpi_stop.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
191 | @@ -6,15 +6,12 @@ | |||
192 | 6 | ! See Docs/Contributors.txt for a list of contributors. | 6 | ! See Docs/Contributors.txt for a list of contributors. |
193 | 7 | ! | 7 | ! |
194 | 8 | module m_mpi_stop | 8 | module m_mpi_stop |
195 | 9 | |||
196 | 9 | implicit none | 10 | implicit none |
198 | 10 | 11 | ||
199 | 11 | contains | 12 | contains |
200 | 12 | 13 | ||
201 | 13 | ! | ||
202 | 14 | ! | ||
203 | 15 | ! | ||
204 | 16 | subroutine mpi_stop(cfile, iline, ierr) | 14 | subroutine mpi_stop(cfile, iline, ierr) |
205 | 17 | implicit none | ||
206 | 18 | character(*), intent(in) :: cfile | 15 | character(*), intent(in) :: cfile |
207 | 19 | integer, intent(in) :: iline | 16 | integer, intent(in) :: iline |
208 | 20 | integer, intent(in) :: ierr | 17 | integer, intent(in) :: ierr |
209 | 21 | 18 | ||
210 | === modified file 'Src/m_plot_1d_arr3d.F90' | |||
211 | --- Src/m_plot_1d_arr3d.F90 2016-10-18 13:15:38 +0000 | |||
212 | +++ Src/m_plot_1d_arr3d.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
213 | @@ -6,6 +6,7 @@ | |||
214 | 6 | ! See Docs/Contributors.txt for a list of contributors. | 6 | ! See Docs/Contributors.txt for a list of contributors. |
215 | 7 | ! | 7 | ! |
216 | 8 | module m_plot_1d_arr3d | 8 | module m_plot_1d_arr3d |
217 | 9 | |||
218 | 9 | implicit none | 10 | implicit none |
219 | 10 | 11 | ||
220 | 11 | contains | 12 | contains |
221 | @@ -15,7 +16,6 @@ | |||
222 | 15 | ! | 16 | ! |
223 | 16 | subroutine plot_1d_arr3d(nnn, arr, ialong,i1,i2, fname) | 17 | subroutine plot_1d_arr3d(nnn, arr, ialong,i1,i2, fname) |
224 | 17 | use precision, only : grid_p | 18 | use precision, only : grid_p |
225 | 18 | implicit none | ||
226 | 19 | !! external | 19 | !! external |
227 | 20 | integer, intent(in) :: nnn(:) ! 3 dimensions of array arr(*) | 20 | integer, intent(in) :: nnn(:) ! 3 dimensions of array arr(*) |
228 | 21 | real(grid_p), intent(in) :: arr(*) ! data array | 21 | real(grid_p), intent(in) :: arr(*) ! data array |
229 | @@ -67,7 +67,6 @@ | |||
230 | 67 | !! | 67 | !! |
231 | 68 | !! | 68 | !! |
232 | 69 | integer function get_free_handle() | 69 | integer function get_free_handle() |
233 | 70 | implicit none | ||
234 | 71 | ! internal | 70 | ! internal |
235 | 72 | integer :: ihandle | 71 | integer :: ihandle |
236 | 73 | logical :: logical_opened | 72 | logical :: logical_opened |
237 | 74 | 73 | ||
238 | === modified file 'Src/m_poisson_fdf.F90' | |||
239 | --- Src/m_poisson_fdf.F90 2016-10-25 15:07:07 +0000 | |||
240 | +++ Src/m_poisson_fdf.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
241 | @@ -12,7 +12,7 @@ | |||
242 | 12 | 12 | ||
243 | 13 | implicit none | 13 | implicit none |
244 | 14 | 14 | ||
246 | 15 | character(80) :: PoissonMethod = '' | 15 | character(32) :: PoissonMethod = '' |
247 | 16 | real(dp) :: PoissonPBCCutoff0D = -999 | 16 | real(dp) :: PoissonPBCCutoff0D = -999 |
248 | 17 | 17 | ||
249 | 18 | contains | 18 | contains |
250 | @@ -23,16 +23,20 @@ | |||
251 | 23 | subroutine poisson_fdf() | 23 | subroutine poisson_fdf() |
252 | 24 | use fdf, only : fdf_get | 24 | use fdf, only : fdf_get |
253 | 25 | use m_char, only : ucase | 25 | use m_char, only : ucase |
254 | 26 | implicit none | ||
255 | 27 | 26 | ||
256 | 28 | ! internal | ||
257 | 29 | |||
258 | 30 | ! | 27 | ! |
259 | 31 | ! Choice of Poison solver | 28 | ! Choice of Poison solver |
260 | 32 | ! | 29 | ! |
261 | 33 | 30 | ||
262 | 34 | PoissonMethod = fdf_get('Poisson.Method', 'PBC') | 31 | PoissonMethod = fdf_get('Poisson.Method', 'PBC') |
263 | 35 | PoissonMethod = ucase(PoissonMethod) | 32 | PoissonMethod = ucase(PoissonMethod) |
264 | 33 | select case (PoissonMethod) | ||
265 | 34 | case('PBC', 'OBC.FASTCONV') | ||
266 | 35 | case default | ||
267 | 36 | write(*,*) 'The Poisson.Method is not recognized, & | ||
268 | 37 | &should be one of PBC/OBC.FastConv' | ||
269 | 38 | call die('The Poisson.Method is not recognized') | ||
270 | 39 | end select | ||
271 | 36 | 40 | ||
272 | 37 | PoissonPBCCutoff0D = fdf_get('Poisson.PBC.Cutoff0D', 1.0_dp) | 41 | PoissonPBCCutoff0D = fdf_get('Poisson.PBC.Cutoff0D', 1.0_dp) |
273 | 38 | 42 | ||
274 | 39 | 43 | ||
275 | === modified file 'Src/m_poisson_obc_comm.F90' | |||
276 | --- Src/m_poisson_obc_comm.F90 2016-11-16 13:02:00 +0000 | |||
277 | +++ Src/m_poisson_obc_comm.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
278 | @@ -72,7 +72,9 @@ | |||
279 | 72 | box(ix,2) = max(xa(ix,ia)+rc, box(ix,2)) | 72 | box(ix,2) = max(xa(ix,ia)+rc, box(ix,2)) |
280 | 73 | enddo | 73 | enddo |
281 | 74 | enddo | 74 | enddo |
283 | 75 | 75 | ||
284 | 76 | deallocate(sp2rcut) | ||
285 | 77 | |||
286 | 76 | box_c(1:3) = (box(:,2)+box(:,1))/2 | 78 | box_c(1:3) = (box(:,2)+box(:,1))/2 |
287 | 77 | 79 | ||
288 | 78 | ! write(6,'(a)') 'box' | 80 | ! write(6,'(a)') 'box' |
289 | @@ -95,8 +97,6 @@ | |||
290 | 95 | ! write(6,*) origin | 97 | ! write(6,*) origin |
291 | 96 | ! write(6,'(3g12.5)') xa | 98 | ! write(6,'(3g12.5)') xa |
292 | 97 | endif | 99 | endif |
293 | 98 | |||
294 | 99 | if(allocated(sp2rcut)) deallocate(sp2rcut) | ||
295 | 100 | 100 | ||
296 | 101 | end subroutine ! obc_coord_shift | 101 | end subroutine ! obc_coord_shift |
297 | 102 | 102 | ||
298 | @@ -184,6 +184,7 @@ | |||
299 | 184 | 184 | ||
300 | 185 | j3min = n2s3(node) | 185 | j3min = n2s3(node) |
301 | 186 | j3max = n2s3(node+1)-1 | 186 | j3max = n2s3(node+1)-1 |
302 | 187 | deallocate(n2n3,n2s3) | ||
303 | 187 | 188 | ||
304 | 188 | nnn(1:3) = [j1max-j1min+1,j2max-j2min+1,j3max-j3min+1] | 189 | nnn(1:3) = [j1max-j1min+1,j2max-j2min+1,j3max-j3min+1] |
305 | 189 | if(any(nnn/=[n1,n2,n3])) then | 190 | if(any(nnn/=[n1,n2,n3])) then |
306 | 190 | 191 | ||
307 | === modified file 'Src/m_poisson_obc_fastconv.F90' | |||
308 | --- Src/m_poisson_obc_fastconv.F90 2016-11-16 13:02:00 +0000 | |||
309 | +++ Src/m_poisson_obc_fastconv.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
310 | @@ -106,15 +106,21 @@ | |||
311 | 106 | allocate(v_gth(np_gth)) | 106 | allocate(v_gth(np_gth)) |
312 | 107 | call poisson_obc_fastconv_r2c( cell, mesh(1),mesh(2),mesh(3),mesh, & | 107 | call poisson_obc_fastconv_r2c( cell, mesh(1),mesh(2),mesh(3),mesh, & |
313 | 108 | rho_gth, U, v_gth, STRESS) | 108 | rho_gth, U, v_gth, STRESS) |
315 | 109 | 109 | ||
316 | 110 | ! write(6,*) 'sum(v_gth)', sum(v_gth) | 110 | ! write(6,*) 'sum(v_gth)', sum(v_gth) |
317 | 111 | 111 | ||
318 | 112 | endif | 112 | endif |
320 | 113 | 113 | deallocate(rho_gth) | |
321 | 114 | |||
322 | 114 | !! only potential must be scattered | 115 | !! only potential must be scattered |
323 | 115 | call MPI_Scatterv(v_gth, n2c, n2d, MPI_grid_real, v,np, MPI_grid_real, root, comm, ierr) | 116 | call MPI_Scatterv(v_gth, n2c, n2d, MPI_grid_real, v,np, MPI_grid_real, root, comm, ierr) |
326 | 116 | call mpi_stop(__FILE__, __LINE__, ierr) | 117 | call mpi_stop(__FILE__, __LINE__, ierr) |
327 | 117 | 118 | if(root==node) then | |
328 | 119 | deallocate(v_gth) | ||
329 | 120 | end if | ||
330 | 121 | |||
331 | 122 | deallocate(n2c, n2d) | ||
332 | 123 | |||
333 | 118 | endif | 124 | endif |
334 | 119 | 125 | ||
335 | 120 | end subroutine !poisson_obc_fastconv | 126 | end subroutine !poisson_obc_fastconv |
336 | 121 | 127 | ||
337 | === modified file 'Src/m_poisson_obc_fastconv_r2c.F90' | |||
338 | --- Src/m_poisson_obc_fastconv_r2c.F90 2016-11-17 14:11:46 +0000 | |||
339 | +++ Src/m_poisson_obc_fastconv_r2c.F90 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
340 | @@ -165,10 +165,10 @@ | |||
341 | 165 | do i3=1,nr(3) | 165 | do i3=1,nr(3) |
342 | 166 | do i2=1,nr(2) | 166 | do i2=1,nr(2) |
343 | 167 | do i1=1,nc(1) | 167 | do i1=1,nc(1) |
346 | 168 | z1 = cmplx(coul_r2c((i1-1)*2+1,i2,i3), coul_r2c((i1-1)*2+2,i2,i3), 8) | 168 | z1 = cmplx(coul_r2c((i1-1)*2+1,i2,i3), coul_r2c((i1-1)*2+2,i2,i3), dp) |
347 | 169 | z2 = cmplx(dens_fft((i1-1)*2+1,i2,i3), dens_fft((i1-1)*2+2,i2,i3), 8) | 169 | z2 = cmplx(dens_fft((i1-1)*2+1,i2,i3), dens_fft((i1-1)*2+2,i2,i3), dp) |
348 | 170 | z3 = z1*z2 | 170 | z3 = z1*z2 |
350 | 171 | dens_fft((i1-1)*2+1,i2,i3) = real(z3,8) ! Product density and Coulomb interaction in momentum space | 171 | dens_fft((i1-1)*2+1,i2,i3) = real(z3,dp) ! Product density and Coulomb interaction in momentum space |
351 | 172 | dens_fft((i1-1)*2+2,i2,i3) = aimag(z3) ! Product density and Coulomb interaction in momentum space | 172 | dens_fft((i1-1)*2+2,i2,i3) = aimag(z3) ! Product density and Coulomb interaction in momentum space |
352 | 173 | enddo | 173 | enddo |
353 | 174 | enddo | 174 | enddo |
354 | @@ -220,7 +220,7 @@ | |||
355 | 220 | ! | 220 | ! |
356 | 221 | ! | 221 | ! |
357 | 222 | subroutine comp_coul_r2c_inplace(ic, nn, dcell, n, coul_r2c) | 222 | subroutine comp_coul_r2c_inplace(ic, nn, dcell, n, coul_r2c) |
359 | 223 | use precision, only : dp | 223 | use precision, only : dp, i8b |
360 | 224 | use cellsubs, only : volcel ! Finds unit cell volume | 224 | use cellsubs, only : volcel ! Finds unit cell volume |
361 | 225 | implicit none | 225 | implicit none |
362 | 226 | !! external | 226 | !! external |
363 | @@ -230,7 +230,7 @@ | |||
364 | 230 | integer, intent(in) :: n(:) ! 3 | 230 | integer, intent(in) :: n(:) ! 3 |
365 | 231 | real(dp), intent(inout) :: coul_r2c(:,:,:) | 231 | real(dp), intent(inout) :: coul_r2c(:,:,:) |
366 | 232 | !! internal | 232 | !! internal |
368 | 233 | integer(8) :: p_r2c | 233 | integer(i8b) :: p_r2c |
369 | 234 | 234 | ||
370 | 235 | integer :: i1, i2, i3 | 235 | integer :: i1, i2, i3 |
371 | 236 | real(dp) :: rp(3), dcell2(3,3), dvol | 236 | real(dp) :: rp(3), dcell2(3,3), dvol |
372 | 237 | 237 | ||
373 | === modified file 'Util/COOP/Makefile' | |||
374 | --- Util/COOP/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
375 | +++ Util/COOP/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
376 | @@ -108,7 +108,7 @@ | |||
377 | 108 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 108 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
378 | 109 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys_local.o | 109 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys_local.o |
379 | 110 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys_local.o | 110 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys_local.o |
381 | 111 | cart2frac.o: sys_local.o | 111 | cart2frac.o: precision.o sys_local.o |
382 | 112 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys_local.o | 112 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys_local.o |
383 | 113 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys_local.o | 113 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys_local.o |
384 | 114 | cell_broyden_optim.o: units.o zmatrix.o | 114 | cell_broyden_optim.o: units.o zmatrix.o |
385 | @@ -121,6 +121,8 @@ | |||
386 | 121 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 121 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
387 | 122 | cgvc_zmatrix.o: sys_local.o units.o zmatrix.o | 122 | cgvc_zmatrix.o: sys_local.o units.o zmatrix.o |
388 | 123 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys_local.o | 123 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys_local.o |
389 | 124 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
390 | 125 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys_local.o wavefunctions.o | ||
391 | 124 | chemical.o: parallel.o precision.o sys_local.o | 126 | chemical.o: parallel.o precision.o sys_local.o |
392 | 125 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o | 127 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o |
393 | 126 | chkdim.o: sys_local.o | 128 | chkdim.o: sys_local.o |
394 | @@ -173,17 +175,17 @@ | |||
395 | 173 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 175 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
396 | 174 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 176 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
397 | 175 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 177 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
399 | 176 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 178 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
400 | 177 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 179 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
401 | 178 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o | 180 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o |
402 | 179 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 181 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
403 | 180 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 182 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
410 | 181 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 183 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
411 | 182 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 184 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
412 | 183 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 185 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
413 | 184 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 186 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
414 | 185 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys_local.o | 187 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
415 | 186 | dhscf.o: units.o vmat.o | 188 | dhscf.o: siesta_options.o sys_local.o units.o vmat.o |
416 | 187 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o | 189 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o |
417 | 188 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o | 190 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o |
418 | 189 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o | 191 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o |
419 | @@ -211,7 +213,7 @@ | |||
420 | 211 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys_local.o | 213 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys_local.o |
421 | 212 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys_local.o | 214 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys_local.o |
422 | 213 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 215 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
424 | 214 | dynamics.o: precision.o sys_local.o units.o | 216 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys_local.o units.o |
425 | 215 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 217 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
426 | 216 | egandd.o: onmod.o precision.o sys_local.o | 218 | egandd.o: onmod.o precision.o sys_local.o |
427 | 217 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 219 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
428 | @@ -220,6 +222,11 @@ | |||
429 | 220 | elpa2.o: elpa1.o | 222 | elpa2.o: elpa1.o |
430 | 221 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 223 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
431 | 222 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 224 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
432 | 225 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
433 | 226 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys_local.o | ||
434 | 227 | evolg.o: wavefunctions.o | ||
435 | 228 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
436 | 229 | evolk.o: sys_local.o wavefunctions.o | ||
437 | 223 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 230 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
438 | 224 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 231 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
439 | 225 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys_local.o | 232 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys_local.o |
440 | @@ -260,9 +267,9 @@ | |||
441 | 260 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 267 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
442 | 261 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 268 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
443 | 262 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 269 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
447 | 263 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 270 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
448 | 264 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 271 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
449 | 265 | initparallel.o: spatial.o sys_local.o | 272 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys_local.o |
450 | 266 | io.o: sys_local.o | 273 | io.o: sys_local.o |
451 | 267 | iocg.o: files.o precision.o sys_local.o | 274 | iocg.o: files.o precision.o sys_local.o |
452 | 268 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o | 275 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o |
453 | @@ -325,7 +332,10 @@ | |||
454 | 325 | m_efield.o: siesta_geom.o sys_local.o units.o | 332 | m_efield.o: siesta_geom.o sys_local.o units.o |
455 | 326 | m_energies.o: precision.o | 333 | m_energies.o: precision.o |
456 | 327 | m_eo.o: precision.o | 334 | m_eo.o: precision.o |
457 | 335 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
458 | 336 | m_evolve.o: sys_local.o | ||
459 | 328 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 337 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
460 | 338 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
461 | 329 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys_local.o | 339 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys_local.o |
462 | 330 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 340 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
463 | 331 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 341 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
464 | @@ -347,10 +357,14 @@ | |||
465 | 347 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys_local.o | 357 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys_local.o |
466 | 348 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 358 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
467 | 349 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys_local.o | 359 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys_local.o |
468 | 360 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
469 | 361 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys_local.o | ||
470 | 362 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
471 | 350 | m_integrate.o: precision.o | 363 | m_integrate.o: precision.o |
472 | 351 | m_io.o: sys_local.o | 364 | m_io.o: sys_local.o |
473 | 352 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 365 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
474 | 353 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 366 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
475 | 367 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
476 | 354 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 368 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
477 | 355 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 369 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
478 | 356 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 370 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
479 | @@ -358,9 +372,13 @@ | |||
480 | 358 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o | 372 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys_local.o |
481 | 359 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 373 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
482 | 360 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys_local.o units.o | 374 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys_local.o units.o |
483 | 375 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
484 | 376 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
485 | 361 | m_kinetic.o: precision.o | 377 | m_kinetic.o: precision.o |
486 | 362 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 378 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
487 | 379 | m_matdiag.o: precision.o | ||
488 | 363 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 380 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
489 | 381 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
490 | 364 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys_local.o | 382 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys_local.o |
491 | 365 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 383 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
492 | 366 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 384 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
493 | @@ -409,6 +427,15 @@ | |||
494 | 409 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 427 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
495 | 410 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 428 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
496 | 411 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 429 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
497 | 430 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
498 | 431 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
499 | 432 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
500 | 433 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys_local.o | ||
501 | 434 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
502 | 435 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys_local.o | ||
503 | 436 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
504 | 437 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys_local.o | ||
505 | 438 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys_local.o | ||
506 | 412 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 439 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
507 | 413 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys_local.o | 440 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys_local.o |
508 | 414 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 441 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
509 | @@ -424,7 +451,8 @@ | |||
510 | 424 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 451 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
511 | 425 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 452 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
512 | 426 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 453 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
514 | 427 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 454 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
515 | 455 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
516 | 428 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys_local.o units.o | 456 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys_local.o units.o |
517 | 429 | m_stress.o: precision.o | 457 | m_stress.o: precision.o |
518 | 430 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 458 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
519 | @@ -538,9 +566,10 @@ | |||
520 | 538 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 566 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
521 | 539 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 567 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
522 | 540 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 568 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
526 | 541 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 569 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
527 | 542 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 570 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
528 | 543 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 571 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
529 | 572 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
530 | 544 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 573 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
531 | 545 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 574 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
532 | 546 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 575 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
533 | @@ -685,8 +714,8 @@ | |||
534 | 685 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys_local.o | 714 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys_local.o |
535 | 686 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys_local.o | 715 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys_local.o |
536 | 687 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys_local.o | 716 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys_local.o |
539 | 688 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 717 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
540 | 689 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 718 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
541 | 690 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys_local.o units.o | 719 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys_local.o units.o |
542 | 691 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys_local.o | 720 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys_local.o |
543 | 692 | readsp.o: parallel.o precision.o sys_local.o | 721 | readsp.o: parallel.o precision.o sys_local.o |
544 | @@ -756,30 +785,32 @@ | |||
545 | 756 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 785 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
546 | 757 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 786 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
547 | 758 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 787 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
561 | 759 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 788 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
562 | 760 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 789 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
563 | 761 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 790 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
564 | 762 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 791 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
565 | 763 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 792 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
566 | 764 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 793 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
567 | 765 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 794 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
568 | 766 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 795 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
569 | 767 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 796 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
570 | 768 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 797 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
571 | 769 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 798 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
572 | 770 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 799 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
573 | 771 | siesta_forces.o: state_init.o sys_local.o units.o write_subs.o | 800 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
574 | 801 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys_local.o | ||
575 | 802 | siesta_forces.o: units.o wavefunctions.o write_subs.o | ||
576 | 772 | siesta_geom.o: precision.o | 803 | siesta_geom.o: precision.o |
577 | 773 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 804 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
578 | 774 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 805 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
579 | 775 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 806 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
580 | 776 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 807 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
587 | 777 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 808 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
588 | 778 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 809 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
589 | 779 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 810 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
590 | 780 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 811 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
591 | 781 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys_local.o | 812 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
592 | 782 | siesta_init.o: timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 813 | siesta_init.o: sys_local.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
593 | 783 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys_local.o | 814 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys_local.o |
594 | 784 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 815 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
595 | 785 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 816 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
596 | @@ -813,19 +844,18 @@ | |||
597 | 813 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 844 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
598 | 814 | state_init.o: sparse_matrices.o sys_local.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 845 | state_init.o: sparse_matrices.o sys_local.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
599 | 815 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 846 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
603 | 816 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 847 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
604 | 817 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 848 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
605 | 818 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 849 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
606 | 819 | sys.o: parallel.o | 850 | sys.o: parallel.o |
607 | 820 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys_local.o | 851 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys_local.o |
608 | 821 | timer.o: timer_tree.o | 852 | timer.o: timer_tree.o |
609 | 822 | timer_tree.o: m_walltime.o | 853 | timer_tree.o: m_walltime.o |
610 | 823 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 854 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
611 | 824 | transition_rate.o: sys_local.o | 855 | transition_rate.o: sys_local.o |
616 | 825 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 856 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
617 | 826 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 857 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
618 | 827 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 858 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
615 | 828 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
619 | 829 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 859 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
620 | 830 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 860 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
621 | 831 | typecell.o: precision.o | 861 | typecell.o: precision.o |
622 | @@ -837,6 +867,7 @@ | |||
623 | 837 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 867 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
624 | 838 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 868 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
625 | 839 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys_local.o | 869 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys_local.o |
626 | 870 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
627 | 840 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 871 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
628 | 841 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 872 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
629 | 842 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 873 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
630 | @@ -968,6 +999,7 @@ | |||
631 | 968 | m_ksv.o: ksv.o | 999 | m_ksv.o: ksv.o |
632 | 969 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 1000 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
633 | 970 | m_ldau.o: ldau.o | 1001 | m_ldau.o: ldau.o |
634 | 1002 | m_linpack.o: linpack.o | ||
635 | 971 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 1003 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
636 | 972 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 1004 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
637 | 973 | m_minvec.o: minvec.o | 1005 | m_minvec.o: minvec.o |
638 | @@ -1012,6 +1044,8 @@ | |||
639 | 1012 | m_vmat.o: vmat.o | 1044 | m_vmat.o: vmat.o |
640 | 1013 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1045 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
641 | 1014 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1046 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
642 | 1047 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
643 | 1048 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
644 | 1015 | mtprng.o: m_uuid.o | 1049 | mtprng.o: m_uuid.o |
645 | 1016 | neighbour.o: mneighb.o | 1050 | neighbour.o: mneighb.o |
646 | 1017 | on_core.o: onmod.o | 1051 | on_core.o: onmod.o |
647 | 1018 | 1052 | ||
648 | === modified file 'Util/Denchar/Src/Makefile' | |||
649 | --- Util/Denchar/Src/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
650 | +++ Util/Denchar/Src/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
651 | @@ -175,7 +175,7 @@ | |||
652 | 175 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 175 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
653 | 176 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 176 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
654 | 177 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 177 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
656 | 178 | cart2frac.o: sys.o | 178 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
657 | 179 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 179 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
658 | 180 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 180 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
659 | 181 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 181 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
660 | @@ -187,6 +187,8 @@ | |||
661 | 187 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 187 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
662 | 188 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 188 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
663 | 189 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 189 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
664 | 190 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
665 | 191 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
666 | 190 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 192 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
667 | 191 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 193 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
668 | 192 | chkdim.o: sys.o | 194 | chkdim.o: sys.o |
669 | @@ -238,17 +240,17 @@ | |||
670 | 238 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 240 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
671 | 239 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 241 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
672 | 240 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 242 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
674 | 241 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 243 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
675 | 242 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 244 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
676 | 243 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 245 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
677 | 244 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 246 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
678 | 245 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 247 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
685 | 246 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 248 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
686 | 247 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 249 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
687 | 248 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 250 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
688 | 249 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 251 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
689 | 250 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 252 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
690 | 251 | dhscf.o: vmat.o | 253 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
691 | 252 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 254 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
692 | 253 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 255 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
693 | 254 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 256 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
694 | @@ -276,7 +278,7 @@ | |||
695 | 276 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 278 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
696 | 277 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 279 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
697 | 278 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 280 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
699 | 279 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 281 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
700 | 280 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 282 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
701 | 281 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 283 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
702 | 282 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 284 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
703 | @@ -285,6 +287,10 @@ | |||
704 | 285 | elpa2.o: elpa1.o | 287 | elpa2.o: elpa1.o |
705 | 286 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 288 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
706 | 287 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 289 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
707 | 290 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
708 | 291 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
709 | 292 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
710 | 293 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
711 | 288 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 294 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
712 | 289 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 295 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
713 | 290 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 296 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
714 | @@ -325,9 +331,9 @@ | |||
715 | 325 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 331 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
716 | 326 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 332 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
717 | 327 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 333 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
721 | 328 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 334 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
722 | 329 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 335 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
723 | 330 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 336 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
724 | 331 | io.o: sys.o | 337 | io.o: sys.o |
725 | 332 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 338 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
726 | 333 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 339 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
727 | @@ -386,7 +392,9 @@ | |||
728 | 386 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 392 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
729 | 387 | m_energies.o: precision.o | 393 | m_energies.o: precision.o |
730 | 388 | m_eo.o: precision.o | 394 | m_eo.o: precision.o |
731 | 395 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
732 | 389 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 396 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
733 | 397 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
734 | 390 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 398 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
735 | 391 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 399 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
736 | 392 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 400 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
737 | @@ -408,10 +416,14 @@ | |||
738 | 408 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 416 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
739 | 409 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 417 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
740 | 410 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 418 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
741 | 419 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
742 | 420 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
743 | 421 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
744 | 411 | m_integrate.o: precision.o | 422 | m_integrate.o: precision.o |
745 | 412 | m_io.o: sys.o | 423 | m_io.o: sys.o |
746 | 413 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 424 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
747 | 414 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 425 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
748 | 426 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
749 | 415 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 427 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
750 | 416 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 428 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
751 | 417 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 429 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
752 | @@ -419,9 +431,13 @@ | |||
753 | 419 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 431 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
754 | 420 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 432 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
755 | 421 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 433 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
756 | 434 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
757 | 435 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
758 | 422 | m_kinetic.o: precision.o | 436 | m_kinetic.o: precision.o |
759 | 423 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 437 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
760 | 438 | m_matdiag.o: precision.o | ||
761 | 424 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 439 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
762 | 440 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
763 | 425 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 441 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
764 | 426 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 442 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
765 | 427 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 443 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
766 | @@ -469,6 +485,15 @@ | |||
767 | 469 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 485 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
768 | 470 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 486 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
769 | 471 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 487 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
770 | 488 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
771 | 489 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
772 | 490 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
773 | 491 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
774 | 492 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
775 | 493 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
776 | 494 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
777 | 495 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
778 | 496 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
779 | 472 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 497 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
780 | 473 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 498 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
781 | 474 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 499 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
782 | @@ -484,7 +509,8 @@ | |||
783 | 484 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 509 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
784 | 485 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 510 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
785 | 486 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 511 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
787 | 487 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 512 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
788 | 513 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
789 | 488 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 514 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
790 | 489 | m_stress.o: precision.o | 515 | m_stress.o: precision.o |
791 | 490 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 516 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
792 | @@ -596,9 +622,10 @@ | |||
793 | 596 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 622 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
794 | 597 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 623 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
795 | 598 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 624 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
799 | 599 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 625 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
800 | 600 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 626 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
801 | 601 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 627 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
802 | 628 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
803 | 602 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 629 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
804 | 603 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 630 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
805 | 604 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 631 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
806 | @@ -741,8 +768,8 @@ | |||
807 | 741 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 768 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
808 | 742 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 769 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
809 | 743 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 770 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
812 | 744 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 771 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
813 | 745 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 772 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
814 | 746 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 773 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
815 | 747 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 774 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
816 | 748 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 775 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
817 | @@ -809,30 +836,32 @@ | |||
818 | 809 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 836 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
819 | 810 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 837 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
820 | 811 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 838 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
834 | 812 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 839 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
835 | 813 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 840 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
836 | 814 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 841 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
837 | 815 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 842 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
838 | 816 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 843 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
839 | 817 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 844 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
840 | 818 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 845 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
841 | 819 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 846 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
842 | 820 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 847 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
843 | 821 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 848 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
844 | 822 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 849 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
845 | 823 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 850 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
846 | 824 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 851 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
847 | 852 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
848 | 853 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
849 | 825 | siesta_geom.o: precision.o | 854 | siesta_geom.o: precision.o |
850 | 826 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 855 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
851 | 827 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 856 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
852 | 828 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 857 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
853 | 829 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 858 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
860 | 830 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 859 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
861 | 831 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 860 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
862 | 832 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 861 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
863 | 833 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 862 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
864 | 834 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 863 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
865 | 835 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 864 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
866 | 836 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 865 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
867 | 837 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 866 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
868 | 838 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 867 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
869 | @@ -864,18 +893,17 @@ | |||
870 | 864 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 893 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
871 | 865 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 894 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
872 | 866 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 895 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
876 | 867 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 896 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
877 | 868 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 897 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
878 | 869 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 898 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
879 | 870 | sys.o: parallel.o | 899 | sys.o: parallel.o |
880 | 871 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 900 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
881 | 872 | timer.o: timer_tree.o | 901 | timer.o: timer_tree.o |
882 | 873 | timer_tree.o: m_walltime.o | 902 | timer_tree.o: m_walltime.o |
883 | 874 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 903 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
888 | 875 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 904 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
889 | 876 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 905 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
890 | 877 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 906 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
887 | 878 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
891 | 879 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 907 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
892 | 880 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 908 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
893 | 881 | typecell.o: precision.o | 909 | typecell.o: precision.o |
894 | @@ -887,6 +915,7 @@ | |||
895 | 887 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 915 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
896 | 888 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 916 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
897 | 889 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 917 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
898 | 918 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
899 | 890 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 919 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
900 | 891 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 920 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
901 | 892 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 921 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
902 | @@ -911,7 +940,9 @@ | |||
903 | 911 | atompla.o: precision.o sys.o | 940 | atompla.o: precision.o sys.o |
904 | 912 | colinear.o: precision.o | 941 | colinear.o: precision.o |
905 | 913 | denchar.o: basis_io.o listsc.o parallel.o precision.o | 942 | denchar.o: basis_io.o listsc.o parallel.o precision.o |
906 | 943 | length.o: precision.o | ||
907 | 914 | local_reinit.o: files.o | 944 | local_reinit.o: files.o |
908 | 945 | matvect.o: precision.o | ||
909 | 915 | neighb.o: precision.o | 946 | neighb.o: precision.o |
910 | 916 | planed.o: precision.o | 947 | planed.o: precision.o |
911 | 917 | ranger.o: precision.o | 948 | ranger.o: precision.o |
912 | @@ -1020,6 +1051,7 @@ | |||
913 | 1020 | m_ksv.o: ksv.o | 1051 | m_ksv.o: ksv.o |
914 | 1021 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 1052 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
915 | 1022 | m_ldau.o: ldau.o | 1053 | m_ldau.o: ldau.o |
916 | 1054 | m_linpack.o: linpack.o | ||
917 | 1023 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 1055 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
918 | 1024 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 1056 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
919 | 1025 | m_minvec.o: minvec.o | 1057 | m_minvec.o: minvec.o |
920 | @@ -1064,6 +1096,8 @@ | |||
921 | 1064 | m_vmat.o: vmat.o | 1096 | m_vmat.o: vmat.o |
922 | 1065 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1097 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
923 | 1066 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1098 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
924 | 1099 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
925 | 1100 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
926 | 1067 | mtprng.o: m_uuid.o | 1101 | mtprng.o: m_uuid.o |
927 | 1068 | neighbour.o: mneighb.o | 1102 | neighbour.o: mneighb.o |
928 | 1069 | on_core.o: onmod.o | 1103 | on_core.o: onmod.o |
929 | 1070 | 1104 | ||
930 | === modified file 'Util/Gen-basis/Makefile' | |||
931 | --- Util/Gen-basis/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
932 | +++ Util/Gen-basis/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
933 | @@ -171,7 +171,7 @@ | |||
934 | 171 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 171 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
935 | 172 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 172 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
936 | 173 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 173 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
938 | 174 | cart2frac.o: sys.o | 174 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
939 | 175 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 175 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
940 | 176 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 176 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
941 | 177 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 177 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
942 | @@ -183,6 +183,8 @@ | |||
943 | 183 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 183 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
944 | 184 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 184 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
945 | 185 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 185 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
946 | 186 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
947 | 187 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
948 | 186 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 188 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
949 | 187 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 189 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
950 | 188 | chkdim.o: sys.o | 190 | chkdim.o: sys.o |
951 | @@ -234,17 +236,17 @@ | |||
952 | 234 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 236 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
953 | 235 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 237 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
954 | 236 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 238 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
956 | 237 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 239 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
957 | 238 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 240 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
958 | 239 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 241 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
959 | 240 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 242 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
960 | 241 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 243 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
967 | 242 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 244 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
968 | 243 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 245 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
969 | 244 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 246 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
970 | 245 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 247 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
971 | 246 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 248 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
972 | 247 | dhscf.o: vmat.o | 249 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
973 | 248 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 250 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
974 | 249 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 251 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
975 | 250 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 252 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
976 | @@ -272,7 +274,7 @@ | |||
977 | 272 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 274 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
978 | 273 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 275 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
979 | 274 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 276 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
981 | 275 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 277 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
982 | 276 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 278 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
983 | 277 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 279 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
984 | 278 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 280 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
985 | @@ -281,6 +283,10 @@ | |||
986 | 281 | elpa2.o: elpa1.o | 283 | elpa2.o: elpa1.o |
987 | 282 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 284 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
988 | 283 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 285 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
989 | 286 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
990 | 287 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
991 | 288 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
992 | 289 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
993 | 284 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 290 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
994 | 285 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 291 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
995 | 286 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 292 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
996 | @@ -321,9 +327,9 @@ | |||
997 | 321 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 327 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
998 | 322 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 328 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
999 | 323 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 329 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
1003 | 324 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 330 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
1004 | 325 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 331 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1005 | 326 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 332 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
1006 | 327 | io.o: sys.o | 333 | io.o: sys.o |
1007 | 328 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 334 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
1008 | 329 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 335 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1009 | @@ -382,7 +388,9 @@ | |||
1010 | 382 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 388 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
1011 | 383 | m_energies.o: precision.o | 389 | m_energies.o: precision.o |
1012 | 384 | m_eo.o: precision.o | 390 | m_eo.o: precision.o |
1013 | 391 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
1014 | 385 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 392 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
1015 | 393 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
1016 | 386 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 394 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
1017 | 387 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 395 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
1018 | 388 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 396 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
1019 | @@ -404,10 +412,14 @@ | |||
1020 | 404 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 412 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
1021 | 405 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 413 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
1022 | 406 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 414 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
1023 | 415 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
1024 | 416 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
1025 | 417 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
1026 | 407 | m_integrate.o: precision.o | 418 | m_integrate.o: precision.o |
1027 | 408 | m_io.o: sys.o | 419 | m_io.o: sys.o |
1028 | 409 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 420 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
1029 | 410 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 421 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
1030 | 422 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
1031 | 411 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 423 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
1032 | 412 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 424 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
1033 | 413 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 425 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
1034 | @@ -415,9 +427,13 @@ | |||
1035 | 415 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 427 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1036 | 416 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 428 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
1037 | 417 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 429 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
1038 | 430 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
1039 | 431 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
1040 | 418 | m_kinetic.o: precision.o | 432 | m_kinetic.o: precision.o |
1041 | 419 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 433 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
1042 | 434 | m_matdiag.o: precision.o | ||
1043 | 420 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 435 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
1044 | 436 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
1045 | 421 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 437 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
1046 | 422 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 438 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
1047 | 423 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 439 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
1048 | @@ -465,6 +481,15 @@ | |||
1049 | 465 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 481 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
1050 | 466 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 482 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
1051 | 467 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 483 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
1052 | 484 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
1053 | 485 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
1054 | 486 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
1055 | 487 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
1056 | 488 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
1057 | 489 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
1058 | 490 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
1059 | 491 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
1060 | 492 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
1061 | 468 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 493 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
1062 | 469 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 494 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
1063 | 470 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 495 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
1064 | @@ -480,7 +505,8 @@ | |||
1065 | 480 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 505 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
1066 | 481 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 506 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
1067 | 482 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 507 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
1069 | 483 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 508 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
1070 | 509 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
1071 | 484 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 510 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
1072 | 485 | m_stress.o: precision.o | 511 | m_stress.o: precision.o |
1073 | 486 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 512 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
1074 | @@ -592,9 +618,10 @@ | |||
1075 | 592 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 618 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
1076 | 593 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 619 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
1077 | 594 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 620 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
1081 | 595 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 621 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
1082 | 596 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 622 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
1083 | 597 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 623 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
1084 | 624 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
1085 | 598 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 625 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
1086 | 599 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 626 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
1087 | 600 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 627 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
1088 | @@ -737,8 +764,8 @@ | |||
1089 | 737 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 764 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
1090 | 738 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 765 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
1091 | 739 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 766 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
1094 | 740 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 767 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
1095 | 741 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 768 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
1096 | 742 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 769 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
1097 | 743 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 770 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
1098 | 744 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 771 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
1099 | @@ -805,30 +832,32 @@ | |||
1100 | 805 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 832 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
1101 | 806 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 833 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
1102 | 807 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 834 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
1116 | 808 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 835 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
1117 | 809 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 836 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
1118 | 810 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 837 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
1119 | 811 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 838 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
1120 | 812 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 839 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
1121 | 813 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 840 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
1122 | 814 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 841 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
1123 | 815 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 842 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
1124 | 816 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 843 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
1125 | 817 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 844 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
1126 | 818 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 845 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
1127 | 819 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 846 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
1128 | 820 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 847 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
1129 | 848 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
1130 | 849 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
1131 | 821 | siesta_geom.o: precision.o | 850 | siesta_geom.o: precision.o |
1132 | 822 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 851 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
1133 | 823 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 852 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
1134 | 824 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 853 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
1135 | 825 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 854 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
1142 | 826 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 855 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
1143 | 827 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 856 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
1144 | 828 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 857 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
1145 | 829 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 858 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
1146 | 830 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 859 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
1147 | 831 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 860 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
1148 | 832 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 861 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
1149 | 833 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 862 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
1150 | 834 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 863 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
1151 | @@ -860,18 +889,17 @@ | |||
1152 | 860 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 889 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
1153 | 861 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 890 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
1154 | 862 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 891 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
1158 | 863 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 892 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
1159 | 864 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 893 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
1160 | 865 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 894 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
1161 | 866 | sys.o: parallel.o | 895 | sys.o: parallel.o |
1162 | 867 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 896 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
1163 | 868 | timer.o: timer_tree.o | 897 | timer.o: timer_tree.o |
1164 | 869 | timer_tree.o: m_walltime.o | 898 | timer_tree.o: m_walltime.o |
1165 | 870 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 899 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1170 | 871 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 900 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
1171 | 872 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 901 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
1172 | 873 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 902 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
1169 | 874 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
1173 | 875 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 903 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
1174 | 876 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 904 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
1175 | 877 | typecell.o: precision.o | 905 | typecell.o: precision.o |
1176 | @@ -883,6 +911,7 @@ | |||
1177 | 883 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 911 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
1178 | 884 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 912 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
1179 | 885 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 913 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
1180 | 914 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
1181 | 886 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 915 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
1182 | 887 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 916 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1183 | 888 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 917 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
1184 | @@ -1004,6 +1033,7 @@ | |||
1185 | 1004 | m_ksv.o: ksv.o | 1033 | m_ksv.o: ksv.o |
1186 | 1005 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 1034 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
1187 | 1006 | m_ldau.o: ldau.o | 1035 | m_ldau.o: ldau.o |
1188 | 1036 | m_linpack.o: linpack.o | ||
1189 | 1007 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 1037 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
1190 | 1008 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 1038 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
1191 | 1009 | m_minvec.o: minvec.o | 1039 | m_minvec.o: minvec.o |
1192 | @@ -1048,6 +1078,8 @@ | |||
1193 | 1048 | m_vmat.o: vmat.o | 1078 | m_vmat.o: vmat.o |
1194 | 1049 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1079 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
1195 | 1050 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1080 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
1196 | 1081 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
1197 | 1082 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
1198 | 1051 | mtprng.o: m_uuid.o | 1083 | mtprng.o: m_uuid.o |
1199 | 1052 | neighbour.o: mneighb.o | 1084 | neighbour.o: mneighb.o |
1200 | 1053 | on_core.o: onmod.o | 1085 | on_core.o: onmod.o |
1201 | 1054 | 1086 | ||
1202 | === modified file 'Util/Grimme/Makefile' | |||
1203 | --- Util/Grimme/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
1204 | +++ Util/Grimme/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
1205 | @@ -109,7 +109,7 @@ | |||
1206 | 109 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 109 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
1207 | 110 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 110 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
1208 | 111 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 111 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
1210 | 112 | cart2frac.o: sys.o | 112 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
1211 | 113 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 113 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
1212 | 114 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 114 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
1213 | 115 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 115 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
1214 | @@ -121,6 +121,8 @@ | |||
1215 | 121 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 121 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
1216 | 122 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 122 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
1217 | 123 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 123 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
1218 | 124 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
1219 | 125 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
1220 | 124 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 126 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
1221 | 125 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 127 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1222 | 126 | chkdim.o: sys.o | 128 | chkdim.o: sys.o |
1223 | @@ -172,17 +174,17 @@ | |||
1224 | 172 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 174 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1225 | 173 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 175 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
1226 | 174 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 176 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
1228 | 175 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 177 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1229 | 176 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 178 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
1230 | 177 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 179 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1231 | 178 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 180 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
1232 | 179 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 181 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
1239 | 180 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 182 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
1240 | 181 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 183 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
1241 | 182 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 184 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
1242 | 183 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 185 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
1243 | 184 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 186 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
1244 | 185 | dhscf.o: vmat.o | 187 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
1245 | 186 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 188 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1246 | 187 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 189 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1247 | 188 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 190 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1248 | @@ -210,7 +212,7 @@ | |||
1249 | 210 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 212 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
1250 | 211 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 213 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
1251 | 212 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 214 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
1253 | 213 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 215 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
1254 | 214 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 216 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
1255 | 215 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 217 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
1256 | 216 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 218 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
1257 | @@ -219,6 +221,10 @@ | |||
1258 | 219 | elpa2.o: elpa1.o | 221 | elpa2.o: elpa1.o |
1259 | 220 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 222 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1260 | 221 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 223 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1261 | 224 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
1262 | 225 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
1263 | 226 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
1264 | 227 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
1265 | 222 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 228 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
1266 | 223 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 229 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
1267 | 224 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 230 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
1268 | @@ -259,9 +265,9 @@ | |||
1269 | 259 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 265 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
1270 | 260 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 266 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
1271 | 261 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 267 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
1275 | 262 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 268 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
1276 | 263 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 269 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1277 | 264 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 270 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
1278 | 265 | io.o: sys.o | 271 | io.o: sys.o |
1279 | 266 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 272 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
1280 | 267 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 273 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1281 | @@ -320,7 +326,9 @@ | |||
1282 | 320 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 326 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
1283 | 321 | m_energies.o: precision.o | 327 | m_energies.o: precision.o |
1284 | 322 | m_eo.o: precision.o | 328 | m_eo.o: precision.o |
1285 | 329 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
1286 | 323 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 330 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
1287 | 331 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
1288 | 324 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 332 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
1289 | 325 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 333 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
1290 | 326 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 334 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
1291 | @@ -342,10 +350,14 @@ | |||
1292 | 342 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 350 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
1293 | 343 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 351 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
1294 | 344 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 352 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
1295 | 353 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
1296 | 354 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
1297 | 355 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
1298 | 345 | m_integrate.o: precision.o | 356 | m_integrate.o: precision.o |
1299 | 346 | m_io.o: sys.o | 357 | m_io.o: sys.o |
1300 | 347 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 358 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
1301 | 348 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 359 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
1302 | 360 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
1303 | 349 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 361 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
1304 | 350 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 362 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
1305 | 351 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 363 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
1306 | @@ -353,9 +365,13 @@ | |||
1307 | 353 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 365 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1308 | 354 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 366 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
1309 | 355 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 367 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
1310 | 368 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
1311 | 369 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
1312 | 356 | m_kinetic.o: precision.o | 370 | m_kinetic.o: precision.o |
1313 | 357 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 371 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
1314 | 372 | m_matdiag.o: precision.o | ||
1315 | 358 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 373 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
1316 | 374 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
1317 | 359 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 375 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
1318 | 360 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 376 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
1319 | 361 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 377 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
1320 | @@ -403,6 +419,15 @@ | |||
1321 | 403 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 419 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
1322 | 404 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 420 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
1323 | 405 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 421 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
1324 | 422 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
1325 | 423 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
1326 | 424 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
1327 | 425 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
1328 | 426 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
1329 | 427 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
1330 | 428 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
1331 | 429 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
1332 | 430 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
1333 | 406 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 431 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
1334 | 407 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 432 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
1335 | 408 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 433 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
1336 | @@ -418,7 +443,8 @@ | |||
1337 | 418 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 443 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
1338 | 419 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 444 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
1339 | 420 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 445 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
1341 | 421 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 446 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
1342 | 447 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
1343 | 422 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 448 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
1344 | 423 | m_stress.o: precision.o | 449 | m_stress.o: precision.o |
1345 | 424 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 450 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
1346 | @@ -530,9 +556,10 @@ | |||
1347 | 530 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 556 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
1348 | 531 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 557 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
1349 | 532 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 558 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
1353 | 533 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 559 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
1354 | 534 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 560 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
1355 | 535 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 561 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
1356 | 562 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
1357 | 536 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 563 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
1358 | 537 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 564 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
1359 | 538 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 565 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
1360 | @@ -675,8 +702,8 @@ | |||
1361 | 675 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 702 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
1362 | 676 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 703 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
1363 | 677 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 704 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
1366 | 678 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 705 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
1367 | 679 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 706 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
1368 | 680 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 707 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
1369 | 681 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 708 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
1370 | 682 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 709 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
1371 | @@ -743,30 +770,32 @@ | |||
1372 | 743 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 770 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
1373 | 744 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 771 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
1374 | 745 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 772 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
1388 | 746 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 773 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
1389 | 747 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 774 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
1390 | 748 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 775 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
1391 | 749 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 776 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
1392 | 750 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 777 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
1393 | 751 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 778 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
1394 | 752 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 779 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
1395 | 753 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 780 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
1396 | 754 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 781 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
1397 | 755 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 782 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
1398 | 756 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 783 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
1399 | 757 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 784 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
1400 | 758 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 785 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
1401 | 786 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
1402 | 787 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
1403 | 759 | siesta_geom.o: precision.o | 788 | siesta_geom.o: precision.o |
1404 | 760 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 789 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
1405 | 761 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 790 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
1406 | 762 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 791 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
1407 | 763 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 792 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
1414 | 764 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 793 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
1415 | 765 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 794 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
1416 | 766 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 795 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
1417 | 767 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 796 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
1418 | 768 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 797 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
1419 | 769 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 798 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
1420 | 770 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 799 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
1421 | 771 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 800 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
1422 | 772 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 801 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
1423 | @@ -798,18 +827,17 @@ | |||
1424 | 798 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 827 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
1425 | 799 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 828 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
1426 | 800 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 829 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
1430 | 801 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 830 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
1431 | 802 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 831 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
1432 | 803 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 832 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
1433 | 804 | sys.o: parallel.o | 833 | sys.o: parallel.o |
1434 | 805 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 834 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
1435 | 806 | timer.o: timer_tree.o | 835 | timer.o: timer_tree.o |
1436 | 807 | timer_tree.o: m_walltime.o | 836 | timer_tree.o: m_walltime.o |
1437 | 808 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 837 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1442 | 809 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 838 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
1443 | 810 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 839 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
1444 | 811 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 840 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
1441 | 812 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
1445 | 813 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 841 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
1446 | 814 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 842 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
1447 | 815 | typecell.o: precision.o | 843 | typecell.o: precision.o |
1448 | @@ -821,6 +849,7 @@ | |||
1449 | 821 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 849 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
1450 | 822 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 850 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
1451 | 823 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 851 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
1452 | 852 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
1453 | 824 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 853 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
1454 | 825 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 854 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1455 | 826 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 855 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
1456 | @@ -938,6 +967,7 @@ | |||
1457 | 938 | m_ksv.o: ksv.o | 967 | m_ksv.o: ksv.o |
1458 | 939 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 968 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
1459 | 940 | m_ldau.o: ldau.o | 969 | m_ldau.o: ldau.o |
1460 | 970 | m_linpack.o: linpack.o | ||
1461 | 941 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 971 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
1462 | 942 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 972 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
1463 | 943 | m_minvec.o: minvec.o | 973 | m_minvec.o: minvec.o |
1464 | @@ -982,6 +1012,8 @@ | |||
1465 | 982 | m_vmat.o: vmat.o | 1012 | m_vmat.o: vmat.o |
1466 | 983 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1013 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
1467 | 984 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1014 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
1468 | 1015 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
1469 | 1016 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
1470 | 985 | mtprng.o: m_uuid.o | 1017 | mtprng.o: m_uuid.o |
1471 | 986 | neighbour.o: mneighb.o | 1018 | neighbour.o: mneighb.o |
1472 | 987 | on_core.o: onmod.o | 1019 | on_core.o: onmod.o |
1473 | 988 | 1020 | ||
1474 | === modified file 'Util/Helpers/Makefile' | |||
1475 | --- Util/Helpers/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
1476 | +++ Util/Helpers/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
1477 | @@ -112,7 +112,7 @@ | |||
1478 | 112 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 112 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
1479 | 113 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 113 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
1480 | 114 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 114 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
1482 | 115 | cart2frac.o: sys.o | 115 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
1483 | 116 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 116 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
1484 | 117 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 117 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
1485 | 118 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 118 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
1486 | @@ -124,6 +124,8 @@ | |||
1487 | 124 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 124 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
1488 | 125 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 125 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
1489 | 126 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 126 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
1490 | 127 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
1491 | 128 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
1492 | 127 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 129 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
1493 | 128 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 130 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1494 | 129 | chkdim.o: sys.o | 131 | chkdim.o: sys.o |
1495 | @@ -175,17 +177,17 @@ | |||
1496 | 175 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 177 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1497 | 176 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 178 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
1498 | 177 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 179 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
1500 | 178 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 180 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1501 | 179 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 181 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
1502 | 180 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 182 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1503 | 181 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 183 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
1504 | 182 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 184 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
1511 | 183 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 185 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
1512 | 184 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 186 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
1513 | 185 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 187 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
1514 | 186 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 188 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
1515 | 187 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 189 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
1516 | 188 | dhscf.o: vmat.o | 190 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
1517 | 189 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 191 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1518 | 190 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 192 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1519 | 191 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 193 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1520 | @@ -213,7 +215,7 @@ | |||
1521 | 213 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 215 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
1522 | 214 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 216 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
1523 | 215 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 217 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
1525 | 216 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 218 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
1526 | 217 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 219 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
1527 | 218 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 220 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
1528 | 219 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 221 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
1529 | @@ -222,6 +224,10 @@ | |||
1530 | 222 | elpa2.o: elpa1.o | 224 | elpa2.o: elpa1.o |
1531 | 223 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 225 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1532 | 224 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 226 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1533 | 227 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
1534 | 228 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
1535 | 229 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
1536 | 230 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
1537 | 225 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 231 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
1538 | 226 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 232 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
1539 | 227 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 233 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
1540 | @@ -262,9 +268,9 @@ | |||
1541 | 262 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 268 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
1542 | 263 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 269 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
1543 | 264 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 270 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
1547 | 265 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 271 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
1548 | 266 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 272 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1549 | 267 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 273 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
1550 | 268 | io.o: sys.o | 274 | io.o: sys.o |
1551 | 269 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 275 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
1552 | 270 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 276 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1553 | @@ -323,7 +329,9 @@ | |||
1554 | 323 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 329 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
1555 | 324 | m_energies.o: precision.o | 330 | m_energies.o: precision.o |
1556 | 325 | m_eo.o: precision.o | 331 | m_eo.o: precision.o |
1557 | 332 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
1558 | 326 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 333 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
1559 | 334 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
1560 | 327 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 335 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
1561 | 328 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 336 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
1562 | 329 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 337 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
1563 | @@ -345,10 +353,14 @@ | |||
1564 | 345 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 353 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
1565 | 346 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 354 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
1566 | 347 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 355 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
1567 | 356 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
1568 | 357 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
1569 | 358 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
1570 | 348 | m_integrate.o: precision.o | 359 | m_integrate.o: precision.o |
1571 | 349 | m_io.o: sys.o | 360 | m_io.o: sys.o |
1572 | 350 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 361 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
1573 | 351 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 362 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
1574 | 363 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
1575 | 352 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 364 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
1576 | 353 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 365 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
1577 | 354 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 366 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
1578 | @@ -356,9 +368,13 @@ | |||
1579 | 356 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 368 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1580 | 357 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 369 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
1581 | 358 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 370 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
1582 | 371 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
1583 | 372 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
1584 | 359 | m_kinetic.o: precision.o | 373 | m_kinetic.o: precision.o |
1585 | 360 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 374 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
1586 | 375 | m_matdiag.o: precision.o | ||
1587 | 361 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 376 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
1588 | 377 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
1589 | 362 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 378 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
1590 | 363 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 379 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
1591 | 364 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 380 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
1592 | @@ -406,6 +422,15 @@ | |||
1593 | 406 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 422 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
1594 | 407 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 423 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
1595 | 408 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 424 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
1596 | 425 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
1597 | 426 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
1598 | 427 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
1599 | 428 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
1600 | 429 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
1601 | 430 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
1602 | 431 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
1603 | 432 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
1604 | 433 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
1605 | 409 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 434 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
1606 | 410 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 435 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
1607 | 411 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 436 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
1608 | @@ -421,7 +446,8 @@ | |||
1609 | 421 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 446 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
1610 | 422 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 447 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
1611 | 423 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 448 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
1613 | 424 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 449 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
1614 | 450 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
1615 | 425 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 451 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
1616 | 426 | m_stress.o: precision.o | 452 | m_stress.o: precision.o |
1617 | 427 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 453 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
1618 | @@ -533,9 +559,10 @@ | |||
1619 | 533 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 559 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
1620 | 534 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 560 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
1621 | 535 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 561 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
1625 | 536 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 562 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
1626 | 537 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 563 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
1627 | 538 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 564 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
1628 | 565 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
1629 | 539 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 566 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
1630 | 540 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 567 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
1631 | 541 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 568 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
1632 | @@ -678,8 +705,8 @@ | |||
1633 | 678 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 705 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
1634 | 679 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 706 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
1635 | 680 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 707 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
1638 | 681 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 708 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
1639 | 682 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 709 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
1640 | 683 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 710 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
1641 | 684 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 711 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
1642 | 685 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 712 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
1643 | @@ -746,30 +773,32 @@ | |||
1644 | 746 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 773 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
1645 | 747 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 774 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
1646 | 748 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 775 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
1660 | 749 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 776 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
1661 | 750 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 777 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
1662 | 751 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 778 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
1663 | 752 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 779 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
1664 | 753 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 780 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
1665 | 754 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 781 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
1666 | 755 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 782 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
1667 | 756 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 783 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
1668 | 757 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 784 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
1669 | 758 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 785 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
1670 | 759 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 786 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
1671 | 760 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 787 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
1672 | 761 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 788 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
1673 | 789 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
1674 | 790 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
1675 | 762 | siesta_geom.o: precision.o | 791 | siesta_geom.o: precision.o |
1676 | 763 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 792 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
1677 | 764 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 793 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
1678 | 765 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 794 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
1679 | 766 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 795 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
1686 | 767 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 796 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
1687 | 768 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 797 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
1688 | 769 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 798 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
1689 | 770 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 799 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
1690 | 771 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 800 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
1691 | 772 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 801 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
1692 | 773 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 802 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
1693 | 774 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 803 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
1694 | 775 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 804 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
1695 | @@ -801,18 +830,17 @@ | |||
1696 | 801 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 830 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
1697 | 802 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 831 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
1698 | 803 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 832 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
1702 | 804 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 833 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
1703 | 805 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 834 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
1704 | 806 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 835 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
1705 | 807 | sys.o: parallel.o | 836 | sys.o: parallel.o |
1706 | 808 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 837 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
1707 | 809 | timer.o: timer_tree.o | 838 | timer.o: timer_tree.o |
1708 | 810 | timer_tree.o: m_walltime.o | 839 | timer_tree.o: m_walltime.o |
1709 | 811 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 840 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1714 | 812 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 841 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
1715 | 813 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 842 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
1716 | 814 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 843 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
1713 | 815 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
1717 | 816 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 844 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
1718 | 817 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 845 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
1719 | 818 | typecell.o: precision.o | 846 | typecell.o: precision.o |
1720 | @@ -824,6 +852,7 @@ | |||
1721 | 824 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 852 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
1722 | 825 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 853 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
1723 | 826 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 854 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
1724 | 855 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
1725 | 827 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 856 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
1726 | 828 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 857 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1727 | 829 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 858 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
1728 | @@ -941,6 +970,7 @@ | |||
1729 | 941 | m_ksv.o: ksv.o | 970 | m_ksv.o: ksv.o |
1730 | 942 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 971 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
1731 | 943 | m_ldau.o: ldau.o | 972 | m_ldau.o: ldau.o |
1732 | 973 | m_linpack.o: linpack.o | ||
1733 | 944 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 974 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
1734 | 945 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 975 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
1735 | 946 | m_minvec.o: minvec.o | 976 | m_minvec.o: minvec.o |
1736 | @@ -985,6 +1015,8 @@ | |||
1737 | 985 | m_vmat.o: vmat.o | 1015 | m_vmat.o: vmat.o |
1738 | 986 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1016 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
1739 | 987 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1017 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
1740 | 1018 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
1741 | 1019 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
1742 | 988 | mtprng.o: m_uuid.o | 1020 | mtprng.o: m_uuid.o |
1743 | 989 | neighbour.o: mneighb.o | 1021 | neighbour.o: mneighb.o |
1744 | 990 | on_core.o: onmod.o | 1022 | on_core.o: onmod.o |
1745 | 991 | 1023 | ||
1746 | === modified file 'Util/STM/ol-stm/Src/Makefile' | |||
1747 | --- Util/STM/ol-stm/Src/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
1748 | +++ Util/STM/ol-stm/Src/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
1749 | @@ -185,7 +185,7 @@ | |||
1750 | 185 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 185 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
1751 | 186 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 186 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
1752 | 187 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 187 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
1754 | 188 | cart2frac.o: sys.o | 188 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
1755 | 189 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 189 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
1756 | 190 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 190 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
1757 | 191 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 191 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
1758 | @@ -197,6 +197,8 @@ | |||
1759 | 197 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 197 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
1760 | 198 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 198 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
1761 | 199 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 199 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
1762 | 200 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
1763 | 201 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
1764 | 200 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 202 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
1765 | 201 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 203 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1766 | 202 | chkdim.o: sys.o | 204 | chkdim.o: sys.o |
1767 | @@ -248,17 +250,17 @@ | |||
1768 | 248 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 250 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1769 | 249 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 251 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
1770 | 250 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 252 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
1772 | 251 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 253 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1773 | 252 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 254 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
1774 | 253 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 255 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1775 | 254 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 256 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
1776 | 255 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 257 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
1783 | 256 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 258 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
1784 | 257 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 259 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
1785 | 258 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 260 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
1786 | 259 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 261 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
1787 | 260 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 262 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
1788 | 261 | dhscf.o: vmat.o | 263 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
1789 | 262 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 264 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1790 | 263 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 265 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1791 | 264 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 266 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1792 | @@ -286,7 +288,7 @@ | |||
1793 | 286 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 288 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
1794 | 287 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 289 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
1795 | 288 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 290 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
1797 | 289 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 291 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
1798 | 290 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 292 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
1799 | 291 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 293 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
1800 | 292 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 294 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
1801 | @@ -295,6 +297,10 @@ | |||
1802 | 295 | elpa2.o: elpa1.o | 297 | elpa2.o: elpa1.o |
1803 | 296 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 298 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1804 | 297 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 299 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
1805 | 300 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
1806 | 301 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
1807 | 302 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
1808 | 303 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
1809 | 298 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 304 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
1810 | 299 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 305 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
1811 | 300 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 306 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
1812 | @@ -335,9 +341,9 @@ | |||
1813 | 335 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 341 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
1814 | 336 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 342 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
1815 | 337 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 343 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
1819 | 338 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 344 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
1820 | 339 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 345 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1821 | 340 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 346 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
1822 | 341 | io.o: sys.o | 347 | io.o: sys.o |
1823 | 342 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 348 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
1824 | 343 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 349 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1825 | @@ -396,7 +402,9 @@ | |||
1826 | 396 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 402 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
1827 | 397 | m_energies.o: precision.o | 403 | m_energies.o: precision.o |
1828 | 398 | m_eo.o: precision.o | 404 | m_eo.o: precision.o |
1829 | 405 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
1830 | 399 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 406 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
1831 | 407 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
1832 | 400 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 408 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
1833 | 401 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 409 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
1834 | 402 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 410 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
1835 | @@ -418,10 +426,14 @@ | |||
1836 | 418 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 426 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
1837 | 419 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 427 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
1838 | 420 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 428 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
1839 | 429 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
1840 | 430 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
1841 | 431 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
1842 | 421 | m_integrate.o: precision.o | 432 | m_integrate.o: precision.o |
1843 | 422 | m_io.o: sys.o | 433 | m_io.o: sys.o |
1844 | 423 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 434 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
1845 | 424 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 435 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
1846 | 436 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
1847 | 425 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 437 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
1848 | 426 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 438 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
1849 | 427 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 439 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
1850 | @@ -429,9 +441,13 @@ | |||
1851 | 429 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 441 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1852 | 430 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 442 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
1853 | 431 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 443 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
1854 | 444 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
1855 | 445 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
1856 | 432 | m_kinetic.o: precision.o | 446 | m_kinetic.o: precision.o |
1857 | 433 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 447 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
1858 | 448 | m_matdiag.o: precision.o | ||
1859 | 434 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 449 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
1860 | 450 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
1861 | 435 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 451 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
1862 | 436 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 452 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
1863 | 437 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 453 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
1864 | @@ -479,6 +495,15 @@ | |||
1865 | 479 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 495 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
1866 | 480 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 496 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
1867 | 481 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 497 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
1868 | 498 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
1869 | 499 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
1870 | 500 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
1871 | 501 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
1872 | 502 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
1873 | 503 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
1874 | 504 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
1875 | 505 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
1876 | 506 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
1877 | 482 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 507 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
1878 | 483 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 508 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
1879 | 484 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 509 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
1880 | @@ -494,7 +519,8 @@ | |||
1881 | 494 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 519 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
1882 | 495 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 520 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
1883 | 496 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 521 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
1885 | 497 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 522 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
1886 | 523 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
1887 | 498 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 524 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
1888 | 499 | m_stress.o: precision.o | 525 | m_stress.o: precision.o |
1889 | 500 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 526 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
1890 | @@ -606,9 +632,10 @@ | |||
1891 | 606 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 632 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
1892 | 607 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 633 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
1893 | 608 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 634 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
1897 | 609 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 635 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
1898 | 610 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 636 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
1899 | 611 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 637 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
1900 | 638 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
1901 | 612 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 639 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
1902 | 613 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 640 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
1903 | 614 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 641 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
1904 | @@ -751,8 +778,8 @@ | |||
1905 | 751 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 778 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
1906 | 752 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 779 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
1907 | 753 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 780 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
1910 | 754 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 781 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
1911 | 755 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 782 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
1912 | 756 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 783 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
1913 | 757 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 784 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
1914 | 758 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 785 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
1915 | @@ -819,30 +846,32 @@ | |||
1916 | 819 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 846 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
1917 | 820 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 847 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
1918 | 821 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 848 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
1932 | 822 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 849 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
1933 | 823 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 850 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
1934 | 824 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 851 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
1935 | 825 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 852 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
1936 | 826 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 853 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
1937 | 827 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 854 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
1938 | 828 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 855 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
1939 | 829 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 856 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
1940 | 830 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 857 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
1941 | 831 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 858 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
1942 | 832 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 859 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
1943 | 833 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 860 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
1944 | 834 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 861 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
1945 | 862 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
1946 | 863 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
1947 | 835 | siesta_geom.o: precision.o | 864 | siesta_geom.o: precision.o |
1948 | 836 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 865 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
1949 | 837 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 866 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
1950 | 838 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 867 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
1951 | 839 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 868 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
1958 | 840 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 869 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
1959 | 841 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 870 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
1960 | 842 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 871 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
1961 | 843 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 872 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
1962 | 844 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 873 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
1963 | 845 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 874 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
1964 | 846 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 875 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
1965 | 847 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 876 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
1966 | 848 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 877 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
1967 | @@ -874,18 +903,17 @@ | |||
1968 | 874 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 903 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
1969 | 875 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 904 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
1970 | 876 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 905 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
1974 | 877 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 906 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
1975 | 878 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 907 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
1976 | 879 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 908 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
1977 | 880 | sys.o: parallel.o | 909 | sys.o: parallel.o |
1978 | 881 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 910 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
1979 | 882 | timer.o: timer_tree.o | 911 | timer.o: timer_tree.o |
1980 | 883 | timer_tree.o: m_walltime.o | 912 | timer_tree.o: m_walltime.o |
1981 | 884 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 913 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
1986 | 885 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 914 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
1987 | 886 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 915 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
1988 | 887 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 916 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
1985 | 888 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
1989 | 889 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 917 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
1990 | 890 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 918 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
1991 | 891 | typecell.o: precision.o | 919 | typecell.o: precision.o |
1992 | @@ -897,6 +925,7 @@ | |||
1993 | 897 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 925 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
1994 | 898 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 926 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
1995 | 899 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 927 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
1996 | 928 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
1997 | 900 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 929 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
1998 | 901 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 930 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
1999 | 902 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 931 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
2000 | @@ -1020,6 +1049,7 @@ | |||
2001 | 1020 | m_ksv.o: ksv.o | 1049 | m_ksv.o: ksv.o |
2002 | 1021 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 1050 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
2003 | 1022 | m_ldau.o: ldau.o | 1051 | m_ldau.o: ldau.o |
2004 | 1052 | m_linpack.o: linpack.o | ||
2005 | 1023 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 1053 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
2006 | 1024 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 1054 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
2007 | 1025 | m_minvec.o: minvec.o | 1055 | m_minvec.o: minvec.o |
2008 | @@ -1064,6 +1094,8 @@ | |||
2009 | 1064 | m_vmat.o: vmat.o | 1094 | m_vmat.o: vmat.o |
2010 | 1065 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1095 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
2011 | 1066 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1096 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
2012 | 1097 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
2013 | 1098 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
2014 | 1067 | mtprng.o: m_uuid.o | 1099 | mtprng.o: m_uuid.o |
2015 | 1068 | neighbour.o: mneighb.o | 1100 | neighbour.o: mneighb.o |
2016 | 1069 | on_core.o: onmod.o | 1101 | on_core.o: onmod.o |
2017 | 1070 | 1102 | ||
2018 | === modified file 'Util/SpPivot/Makefile' | |||
2019 | --- Util/SpPivot/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
2020 | +++ Util/SpPivot/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
2021 | @@ -116,7 +116,7 @@ | |||
2022 | 116 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 116 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
2023 | 117 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 117 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
2024 | 118 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 118 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
2026 | 119 | cart2frac.o: sys.o | 119 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
2027 | 120 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 120 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
2028 | 121 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 121 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
2029 | 122 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 122 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
2030 | @@ -128,6 +128,8 @@ | |||
2031 | 128 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 128 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
2032 | 129 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 129 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
2033 | 130 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 130 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
2034 | 131 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
2035 | 132 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
2036 | 131 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 133 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
2037 | 132 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 134 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2038 | 133 | chkdim.o: sys.o | 135 | chkdim.o: sys.o |
2039 | @@ -179,17 +181,17 @@ | |||
2040 | 179 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 181 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2041 | 180 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 182 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
2042 | 181 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 183 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
2044 | 182 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 184 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2045 | 183 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 185 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
2046 | 184 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 186 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2047 | 185 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 187 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
2048 | 186 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 188 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
2055 | 187 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 189 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
2056 | 188 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 190 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
2057 | 189 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 191 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
2058 | 190 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 192 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
2059 | 191 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 193 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
2060 | 192 | dhscf.o: vmat.o | 194 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
2061 | 193 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 195 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2062 | 194 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 196 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2063 | 195 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 197 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2064 | @@ -217,7 +219,7 @@ | |||
2065 | 217 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 219 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
2066 | 218 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 220 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
2067 | 219 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 221 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
2069 | 220 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 222 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
2070 | 221 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 223 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
2071 | 222 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 224 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
2072 | 223 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 225 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
2073 | @@ -226,6 +228,10 @@ | |||
2074 | 226 | elpa2.o: elpa1.o | 228 | elpa2.o: elpa1.o |
2075 | 227 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 229 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2076 | 228 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 230 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2077 | 231 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
2078 | 232 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
2079 | 233 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
2080 | 234 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
2081 | 229 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 235 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
2082 | 230 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 236 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
2083 | 231 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 237 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
2084 | @@ -266,9 +272,9 @@ | |||
2085 | 266 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 272 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
2086 | 267 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 273 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
2087 | 268 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 274 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
2091 | 269 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 275 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
2092 | 270 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 276 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2093 | 271 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 277 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
2094 | 272 | io.o: sys.o | 278 | io.o: sys.o |
2095 | 273 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 279 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
2096 | 274 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 280 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2097 | @@ -327,7 +333,9 @@ | |||
2098 | 327 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 333 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
2099 | 328 | m_energies.o: precision.o | 334 | m_energies.o: precision.o |
2100 | 329 | m_eo.o: precision.o | 335 | m_eo.o: precision.o |
2101 | 336 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
2102 | 330 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 337 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
2103 | 338 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
2104 | 331 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 339 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
2105 | 332 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 340 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
2106 | 333 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 341 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
2107 | @@ -349,10 +357,14 @@ | |||
2108 | 349 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 357 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
2109 | 350 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 358 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
2110 | 351 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 359 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
2111 | 360 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
2112 | 361 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
2113 | 362 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
2114 | 352 | m_integrate.o: precision.o | 363 | m_integrate.o: precision.o |
2115 | 353 | m_io.o: sys.o | 364 | m_io.o: sys.o |
2116 | 354 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 365 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
2117 | 355 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 366 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
2118 | 367 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
2119 | 356 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 368 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
2120 | 357 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 369 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
2121 | 358 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 370 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
2122 | @@ -360,9 +372,13 @@ | |||
2123 | 360 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 372 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2124 | 361 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 373 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
2125 | 362 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 374 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
2126 | 375 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
2127 | 376 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
2128 | 363 | m_kinetic.o: precision.o | 377 | m_kinetic.o: precision.o |
2129 | 364 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 378 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
2130 | 379 | m_matdiag.o: precision.o | ||
2131 | 365 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 380 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
2132 | 381 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
2133 | 366 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 382 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
2134 | 367 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 383 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
2135 | 368 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 384 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
2136 | @@ -410,6 +426,15 @@ | |||
2137 | 410 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 426 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
2138 | 411 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 427 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
2139 | 412 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 428 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
2140 | 429 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
2141 | 430 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
2142 | 431 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
2143 | 432 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
2144 | 433 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
2145 | 434 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
2146 | 435 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
2147 | 436 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
2148 | 437 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
2149 | 413 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 438 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
2150 | 414 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 439 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
2151 | 415 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 440 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
2152 | @@ -425,7 +450,8 @@ | |||
2153 | 425 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 450 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
2154 | 426 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 451 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
2155 | 427 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 452 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
2157 | 428 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 453 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
2158 | 454 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
2159 | 429 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 455 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
2160 | 430 | m_stress.o: precision.o | 456 | m_stress.o: precision.o |
2161 | 431 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 457 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
2162 | @@ -537,9 +563,10 @@ | |||
2163 | 537 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 563 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
2164 | 538 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 564 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
2165 | 539 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 565 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
2169 | 540 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 566 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
2170 | 541 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 567 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
2171 | 542 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 568 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
2172 | 569 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
2173 | 543 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 570 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
2174 | 544 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 571 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
2175 | 545 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 572 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
2176 | @@ -682,8 +709,8 @@ | |||
2177 | 682 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 709 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
2178 | 683 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 710 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
2179 | 684 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 711 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
2182 | 685 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 712 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
2183 | 686 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 713 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
2184 | 687 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 714 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
2185 | 688 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 715 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
2186 | 689 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 716 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
2187 | @@ -750,30 +777,32 @@ | |||
2188 | 750 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 777 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
2189 | 751 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 778 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
2190 | 752 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 779 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
2204 | 753 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 780 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
2205 | 754 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 781 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
2206 | 755 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 782 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
2207 | 756 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 783 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
2208 | 757 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 784 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
2209 | 758 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 785 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
2210 | 759 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 786 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
2211 | 760 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 787 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
2212 | 761 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 788 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
2213 | 762 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 789 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
2214 | 763 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 790 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
2215 | 764 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 791 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
2216 | 765 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 792 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
2217 | 793 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
2218 | 794 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
2219 | 766 | siesta_geom.o: precision.o | 795 | siesta_geom.o: precision.o |
2220 | 767 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 796 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
2221 | 768 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 797 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
2222 | 769 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 798 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
2223 | 770 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 799 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
2230 | 771 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 800 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
2231 | 772 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 801 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
2232 | 773 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 802 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
2233 | 774 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 803 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
2234 | 775 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 804 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
2235 | 776 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 805 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
2236 | 777 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 806 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
2237 | 778 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 807 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
2238 | 779 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 808 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
2239 | @@ -805,18 +834,17 @@ | |||
2240 | 805 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 834 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
2241 | 806 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 835 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
2242 | 807 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 836 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
2246 | 808 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 837 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
2247 | 809 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 838 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
2248 | 810 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 839 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
2249 | 811 | sys.o: parallel.o | 840 | sys.o: parallel.o |
2250 | 812 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 841 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
2251 | 813 | timer.o: timer_tree.o | 842 | timer.o: timer_tree.o |
2252 | 814 | timer_tree.o: m_walltime.o | 843 | timer_tree.o: m_walltime.o |
2253 | 815 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 844 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2258 | 816 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 845 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
2259 | 817 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 846 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
2260 | 818 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 847 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
2257 | 819 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
2261 | 820 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 848 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
2262 | 821 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 849 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
2263 | 822 | typecell.o: precision.o | 850 | typecell.o: precision.o |
2264 | @@ -828,6 +856,7 @@ | |||
2265 | 828 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 856 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
2266 | 829 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 857 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
2267 | 830 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 858 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
2268 | 859 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
2269 | 831 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 860 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
2270 | 832 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 861 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2271 | 833 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 862 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
2272 | @@ -948,6 +977,7 @@ | |||
2273 | 948 | m_ksv.o: ksv.o | 977 | m_ksv.o: ksv.o |
2274 | 949 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 978 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
2275 | 950 | m_ldau.o: ldau.o | 979 | m_ldau.o: ldau.o |
2276 | 980 | m_linpack.o: linpack.o | ||
2277 | 951 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 981 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
2278 | 952 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 982 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
2279 | 953 | m_minvec.o: minvec.o | 983 | m_minvec.o: minvec.o |
2280 | @@ -992,6 +1022,8 @@ | |||
2281 | 992 | m_vmat.o: vmat.o | 1022 | m_vmat.o: vmat.o |
2282 | 993 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1023 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
2283 | 994 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1024 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
2284 | 1025 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
2285 | 1026 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
2286 | 995 | mtprng.o: m_uuid.o | 1027 | mtprng.o: m_uuid.o |
2287 | 996 | neighbour.o: mneighb.o | 1028 | neighbour.o: mneighb.o |
2288 | 997 | on_core.o: onmod.o | 1029 | on_core.o: onmod.o |
2289 | 998 | 1030 | ||
2290 | === modified file 'Util/TS/TBtrans/Makefile' | |||
2291 | --- Util/TS/TBtrans/Makefile 2016-10-10 13:00:00 +0000 | |||
2292 | +++ Util/TS/TBtrans/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
2293 | @@ -364,6 +364,8 @@ | |||
2294 | 364 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 364 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
2295 | 365 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 365 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
2296 | 366 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 366 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
2297 | 367 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
2298 | 368 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
2299 | 367 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 369 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
2300 | 368 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 370 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2301 | 369 | chkdim.o: sys.o | 371 | chkdim.o: sys.o |
2302 | @@ -420,12 +422,12 @@ | |||
2303 | 420 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 422 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2304 | 421 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 423 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
2305 | 422 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 424 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
2312 | 423 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 425 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
2313 | 424 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 426 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
2314 | 425 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 427 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
2315 | 426 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 428 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
2316 | 427 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 429 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
2317 | 428 | dhscf.o: vmat.o | 430 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
2318 | 429 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 431 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2319 | 430 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 432 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2320 | 431 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 433 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2321 | @@ -453,7 +455,7 @@ | |||
2322 | 453 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 455 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
2323 | 454 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 456 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
2324 | 455 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 457 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
2326 | 456 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 458 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
2327 | 457 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 459 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
2328 | 458 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 460 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
2329 | 459 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 461 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
2330 | @@ -462,6 +464,10 @@ | |||
2331 | 462 | elpa2.o: elpa1.o | 464 | elpa2.o: elpa1.o |
2332 | 463 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 465 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2333 | 464 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 466 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2334 | 467 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
2335 | 468 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
2336 | 469 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
2337 | 470 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
2338 | 465 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 471 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
2339 | 466 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 472 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
2340 | 467 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 473 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
2341 | @@ -502,9 +508,9 @@ | |||
2342 | 502 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 508 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
2343 | 503 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 509 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
2344 | 504 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 510 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
2348 | 505 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 511 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
2349 | 506 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 512 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2350 | 507 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 513 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
2351 | 508 | io.o: sys.o | 514 | io.o: sys.o |
2352 | 509 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 515 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
2353 | 510 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 516 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2354 | @@ -563,7 +569,9 @@ | |||
2355 | 563 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 569 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
2356 | 564 | m_energies.o: precision.o | 570 | m_energies.o: precision.o |
2357 | 565 | m_eo.o: precision.o | 571 | m_eo.o: precision.o |
2358 | 572 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
2359 | 566 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 573 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
2360 | 574 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
2361 | 567 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 575 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
2362 | 568 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 576 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
2363 | 569 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 577 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
2364 | @@ -585,10 +593,14 @@ | |||
2365 | 585 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 593 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
2366 | 586 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 594 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
2367 | 587 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 595 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
2368 | 596 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
2369 | 597 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
2370 | 598 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
2371 | 588 | m_integrate.o: precision.o | 599 | m_integrate.o: precision.o |
2372 | 589 | m_io.o: sys.o | 600 | m_io.o: sys.o |
2373 | 590 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 601 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
2374 | 591 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 602 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
2375 | 603 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
2376 | 592 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 604 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
2377 | 593 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 605 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
2378 | 594 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 606 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
2379 | @@ -596,9 +608,13 @@ | |||
2380 | 596 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 608 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2381 | 597 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 609 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
2382 | 598 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 610 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
2383 | 611 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
2384 | 612 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
2385 | 599 | m_kinetic.o: precision.o | 613 | m_kinetic.o: precision.o |
2386 | 600 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 614 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
2387 | 615 | m_matdiag.o: precision.o | ||
2388 | 601 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 616 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
2389 | 617 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
2390 | 602 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 618 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
2391 | 603 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 619 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
2392 | 604 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 620 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
2393 | @@ -646,6 +662,15 @@ | |||
2394 | 646 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 662 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
2395 | 647 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 663 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
2396 | 648 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 664 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
2397 | 665 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
2398 | 666 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
2399 | 667 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
2400 | 668 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
2401 | 669 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
2402 | 670 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
2403 | 671 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
2404 | 672 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
2405 | 673 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
2406 | 649 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 674 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
2407 | 650 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 675 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
2408 | 651 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 676 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
2409 | @@ -988,30 +1013,32 @@ | |||
2410 | 988 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 1013 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
2411 | 989 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 1014 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
2412 | 990 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 1015 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
2426 | 991 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 1016 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
2427 | 992 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 1017 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
2428 | 993 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 1018 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
2429 | 994 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 1019 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
2430 | 995 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 1020 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
2431 | 996 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 1021 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
2432 | 997 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 1022 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
2433 | 998 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 1023 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
2434 | 999 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 1024 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
2435 | 1000 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 1025 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
2436 | 1001 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 1026 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
2437 | 1002 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 1027 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
2438 | 1003 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 1028 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
2439 | 1029 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
2440 | 1030 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
2441 | 1004 | siesta_geom.o: precision.o | 1031 | siesta_geom.o: precision.o |
2442 | 1005 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 1032 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
2443 | 1006 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 1033 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
2444 | 1007 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 1034 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
2445 | 1008 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 1035 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
2452 | 1009 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 1036 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
2453 | 1010 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 1037 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
2454 | 1011 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 1038 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
2455 | 1012 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 1039 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
2456 | 1013 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 1040 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
2457 | 1014 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 1041 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
2458 | 1015 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 1042 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
2459 | 1016 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 1043 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
2460 | 1017 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 1044 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
2461 | @@ -1043,9 +1070,9 @@ | |||
2462 | 1043 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 1070 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
2463 | 1044 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 1071 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
2464 | 1045 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 1072 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
2468 | 1046 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 1073 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
2469 | 1047 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 1074 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
2470 | 1048 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 1075 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
2471 | 1049 | sys.o: parallel.o | 1076 | sys.o: parallel.o |
2472 | 1050 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 1077 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
2473 | 1051 | timer.o: timer_tree.o | 1078 | timer.o: timer_tree.o |
2474 | @@ -1065,6 +1092,7 @@ | |||
2475 | 1065 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 1092 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
2476 | 1066 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 1093 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
2477 | 1067 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 1094 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
2478 | 1095 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
2479 | 1068 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 1096 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
2480 | 1069 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 1097 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2481 | 1070 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 1098 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
2482 | @@ -1310,6 +1338,8 @@ | |||
2483 | 1310 | m_vmat.o: vmat.o | 1338 | m_vmat.o: vmat.o |
2484 | 1311 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1339 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
2485 | 1312 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1340 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
2486 | 1341 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
2487 | 1342 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
2488 | 1313 | mtprng.o: m_uuid.o | 1343 | mtprng.o: m_uuid.o |
2489 | 1314 | neighbour.o: mneighb.o | 1344 | neighbour.o: mneighb.o |
2490 | 1315 | on_core.o: onmod.o | 1345 | on_core.o: onmod.o |
2491 | 1316 | 1346 | ||
2492 | === modified file 'Util/TS/ts2ts/Makefile' | |||
2493 | --- Util/TS/ts2ts/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
2494 | +++ Util/TS/ts2ts/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
2495 | @@ -111,7 +111,7 @@ | |||
2496 | 111 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 111 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
2497 | 112 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 112 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
2498 | 113 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 113 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
2500 | 114 | cart2frac.o: sys.o | 114 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
2501 | 115 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 115 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
2502 | 116 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 116 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
2503 | 117 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 117 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
2504 | @@ -123,6 +123,8 @@ | |||
2505 | 123 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 123 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
2506 | 124 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 124 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
2507 | 125 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 125 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
2508 | 126 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
2509 | 127 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
2510 | 126 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 128 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
2511 | 127 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 129 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2512 | 128 | chkdim.o: sys.o | 130 | chkdim.o: sys.o |
2513 | @@ -179,17 +181,17 @@ | |||
2514 | 179 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 181 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2515 | 180 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 182 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
2516 | 181 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 183 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
2518 | 182 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 184 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2519 | 183 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 185 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
2520 | 184 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 186 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2521 | 185 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 187 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
2522 | 186 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 188 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
2529 | 187 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 189 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
2530 | 188 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 190 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
2531 | 189 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 191 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
2532 | 190 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 192 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
2533 | 191 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 193 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
2534 | 192 | dhscf.o: vmat.o | 194 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
2535 | 193 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 195 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2536 | 194 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 196 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2537 | 195 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 197 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2538 | @@ -217,7 +219,7 @@ | |||
2539 | 217 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 219 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
2540 | 218 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 220 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
2541 | 219 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 221 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
2543 | 220 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 222 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
2544 | 221 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 223 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
2545 | 222 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 224 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
2546 | 223 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 225 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
2547 | @@ -226,6 +228,10 @@ | |||
2548 | 226 | elpa2.o: elpa1.o | 228 | elpa2.o: elpa1.o |
2549 | 227 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 229 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2550 | 228 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 230 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2551 | 231 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
2552 | 232 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
2553 | 233 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
2554 | 234 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
2555 | 229 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 235 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
2556 | 230 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 236 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
2557 | 231 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 237 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
2558 | @@ -266,9 +272,9 @@ | |||
2559 | 266 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 272 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
2560 | 267 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 273 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
2561 | 268 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 274 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
2565 | 269 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 275 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
2566 | 270 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 276 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2567 | 271 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 277 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
2568 | 272 | io.o: sys.o | 278 | io.o: sys.o |
2569 | 273 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 279 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
2570 | 274 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 280 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2571 | @@ -327,7 +333,9 @@ | |||
2572 | 327 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 333 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
2573 | 328 | m_energies.o: precision.o | 334 | m_energies.o: precision.o |
2574 | 329 | m_eo.o: precision.o | 335 | m_eo.o: precision.o |
2575 | 336 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
2576 | 330 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 337 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
2577 | 338 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
2578 | 331 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 339 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
2579 | 332 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 340 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
2580 | 333 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 341 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
2581 | @@ -349,10 +357,14 @@ | |||
2582 | 349 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 357 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
2583 | 350 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 358 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
2584 | 351 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 359 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
2585 | 360 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
2586 | 361 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
2587 | 362 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
2588 | 352 | m_integrate.o: precision.o | 363 | m_integrate.o: precision.o |
2589 | 353 | m_io.o: sys.o | 364 | m_io.o: sys.o |
2590 | 354 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 365 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
2591 | 355 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 366 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
2592 | 367 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
2593 | 356 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 368 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
2594 | 357 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 369 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
2595 | 358 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 370 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
2596 | @@ -360,9 +372,13 @@ | |||
2597 | 360 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 372 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2598 | 361 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 373 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
2599 | 362 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 374 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
2600 | 375 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
2601 | 376 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
2602 | 363 | m_kinetic.o: precision.o | 377 | m_kinetic.o: precision.o |
2603 | 364 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 378 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
2604 | 379 | m_matdiag.o: precision.o | ||
2605 | 365 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 380 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
2606 | 381 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
2607 | 366 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 382 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
2608 | 367 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 383 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
2609 | 368 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 384 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
2610 | @@ -410,6 +426,15 @@ | |||
2611 | 410 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 426 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
2612 | 411 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 427 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
2613 | 412 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 428 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
2614 | 429 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
2615 | 430 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
2616 | 431 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
2617 | 432 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
2618 | 433 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
2619 | 434 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
2620 | 435 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
2621 | 436 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
2622 | 437 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
2623 | 413 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 438 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
2624 | 414 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 439 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
2625 | 415 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 440 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
2626 | @@ -425,7 +450,8 @@ | |||
2627 | 425 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 450 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
2628 | 426 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 451 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
2629 | 427 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 452 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
2631 | 428 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 453 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
2632 | 454 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
2633 | 429 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 455 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
2634 | 430 | m_stress.o: precision.o | 456 | m_stress.o: precision.o |
2635 | 431 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 457 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
2636 | @@ -537,9 +563,10 @@ | |||
2637 | 537 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 563 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
2638 | 538 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 564 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
2639 | 539 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 565 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
2643 | 540 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 566 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
2644 | 541 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 567 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
2645 | 542 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 568 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
2646 | 569 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
2647 | 543 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 570 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
2648 | 544 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 571 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
2649 | 545 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 572 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
2650 | @@ -682,8 +709,8 @@ | |||
2651 | 682 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 709 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
2652 | 683 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 710 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
2653 | 684 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 711 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
2656 | 685 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 712 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
2657 | 686 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 713 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
2658 | 687 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 714 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
2659 | 688 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 715 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
2660 | 689 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 716 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
2661 | @@ -750,30 +777,32 @@ | |||
2662 | 750 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 777 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
2663 | 751 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 778 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
2664 | 752 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 779 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
2678 | 753 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 780 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
2679 | 754 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 781 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
2680 | 755 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 782 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
2681 | 756 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 783 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
2682 | 757 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 784 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
2683 | 758 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 785 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
2684 | 759 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 786 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
2685 | 760 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 787 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
2686 | 761 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 788 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
2687 | 762 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 789 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
2688 | 763 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 790 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
2689 | 764 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 791 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
2690 | 765 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 792 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
2691 | 793 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
2692 | 794 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
2693 | 766 | siesta_geom.o: precision.o | 795 | siesta_geom.o: precision.o |
2694 | 767 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 796 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
2695 | 768 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 797 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
2696 | 769 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 798 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
2697 | 770 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 799 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
2704 | 771 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 800 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
2705 | 772 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 801 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
2706 | 773 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 802 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
2707 | 774 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 803 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
2708 | 775 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 804 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
2709 | 776 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 805 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
2710 | 777 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 806 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
2711 | 778 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 807 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
2712 | 779 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 808 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
2713 | @@ -805,18 +834,17 @@ | |||
2714 | 805 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 834 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
2715 | 806 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 835 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
2716 | 807 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 836 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
2720 | 808 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 837 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
2721 | 809 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 838 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
2722 | 810 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 839 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
2723 | 811 | sys.o: parallel.o | 840 | sys.o: parallel.o |
2724 | 812 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 841 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
2725 | 813 | timer.o: timer_tree.o | 842 | timer.o: timer_tree.o |
2726 | 814 | timer_tree.o: m_walltime.o | 843 | timer_tree.o: m_walltime.o |
2727 | 815 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 844 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2732 | 816 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 845 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
2733 | 817 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 846 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
2734 | 818 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 847 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
2731 | 819 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
2735 | 820 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 848 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
2736 | 821 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 849 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
2737 | 822 | typecell.o: precision.o | 850 | typecell.o: precision.o |
2738 | @@ -828,6 +856,7 @@ | |||
2739 | 828 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 856 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
2740 | 829 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 857 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
2741 | 830 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 858 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
2742 | 859 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
2743 | 831 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 860 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
2744 | 832 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 861 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2745 | 833 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 862 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
2746 | @@ -945,6 +974,7 @@ | |||
2747 | 945 | m_ksv.o: ksv.o | 974 | m_ksv.o: ksv.o |
2748 | 946 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 975 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
2749 | 947 | m_ldau.o: ldau.o | 976 | m_ldau.o: ldau.o |
2750 | 977 | m_linpack.o: linpack.o | ||
2751 | 948 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 978 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
2752 | 949 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 979 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
2753 | 950 | m_minvec.o: minvec.o | 980 | m_minvec.o: minvec.o |
2754 | @@ -989,6 +1019,8 @@ | |||
2755 | 989 | m_vmat.o: vmat.o | 1019 | m_vmat.o: vmat.o |
2756 | 990 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1020 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
2757 | 991 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1021 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
2758 | 1022 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
2759 | 1023 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
2760 | 992 | mtprng.o: m_uuid.o | 1024 | mtprng.o: m_uuid.o |
2761 | 993 | neighbour.o: mneighb.o | 1025 | neighbour.o: mneighb.o |
2762 | 994 | on_core.o: onmod.o | 1026 | on_core.o: onmod.o |
2763 | 995 | 1027 | ||
2764 | === modified file 'Util/TS/tshs2tshs/Makefile' | |||
2765 | --- Util/TS/tshs2tshs/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
2766 | +++ Util/TS/tshs2tshs/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
2767 | @@ -169,7 +169,7 @@ | |||
2768 | 169 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 169 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
2769 | 170 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 170 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
2770 | 171 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 171 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
2772 | 172 | cart2frac.o: sys.o | 172 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
2773 | 173 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 173 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
2774 | 174 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 174 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
2775 | 175 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 175 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
2776 | @@ -181,6 +181,8 @@ | |||
2777 | 181 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 181 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
2778 | 182 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 182 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
2779 | 183 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 183 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
2780 | 184 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
2781 | 185 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
2782 | 184 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 186 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
2783 | 185 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 187 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2784 | 186 | chkdim.o: sys.o | 188 | chkdim.o: sys.o |
2785 | @@ -237,17 +239,17 @@ | |||
2786 | 237 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 239 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2787 | 238 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 240 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
2788 | 239 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 241 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
2790 | 240 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 242 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2791 | 241 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 243 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
2792 | 242 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 244 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2793 | 243 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 245 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
2794 | 244 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 246 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
2801 | 245 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 247 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
2802 | 246 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 248 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
2803 | 247 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 249 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
2804 | 248 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 250 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
2805 | 249 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 251 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
2806 | 250 | dhscf.o: vmat.o | 252 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
2807 | 251 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 253 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2808 | 252 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 254 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2809 | 253 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 255 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2810 | @@ -275,7 +277,7 @@ | |||
2811 | 275 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 277 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
2812 | 276 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 278 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
2813 | 277 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 279 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
2815 | 278 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 280 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
2816 | 279 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 281 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
2817 | 280 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 282 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
2818 | 281 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 283 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
2819 | @@ -284,6 +286,10 @@ | |||
2820 | 284 | elpa2.o: elpa1.o | 286 | elpa2.o: elpa1.o |
2821 | 285 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 287 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2822 | 286 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 288 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
2823 | 289 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
2824 | 290 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
2825 | 291 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
2826 | 292 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
2827 | 287 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 293 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
2828 | 288 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 294 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
2829 | 289 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 295 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
2830 | @@ -324,9 +330,9 @@ | |||
2831 | 324 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 330 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
2832 | 325 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 331 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
2833 | 326 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 332 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
2837 | 327 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 333 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
2838 | 328 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 334 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
2839 | 329 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 335 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
2840 | 330 | io.o: sys.o | 336 | io.o: sys.o |
2841 | 331 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 337 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
2842 | 332 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 338 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2843 | @@ -385,7 +391,9 @@ | |||
2844 | 385 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 391 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
2845 | 386 | m_energies.o: precision.o | 392 | m_energies.o: precision.o |
2846 | 387 | m_eo.o: precision.o | 393 | m_eo.o: precision.o |
2847 | 394 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
2848 | 388 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 395 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
2849 | 396 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
2850 | 389 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 397 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
2851 | 390 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 398 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
2852 | 391 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 399 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
2853 | @@ -407,10 +415,14 @@ | |||
2854 | 407 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 415 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
2855 | 408 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 416 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
2856 | 409 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 417 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
2857 | 418 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
2858 | 419 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
2859 | 420 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
2860 | 410 | m_integrate.o: precision.o | 421 | m_integrate.o: precision.o |
2861 | 411 | m_io.o: sys.o | 422 | m_io.o: sys.o |
2862 | 412 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 423 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
2863 | 413 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 424 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
2864 | 425 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
2865 | 414 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 426 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
2866 | 415 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 427 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
2867 | 416 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 428 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
2868 | @@ -418,9 +430,13 @@ | |||
2869 | 418 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 430 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
2870 | 419 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 431 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
2871 | 420 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 432 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
2872 | 433 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
2873 | 434 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
2874 | 421 | m_kinetic.o: precision.o | 435 | m_kinetic.o: precision.o |
2875 | 422 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 436 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
2876 | 437 | m_matdiag.o: precision.o | ||
2877 | 423 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 438 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
2878 | 439 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
2879 | 424 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 440 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
2880 | 425 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 441 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
2881 | 426 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 442 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
2882 | @@ -468,6 +484,15 @@ | |||
2883 | 468 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 484 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
2884 | 469 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 485 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
2885 | 470 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 486 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
2886 | 487 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
2887 | 488 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
2888 | 489 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
2889 | 490 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
2890 | 491 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
2891 | 492 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
2892 | 493 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
2893 | 494 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
2894 | 495 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
2895 | 471 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 496 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
2896 | 472 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 497 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
2897 | 473 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 498 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
2898 | @@ -483,7 +508,8 @@ | |||
2899 | 483 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 508 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
2900 | 484 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 509 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
2901 | 485 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 510 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
2903 | 486 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 511 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
2904 | 512 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
2905 | 487 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 513 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
2906 | 488 | m_stress.o: precision.o | 514 | m_stress.o: precision.o |
2907 | 489 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 515 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
2908 | @@ -595,9 +621,10 @@ | |||
2909 | 595 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 621 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
2910 | 596 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 622 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
2911 | 597 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 623 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
2915 | 598 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 624 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
2916 | 599 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 625 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
2917 | 600 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 626 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
2918 | 627 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
2919 | 601 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 628 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
2920 | 602 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 629 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
2921 | 603 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 630 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
2922 | @@ -740,8 +767,8 @@ | |||
2923 | 740 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 767 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
2924 | 741 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 768 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
2925 | 742 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 769 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
2928 | 743 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 770 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
2929 | 744 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 771 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
2930 | 745 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 772 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
2931 | 746 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 773 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
2932 | 747 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 774 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
2933 | @@ -808,30 +835,32 @@ | |||
2934 | 808 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 835 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
2935 | 809 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 836 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
2936 | 810 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 837 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
2950 | 811 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 838 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
2951 | 812 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 839 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
2952 | 813 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 840 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
2953 | 814 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 841 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
2954 | 815 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 842 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
2955 | 816 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 843 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
2956 | 817 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 844 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
2957 | 818 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 845 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
2958 | 819 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 846 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
2959 | 820 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 847 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
2960 | 821 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 848 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
2961 | 822 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 849 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
2962 | 823 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 850 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
2963 | 851 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
2964 | 852 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
2965 | 824 | siesta_geom.o: precision.o | 853 | siesta_geom.o: precision.o |
2966 | 825 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 854 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
2967 | 826 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 855 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
2968 | 827 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 856 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
2969 | 828 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 857 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
2976 | 829 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 858 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
2977 | 830 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 859 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
2978 | 831 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 860 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
2979 | 832 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 861 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
2980 | 833 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 862 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
2981 | 834 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 863 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
2982 | 835 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 864 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
2983 | 836 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 865 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
2984 | 837 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 866 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
2985 | @@ -863,18 +892,17 @@ | |||
2986 | 863 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 892 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
2987 | 864 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 893 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
2988 | 865 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 894 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
2992 | 866 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 895 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
2993 | 867 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 896 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
2994 | 868 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 897 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
2995 | 869 | sys.o: parallel.o | 898 | sys.o: parallel.o |
2996 | 870 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 899 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
2997 | 871 | timer.o: timer_tree.o | 900 | timer.o: timer_tree.o |
2998 | 872 | timer_tree.o: m_walltime.o | 901 | timer_tree.o: m_walltime.o |
2999 | 873 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 902 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3004 | 874 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 903 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
3005 | 875 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 904 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
3006 | 876 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 905 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
3003 | 877 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
3007 | 878 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 906 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
3008 | 879 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 907 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
3009 | 880 | typecell.o: precision.o | 908 | typecell.o: precision.o |
3010 | @@ -886,6 +914,7 @@ | |||
3011 | 886 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 914 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
3012 | 887 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 915 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
3013 | 888 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 916 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
3014 | 917 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
3015 | 889 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 918 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
3016 | 890 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 919 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
3017 | 891 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 920 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
3018 | @@ -1007,6 +1036,7 @@ | |||
3019 | 1007 | m_ksv.o: ksv.o | 1036 | m_ksv.o: ksv.o |
3020 | 1008 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 1037 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
3021 | 1009 | m_ldau.o: ldau.o | 1038 | m_ldau.o: ldau.o |
3022 | 1039 | m_linpack.o: linpack.o | ||
3023 | 1010 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 1040 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
3024 | 1011 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 1041 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
3025 | 1012 | m_minvec.o: minvec.o | 1042 | m_minvec.o: minvec.o |
3026 | @@ -1051,6 +1081,8 @@ | |||
3027 | 1051 | m_vmat.o: vmat.o | 1081 | m_vmat.o: vmat.o |
3028 | 1052 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1082 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
3029 | 1053 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1083 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
3030 | 1084 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
3031 | 1085 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
3032 | 1054 | mtprng.o: m_uuid.o | 1086 | mtprng.o: m_uuid.o |
3033 | 1055 | neighbour.o: mneighb.o | 1087 | neighbour.o: mneighb.o |
3034 | 1056 | on_core.o: onmod.o | 1088 | on_core.o: onmod.o |
3035 | 1057 | 1089 | ||
3036 | === modified file 'Util/VCA/Makefile' | |||
3037 | --- Util/VCA/Makefile 2016-08-30 14:02:33 +0000 | |||
3038 | +++ Util/VCA/Makefile 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
3039 | @@ -142,7 +142,7 @@ | |||
3040 | 142 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o | 142 | bsc_cellxc.o: alloc.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o mesh.o moremeshsubs.o parallel.o |
3041 | 143 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o | 143 | bsc_cellxc.o: parallelsubs.o precision.o sys.o |
3042 | 144 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o | 144 | bsc_xcmod.o: parallel.o precision.o sys.o |
3044 | 145 | cart2frac.o: sys.o | 145 | cart2frac.o: precision.o sys.o |
3045 | 146 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 146 | cdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
3046 | 147 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 147 | cell_broyden_optim.o: m_broyddj_nocomm.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
3047 | 148 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o | 148 | cell_broyden_optim.o: zmatrix.o |
3048 | @@ -154,6 +154,8 @@ | |||
3049 | 154 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o | 154 | cgvc_zmatrix.o: alloc.o conjgr.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o sys.o |
3050 | 155 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o | 155 | cgvc_zmatrix.o: units.o zmatrix.o |
3051 | 156 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o | 156 | cgwf.o: egandd.o onmod.o parallel.o precision.o sys.o |
3052 | 157 | changebasis.o: alloc.o m_matdiag.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | ||
3053 | 158 | changebasis.o: sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
3054 | 157 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o | 159 | chemical.o: parallel.o precision.o sys.o |
3055 | 158 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 160 | chempot.o: alloc.o mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3056 | 159 | chkdim.o: sys.o | 161 | chkdim.o: sys.o |
3057 | @@ -205,17 +207,17 @@ | |||
3058 | 205 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 207 | denmat.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
3059 | 206 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o | 208 | denmatlomem.o: alloc.o globalise.o onmod.o precision.o |
3060 | 207 | densematrix.o: alloc.o precision.o | 209 | densematrix.o: alloc.o precision.o |
3062 | 208 | detover.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 210 | detover.o: alloc.o linpack.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
3063 | 209 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o | 211 | dfscf.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o m_spin.o mesh.o |
3064 | 210 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 212 | dfscf.o: meshdscf.o meshphi.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3065 | 211 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o | 213 | dhscf.o: alloc.o atmfuncs.o bsc_xcmod.o cellxc_mod.o delk.o dfscf.o |
3066 | 212 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o | 214 | dhscf.o: doping_uniform.o files.o forhar.o iogrid_netcdf.o m_charge_add.o |
3073 | 213 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_mesh_node.o m_ncdf_io.o | 215 | dhscf.o: m_efield.o m_hartree_add.o m_iorho.o m_iotddft.o m_mesh_node.o |
3074 | 214 | dhscf.o: m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_rhog.o m_spin.o | 216 | dhscf.o: m_ncdf_io.o m_ncdf_siesta.o m_partial_charges.o m_poisson_fdf.o |
3075 | 215 | dhscf.o: m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o m_ts_options.o m_ts_tdir.o | 217 | dhscf.o: m_poisson_switch.o m_rhog.o m_spin.o m_ts_global_vars.o m_ts_hartree.o |
3076 | 216 | dhscf.o: m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o moremeshsubs.o parallel.o | 218 | dhscf.o: m_ts_options.o m_ts_tdir.o m_ts_voltage.o mesh.o meshdscf.o meshsubs.o |
3077 | 217 | dhscf.o: parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o siesta_options.o sys.o units.o | 219 | dhscf.o: moremeshsubs.o parallel.o parsing.o precision.o rhofft.o rhoofd.o |
3078 | 218 | dhscf.o: vmat.o | 220 | dhscf.o: siesta_options.o sys.o units.o vmat.o |
3079 | 219 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 221 | diag2g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3080 | 220 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 222 | diag2k.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3081 | 221 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 223 | diag3g.o: fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3082 | @@ -243,7 +245,7 @@ | |||
3083 | 243 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o | 245 | domain_decom.o: sparse_matrices.o sys.o |
3084 | 244 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o | 246 | doping_uniform.o: alloc.o m_ntm.o mesh.o parallel.o precision.o sys.o |
3085 | 245 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o | 247 | dynamics.o: alloc.o atomlist.o files.o ioxv.o m_mpi_utils.o parallel.o |
3087 | 246 | dynamics.o: precision.o sys.o units.o | 248 | dynamics.o: precision.o siesta_options.o sys.o units.o |
3088 | 247 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o | 249 | egandd.o: alloc.o denmat.o ener3.o globalise.o gradient.o on_subs.o onmod.o |
3089 | 248 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o | 250 | egandd.o: onmod.o precision.o sys.o |
3090 | 249 | eggbox.o: parallel.o precision.o | 251 | eggbox.o: parallel.o precision.o |
3091 | @@ -252,6 +254,10 @@ | |||
3092 | 252 | elpa2.o: elpa1.o | 254 | elpa2.o: elpa1.o |
3093 | 253 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 255 | ener3.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
3094 | 254 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o | 256 | ener3lomem.o: alloc.o globalise.o m_mpi_utils.o onmod.o precision.o |
3095 | 257 | evolg.o: alloc.o m_eo.o m_matswinvers.o m_steps.o parallel.o parallelsubs.o | ||
3096 | 258 | evolg.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o wavefunctions.o | ||
3097 | 259 | evolk.o: m_diagon_opt.o m_matswinvers.o parallel.o precision.o siesta_options.o | ||
3098 | 260 | evolk.o: sys.o wavefunctions.o | ||
3099 | 255 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o | 261 | extrapolateSpData2D.o: class_Data2D.o class_OrbitalDistribution.o |
3100 | 256 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 262 | extrapolateSpData2D.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
3101 | 257 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o | 263 | extrapolon.o: parallel.o precision.o sys.o |
3102 | @@ -292,9 +298,9 @@ | |||
3103 | 292 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o | 298 | initatom.o: atmparams.o atom.o atom_options.o basis_io.o basis_specs.o |
3104 | 293 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o | 299 | initatom.o: basis_types.o chemical.o electrostatic.o ldau_specs.o m_spin.o |
3105 | 294 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o | 300 | initatom.o: old_atmfuncs.o precision.o pseudopotential.o |
3109 | 295 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o parallel.o | 301 | initparallel.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o domain_decom.o |
3110 | 296 | initparallel.o: parallelsubs.o precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o | 302 | initparallel.o: m_poisson_fdf.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
3111 | 297 | initparallel.o: spatial.o sys.o | 303 | initparallel.o: siesta_options.o sparse_matrices.o spatial.o sys.o |
3112 | 298 | io.o: sys.o | 304 | io.o: sys.o |
3113 | 299 | iocg.o: files.o precision.o sys.o | 305 | iocg.o: files.o precision.o sys.o |
3114 | 300 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 306 | iodm.o: alloc.o files.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3115 | @@ -353,7 +359,9 @@ | |||
3116 | 353 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 359 | m_efield.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
3117 | 354 | m_energies.o: precision.o | 360 | m_energies.o: precision.o |
3118 | 355 | m_eo.o: precision.o | 361 | m_eo.o: precision.o |
3119 | 362 | m_evolve.o: alloc.o m_memory.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | ||
3120 | 356 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o | 363 | m_exp_coord.o: files.o m_os.o parallel.o precision.o units.o |
3121 | 364 | m_fastconv_dims.o: precision.o | ||
3122 | 357 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o | 365 | m_filter.o: bessph.o precision.o radfft.o sorting.o sys.o |
3123 | 358 | m_fire.o: parallel.o precision.o | 366 | m_fire.o: parallel.o precision.o |
3124 | 359 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 367 | m_fire_mixing.o: alloc.o m_fire_para.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
3125 | @@ -375,10 +383,14 @@ | |||
3126 | 375 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o | 383 | m_hs_matrix.o: alloc.o cellsubs.o geom_helper.o precision.o sys.o |
3127 | 376 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o | 384 | m_hsx.o: atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o files.o parallel.o parallelsubs.o |
3128 | 377 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | 385 | m_hsx.o: precision.o siesta_geom.o sys.o |
3129 | 386 | m_initwf.o: alloc.o densematrix.o fermid.o m_diagon_opt.o m_eo.o m_memory.o | ||
3130 | 387 | m_initwf.o: parallel.o parallelsubs.o precision.o sparse_matrices.o sys.o | ||
3131 | 388 | m_initwf.o: wavefunctions.o | ||
3132 | 378 | m_integrate.o: precision.o | 389 | m_integrate.o: precision.o |
3133 | 379 | m_io.o: sys.o | 390 | m_io.o: sys.o |
3134 | 380 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o | 391 | m_io_s.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o class_SpData2D.o |
3135 | 381 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o | 392 | m_io_s.o: class_Sparsity.o parallel.o precision.o |
3136 | 393 | m_iodipol.o: files.o m_dipol.o m_steps.o | ||
3137 | 382 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o | 394 | m_iodm.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o class_Sparsity.o |
3138 | 383 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o | 395 | m_iodm.o: m_io_s.o parallel.o |
3139 | 384 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o | 396 | m_iodm_old.o: alloc.o files.o m_matio.o m_mpi_utils.o parallel.o parallelsubs.o |
3140 | @@ -386,9 +398,13 @@ | |||
3141 | 386 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 398 | m_iorho.o: alloc.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3142 | 387 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o | 399 | m_iostruct.o: alloc.o files.o m_mpi_utils.o parallel.o precision.o |
3143 | 388 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o | 400 | m_iostruct.o: siesta_geom.o sys.o units.o |
3144 | 401 | m_iotddft.o: files.o m_dipol.o m_steps.o parallel.o siesta_options.o | ||
3145 | 402 | m_iotddft.o: wavefunctions.o | ||
3146 | 389 | m_kinetic.o: precision.o | 403 | m_kinetic.o: precision.o |
3147 | 390 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o | 404 | m_mat_invert.o: intrinsic_missing.o m_pivot_array.o precision.o |
3148 | 405 | m_matdiag.o: precision.o | ||
3149 | 391 | m_matio.o: alloc.o parallel.o | 406 | m_matio.o: alloc.o parallel.o |
3150 | 407 | m_matswinvers.o: precision.o | ||
3151 | 392 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o | 408 | m_memory.o: memoryinfo.o parallel.o sys.o |
3152 | 393 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o | 409 | m_mesh_node.o: intrinsic_missing.o parallel.o precision.o |
3153 | 394 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o | 410 | m_mixing.o: class_Data1D.o class_Fstack_Data1D.o parallel.o precision.o |
3154 | @@ -436,6 +452,15 @@ | |||
3155 | 436 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o | 452 | m_planewavematrix.o: atomlist.o dhscf.o m_planewavematrixvar.o precision.o |
3156 | 437 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o | 453 | m_planewavematrix.o: siesta_geom.o sparse_matrices.o |
3157 | 438 | m_planewavematrixvar.o: precision.o | 454 | m_planewavematrixvar.o: precision.o |
3158 | 455 | m_plot_1d_arr3d.o: precision.o | ||
3159 | 456 | m_poisson_fdf.o: m_char.o precision.o | ||
3160 | 457 | m_poisson_obc_comm.o: atm_types.o atmfuncs.o m_mpi_stop.o parallel.o | ||
3161 | 458 | m_poisson_obc_comm.o: precision.o siesta_geom.o sys.o | ||
3162 | 459 | m_poisson_obc_fastconv.o: cellsubs.o m_mpi_stop.o m_poisson_obc_fastconv_r2c.o | ||
3163 | 460 | m_poisson_obc_fastconv.o: parallel.o precision.o sys.o | ||
3164 | 461 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: cellsubs.o m_fastconv_dims.o m_plot_1d_arr3d.o | ||
3165 | 462 | m_poisson_obc_fastconv_r2c.o: m_poisson_obc_comm.o precision.o sys.o | ||
3166 | 463 | m_poisson_switch.o: m_poisson_obc_fastconv.o precision.o sys.o | ||
3167 | 439 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o | 464 | m_pulay.o: alloc.o atomlist.o m_mpi_utils.o m_spin.o m_svd.o parallel.o |
3168 | 440 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o | 465 | m_pulay.o: precision.o siesta_options.o sparse_matrices.o sys.o |
3169 | 441 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o | 466 | m_redist_spmatrix.o: alloc.o class_Distribution.o |
3170 | @@ -451,7 +476,8 @@ | |||
3171 | 451 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o | 476 | m_sparsity_handling.o: class_Data1D.o class_Data2D.o |
3172 | 452 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o | 477 | m_sparsity_handling.o: class_OrbitalDistribution.o class_SpData1D.o |
3173 | 453 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o | 478 | m_sparsity_handling.o: class_SpData2D.o class_Sparsity.o geom_helper.o |
3175 | 454 | m_sparsity_handling.o: m_interpolate.o m_region.o precision.o | 479 | m_sparsity_handling.o: intrinsic_missing.o m_interpolate.o m_region.o |
3176 | 480 | m_sparsity_handling.o: precision.o | ||
3177 | 455 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o | 481 | m_spin.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o units.o |
3178 | 456 | m_stress.o: precision.o | 482 | m_stress.o: precision.o |
3179 | 457 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o | 483 | m_supercell.o: atom_graph.o class_OrbitalDistribution.o class_SpData2D.o |
3180 | @@ -563,9 +589,10 @@ | |||
3181 | 563 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o | 589 | m_ts_options.o: m_ts_hartree.o m_ts_method.o m_ts_mumps_init.o m_ts_tdir.o |
3182 | 564 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o | 590 | m_ts_options.o: m_ts_weight.o parallel.o precision.o siesta_options.o units.o |
3183 | 565 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 591 | m_ts_pivot.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
3187 | 566 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o intrinsic_missing.o | 592 | m_ts_pivot.o: create_Sparsity_SC.o create_Sparsity_Union.o geom_helper.o |
3188 | 567 | m_ts_pivot.o: m_char.o m_pivot.o m_region.o m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o | 593 | m_ts_pivot.o: intrinsic_missing.o m_char.o m_pivot.o m_region.o |
3189 | 568 | m_ts_pivot.o: m_ts_electype.o parallel.o precision.o | 594 | m_ts_pivot.o: m_sparsity_handling.o m_ts_debug.o m_ts_electype.o parallel.o |
3190 | 595 | m_ts_pivot.o: precision.o | ||
3191 | 569 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o | 596 | m_ts_rgn2trimat.o: alloc.o class_OrbitalDistribution.o class_Sparsity.o |
3192 | 570 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o | 597 | m_ts_rgn2trimat.o: create_Sparsity_Union.o geom_helper.o m_region.o |
3193 | 571 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o | 598 | m_ts_rgn2trimat.o: m_ts_electype.o m_ts_method.o m_ts_tri_common.o parallel.o |
3194 | @@ -708,8 +735,8 @@ | |||
3195 | 708 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o | 735 | rdiag.o: alloc.o m_diagon_opt.o memoryinfo.o parallel.o precision.o sys.o |
3196 | 709 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o | 736 | rdiag_elpa.o: alloc.o elpa1.o elpa2.o parallel.o precision.o sys.o |
3197 | 710 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o | 737 | rdiag_mrrr.o: alloc.o parallel.o precision.o sys.o |
3200 | 711 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o m_spin.o | 738 | read_options.o: files.o m_charge_add.o m_cite.o m_hartree_add.o m_mixing_scf.o |
3201 | 712 | read_options.o: m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o | 739 | read_options.o: m_spin.o m_target_stress.o memoryinfo.o parallel.o precision.o |
3202 | 713 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o | 740 | read_options.o: siesta_cml.o siesta_options.o sys.o units.o |
3203 | 714 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o | 741 | read_xc_info.o: parallel.o precision.o sys.o |
3204 | 715 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o | 742 | readsp.o: parallel.o precision.o sys.o |
3205 | @@ -776,30 +803,32 @@ | |||
3206 | 776 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o | 803 | siesta_end.o: meshdscf.o meshphi.o moremeshsubs.o parallel.o siesta_cml.o |
3207 | 777 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o | 804 | siesta_end.o: siesta_cmlsubs.o siesta_master.o siesta_options.o |
3208 | 778 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o | 805 | siesta_end.o: sparse_matrices.o timestamp.o |
3222 | 779 | siesta_forces.o: atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o compute_dm.o | 806 | siesta_forces.o: alloc.o atomlist.o class_Fstack_Data1D.o class_SpData2D.o |
3223 | 780 | siesta_forces.o: compute_energies.o compute_max_diff.o files.o | 807 | siesta_forces.o: compute_dm.o compute_energies.o compute_max_diff.o |
3224 | 781 | siesta_forces.o: final_H_f_stress.o flook_siesta.o kpoint_grid.o | 808 | siesta_forces.o: densematrix.o files.o final_H_f_stress.o flook_siesta.o |
3225 | 782 | siesta_forces.o: m_convergence.o m_energies.o m_forces.o m_iodm_old.o | 809 | siesta_forces.o: kpoint_grid.o m_convergence.o m_energies.o m_eo.o m_evolve.o |
3226 | 783 | siesta_forces.o: m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o m_ncdf_siesta.o | 810 | siesta_forces.o: m_forces.o m_gamma.o m_initwf.o m_iodm.o m_iodm_old.o |
3227 | 784 | siesta_forces.o: m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o m_steps.o | 811 | siesta_forces.o: m_iotddft.o m_mixing.o m_mixing_scf.o m_mpi_utils.o |
3228 | 785 | siesta_forces.o: m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o m_ts_electype.o | 812 | siesta_forces.o: m_ncdf_siesta.o m_pexsi.o m_pexsi_driver.o m_rhog.o m_spin.o |
3229 | 786 | siesta_forces.o: m_ts_global_vars.o m_ts_method.o m_ts_options.o mixer.o | 813 | siesta_forces.o: m_steps.o m_stress.o m_transiesta.o m_ts_charge.o |
3230 | 787 | siesta_forces.o: parallel.o post_scf_work.o precision.o save_density_matrix.o | 814 | siesta_forces.o: m_ts_electype.o m_ts_global_vars.o m_ts_method.o |
3231 | 788 | siesta_forces.o: scfconvergence_test.o setup_H0.o setup_hamiltonian.o | 815 | siesta_forces.o: m_ts_options.o mixer.o overfsm.o parallel.o post_scf_work.o |
3232 | 789 | siesta_forces.o: siesta_cml.o siesta_dicts.o siesta_geom.o siesta_master.o | 816 | siesta_forces.o: precision.o save_density_matrix.o scfconvergence_test.o |
3233 | 790 | siesta_forces.o: siesta_options.o sparse_matrices.o state_analysis.o | 817 | siesta_forces.o: setup_H0.o setup_hamiltonian.o siesta_cml.o siesta_dicts.o |
3234 | 791 | siesta_forces.o: state_init.o sys.o units.o write_subs.o | 818 | siesta_forces.o: siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o |
3235 | 819 | siesta_forces.o: sparse_matrices.o state_analysis.o state_init.o sys.o units.o | ||
3236 | 820 | siesta_forces.o: wavefunctions.o write_subs.o | ||
3237 | 792 | siesta_geom.o: precision.o | 821 | siesta_geom.o: precision.o |
3238 | 793 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o | 822 | siesta_init.o: alloc.o atomlist.o bands.o bsc_xcmod.o |
3239 | 794 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o | 823 | siesta_init.o: class_Fstack_Pair_Geometry_SpData2D.o densematrix.o files.o |
3240 | 795 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o | 824 | siesta_init.o: flook_siesta.o ioxv.o kpoint_grid.o kpoint_pdos.o ksvinit.o |
3241 | 796 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o | 825 | siesta_init.o: m_cite.o m_energies.o m_eo.o m_fixed.o m_forces.o m_gamma.o |
3248 | 797 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_rmaxh.o m_spin.o | 826 | siesta_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_new_dm.o m_poisson_fdf.o m_rmaxh.o |
3249 | 798 | siesta_init.o: m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o metaforce.o | 827 | siesta_init.o: m_spin.o m_steps.o m_supercell.o m_timer.o m_wallclock.o |
3250 | 799 | siesta_init.o: molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o parallelsubs.o | 828 | siesta_init.o: metaforce.o molecularmechanics.o object_debug.o parallel.o |
3251 | 800 | siesta_init.o: projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o siesta_geom.o | 829 | siesta_init.o: parallelsubs.o projected_DOS.o siesta_cmlsubs.o siesta_dicts.o |
3252 | 801 | siesta_init.o: siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o sys.o timer.o | 830 | siesta_init.o: siesta_geom.o siesta_options.o sparse_matrices.o struct_init.o |
3253 | 802 | siesta_init.o: timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o | 831 | siesta_init.o: sys.o timer.o timestamp.o ts_init.o writewave.o zmatrix.o |
3254 | 803 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o | 832 | siesta_master.o: iopipes.o iosockets.o precision.o sys.o |
3255 | 804 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o | 833 | siesta_move.o: atomlist.o broyden_optim.o cell_broyden_optim.o |
3256 | 805 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o | 834 | siesta_move.o: cell_fire_optim.o dynamics.o fire_optim.o flook_siesta.o ioxv.o |
3257 | @@ -831,18 +860,17 @@ | |||
3258 | 831 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o | 860 | state_init.o: proximity_check.o siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_options.o |
3259 | 832 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o | 861 | state_init.o: sparse_matrices.o sys.o units.o write_subs.o zmatrix.o |
3260 | 833 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o | 862 | struct_init.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o files.o ioxv.o m_exp_coord.o |
3264 | 834 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_steps.o parallel.o periodic_table.o | 863 | struct_init.o: m_iostruct.o m_mpi_utils.o m_poisson_fdf.o m_poisson_obc_comm.o |
3265 | 835 | struct_init.o: siesta_cml.o siesta_geom.o siesta_master.o siesta_options.o | 864 | struct_init.o: m_steps.o parallel.o periodic_table.o siesta_cml.o siesta_geom.o |
3266 | 836 | struct_init.o: units.o zmatrix.o | 865 | struct_init.o: siesta_master.o siesta_options.o units.o zmatrix.o |
3267 | 837 | sys.o: parallel.o | 866 | sys.o: parallel.o |
3268 | 838 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o | 867 | timer.o: extrae_eventllist.o extrae_module.o m_timer.o parallel.o sys.o |
3269 | 839 | timer.o: timer_tree.o | 868 | timer.o: timer_tree.o |
3270 | 840 | timer_tree.o: m_walltime.o | 869 | timer_tree.o: m_walltime.o |
3271 | 841 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o | 870 | transition_rate.o: alloc.o fermid.o parallel.o parallelsubs.o precision.o sys.o |
3276 | 842 | ts_init.o: m_cite.o m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o | 871 | ts_init.o: m_fixed.o m_os.o m_ts_cctype.o m_ts_charge.o m_ts_electrode.o |
3277 | 843 | ts_init.o: m_ts_electrode.o m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o | 872 | ts_init.o: m_ts_electype.o m_ts_gf.o m_ts_global_vars.o m_ts_kpoints.o |
3278 | 844 | ts_init.o: m_ts_kpoints.o m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o | 873 | ts_init.o: m_ts_method.o m_ts_options.o parallel.o siesta_options.o |
3275 | 845 | ts_init.o: siesta_options.o | ||
3279 | 846 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o | 874 | ts_show_regions.o: m_region.o m_ts_electype.o m_ts_method.o parallel.o |
3280 | 847 | ts_show_regions.o: precision.o units.o | 875 | ts_show_regions.o: precision.o units.o |
3281 | 848 | typecell.o: precision.o | 876 | typecell.o: precision.o |
3282 | @@ -854,6 +882,7 @@ | |||
3283 | 854 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o | 882 | vmatsp.o: alloc.o atm_types.o atmfuncs.o atomlist.o listsc.o mesh.o meshdscf.o |
3284 | 855 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o | 883 | vmatsp.o: meshphi.o precision.o |
3285 | 856 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o | 884 | vmb.o: m_fixed.o parallel.o precision.o sys.o |
3286 | 885 | wavefunctions.o: parallel.o precision.o | ||
3287 | 857 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o | 886 | write_inp_wannier.o: alloc.o atmfuncs.o atomlist.o m_ntm.o m_orderbands.o |
3288 | 858 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o | 887 | write_inp_wannier.o: mneighb.o parallel.o parallelsubs.o precision.o |
3289 | 859 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o | 888 | write_inp_wannier.o: siesta2wannier90.o siesta_geom.o |
3290 | @@ -974,6 +1003,7 @@ | |||
3291 | 974 | m_ksv.o: ksv.o | 1003 | m_ksv.o: ksv.o |
3292 | 975 | m_ksvinit.o: ksvinit.o | 1004 | m_ksvinit.o: ksvinit.o |
3293 | 976 | m_ldau.o: ldau.o | 1005 | m_ldau.o: ldau.o |
3294 | 1006 | m_linpack.o: linpack.o | ||
3295 | 977 | m_local_dos.o: local_DOS.o | 1007 | m_local_dos.o: local_DOS.o |
3296 | 978 | m_matel_registry.o: matel_registry.o | 1008 | m_matel_registry.o: matel_registry.o |
3297 | 979 | m_minvec.o: minvec.o | 1009 | m_minvec.o: minvec.o |
3298 | @@ -1018,6 +1048,8 @@ | |||
3299 | 1018 | m_vmat.o: vmat.o | 1048 | m_vmat.o: vmat.o |
3300 | 1019 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o | 1049 | m_zm_broyden_optim.o: zm_broyden_optim.o |
3301 | 1020 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o | 1050 | m_zm_fire_optim.o: zm_fire_optim.o |
3302 | 1051 | matdiagon.o: m_matdiag.o | ||
3303 | 1052 | matswinversion.o: m_matswinvers.o | ||
3304 | 1021 | mtprng.o: m_uuid.o | 1053 | mtprng.o: m_uuid.o |
3305 | 1022 | neighbour.o: mneighb.o | 1054 | neighbour.o: mneighb.o |
3306 | 1023 | on_core.o: onmod.o | 1055 | on_core.o: onmod.o |
3307 | 1024 | 1056 | ||
3308 | === modified file 'version.info' | |||
3309 | --- version.info 2016-10-20 12:18:03 +0000 | |||
3310 | +++ version.info 2016-11-22 08:16:45 +0000 | |||
3311 | @@ -1,1 +1,1 @@ | |||
3313 | 1 | trunk-572--kovalp-manual-1 | 1 | trunk-572--kovalp-manual-1--npapior-1 |
It works as it should, thank you. I will try later to update other
Makefiles as well. Thank you.
Peter
On Tue, Nov 22, 2016 at 9:34 AM, <email address hidden> wrote:
> The proposal to merge lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes into /code.launchpad .net/~nickpapio r/siesta/ kovalp- fixes/+ merge/311468
> lp:~kovalp/siesta/siesta has been updated.
>
> Status: Needs review => Merged
>
> For more details, see:
> https:/
> --
> You are reviewing the proposed merge of lp:~nickpapior/siesta/kovalp-fixes
> into lp:~kovalp/siesta/siesta.
>